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9i7w

Extended and wrapped protein P7 dimers of dimers, the P1 layer and the RNA-dependent RNA polymerase P2 in transcribing particles of bacteriophage phi6

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RNA-directed RNA polymerase

物种未注明

UniProt P11124

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 13 DNA 1 ;DNA (5'-D(*TP*TP*TP*CP*C)-3') ; × 1 Nucleocapsid protein × 8 （Q283U0） Major inner protein P1 × 4 （P11126） 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1hhs 1hhs 1hhs 1hi1 1hi1 1hi1 1hi8 1hi8 1wac 1wac 1wac 2jl9

共 29 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1hht 1hht 1hht 1hi0 1hi0 1hi0 1uvi 1uvi 1uvi 1uvj 1uvj 1uvj

共 45 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RDRP_BPPH6
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–664； UniProt 2–665

Nucleocapsid protein

物种未注明

UniProt Q283U0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 13 DNA 1 ;DNA (5'-D(*TP*TP*TP*CP*C)-3') ; × 1 RNA-directed RNA polymerase × 1 （P11124） Major inner protein P1 × 4 （P11126） 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
9htw

共 1 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
9i7w

共 1 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q283U0_9VIRU
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 B； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 E； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 F； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 M； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 N； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 S； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112 作者链 T； PDB构建体 1–111； UniProt 2–112

Major inner protein P1

物种未注明

UniProt P11126

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 13 DNA 1 ;DNA (5'-D(*TP*TP*TP*CP*C)-3') ; × 1 RNA-directed RNA polymerase × 1 （P11124） Nucleocapsid protein × 8 （Q283U0） 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
4k7h 4k7h 4k7h 4k7h 4k7h

共 5 个 assembly

同源二聚体
4btg 4btg 4btq 4btq 5fj5 5fj5

共 6 个 assembly

同源四聚体
9i5c

共 1 个 assembly

其他同源多聚体
4btg 4btg 4btg 4btq 4btq 4btq 4k7h 5fj5 5fj5 5fj5

共 10 个 assembly

异源或核酸复合物
5fj7 5muu 5muu 5muu 5muu 5muu 6hy0 9hu4 9hu5 9hu6 9i7w

共 11 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P1_BPPH6
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–766； UniProt 1–766 作者链 W； PDB构建体 1–766； UniProt 1–766 作者链 X； PDB构建体 1–766； UniProt 1–766 作者链 Z； PDB构建体 1–766； UniProt 1–766

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9i7w
沉积日期 deposition_date2025-02-03
结构标题 titleExtended and wrapped protein P7 dimers of dimers, the P1 layer and the RNA-dependent RNA polymerase P2 in transcribing particles of bacteriophage phi6
关键词 keywordsinner protein capsid, transcribing phi6 particle, localized reconstruction, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9i7w__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9i7w__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9i7w__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）61.74 Å
Rg（电子密度）62.02 Å
总 Rg62.00 Å
原子数35915
残基数4612
排除体积640370 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9i7w__assembly_1__model_1 14-meric （14） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)