T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 | 链 a; UniProt 1–164 链 b; UniProt 1–164 | 未记录 | T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain × 1 (P04234) T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain × 2 (P07766) T cell receptor delta variable 2,T cell receptor delta constant × 1 (A0JD36,B7Z8K6) T cell receptor gamma variable 9,T cell receptor gamma constant 1 × 1 (Q99603,P0CF51) T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain × 1 (P09693) Fab light chain × 1 Fab heavy chain × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.69 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9JY0 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TCE SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE SHC SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYROSINE-PHOSPHORYLATED PEPTIDE FROM THE T-CELL RECEPTOR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
136–149(14 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1YGR Crystal structure of the tandem phosphatase domain of RPTP CD45 提交 2005-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
80–85(6 aa)
片段:ITAM-1 (residues 80-85; SWS:P20963)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;Sodium acetate, PEG 4000, Glycerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.312 |
| 1YGR Crystal structure of the tandem phosphatase domain of RPTP CD45 提交 2005-01-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
80–85(6 aa)
片段:ITAM-1 (residues 80-85; SWS:P20963)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;Sodium acetate, PEG 4000, Glycerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.312 |
| 2HAC Structure of Zeta-Zeta Transmembrane Dimer 提交 2006-06-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
28–60(33 aa)
片段:transmembrane region (28-60)
链 B
28–60(33 aa)
片段:transmembrane region (28-60)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)20 mM sodium phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成
0.5-1.0 mM disulfide crosslinked zeta-zeta dimer U-15N,U-13C,85%-2H. Sodium dodecyl sulfate (40 mM) and dodecyl phosphocholine (200 mM), 95% H2O, 5% D2O. | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5-1.0 mM disulfide crosslinked zeta-zeta dimer U-15N,U-13C. Sodium dodecyl sulfate (40 mM) and dodecyl phosphocholine (200 mM), 95% H2O, 5% D2O. | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5-1.0 mM disulfide crosslinked zeta-zeta dimer, mixed-label. One monomer: U-15N,U-2H. Other monomer: natural abundance isotopes. Sodium dodecyl sulfate (40 mM) and dodecyl phosphocholine (200 mM), 95% H2O, 5% D2O. | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5-1.0 mM disulfide crosslinked zeta-zeta dimer U-15N,U-13C. Sodium dodecyl sulfate (40 mM) and dodecyl phosphocholine (200 mM), 95% H2O, 5% D2O. 5% polyacrylamide gel. | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OQ1 Tandem SH2 domains of ZAP-70 with 19-mer zeta1 peptide 提交 2007-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
69–87(19 aa)
片段:residues 69-87
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PB LEAD (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;298 K;20%PEG 4000, 50mM sodium citrate,100 mM ammonium acetate, 20mM DTT, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.255 |
| 3IK5 SIVmac239 Nef in complex with TCR zeta ITAM 1 polypeptide (A63-R80) 提交 2009-08-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
63–80(18 aa)
片段:ITAM 1 polypeptide (A63-R80)
链 D
63–80(18 aa)
片段:ITAM 1 polypeptide (A63-R80)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;15% PEG 3350, 0.2mM ammonmium fluoride, 0.1mM hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.184 |
| 3IK5 SIVmac239 Nef in complex with TCR zeta ITAM 1 polypeptide (A63-R80) 提交 2009-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
63–80(18 aa)
片段:ITAM 1 polypeptide (A63-R80)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;15% PEG 3350, 0.2mM ammonmium fluoride, 0.1mM hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.184 |
| 3IK5 SIVmac239 Nef in complex with TCR zeta ITAM 1 polypeptide (A63-R80) 提交 2009-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
63–80(18 aa)
片段:ITAM 1 polypeptide (A63-R80)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;15% PEG 3350, 0.2mM ammonmium fluoride, 0.1mM hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.184 |
| 3IOZ SIVmac239 Nef in complex with a TCR zeta polypeptide DP1 (L51-D93) 提交 2009-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
51–93(43 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.2;277 K;15% PEG 3350, 0.15M KF, 0.1M hepes, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.329 |
| 6JXR Structure of human T cell receptor-CD3 complex 提交 2019-04-24 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.70 Å |
| 7FJD Cryo-EM structure of a membrane protein(WT) 提交 2021-08-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.20 Å |
| 7FJE Cryo-EM structure of a membrane protein(LL) 提交 2021-08-03 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.00 Å |
| 7FJF Cryo-EM structure of a membrane protein(CS) 提交 2021-08-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | C3S CHOLEST-5-EN-3-YL HYDROGEN SULFATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 7PHR Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I 提交 2021-08-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 Z
22–57(36 aa)
链 z
22–57(36 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 8ES7 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 complex 提交 2022-10-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 Y
1–164(164 aa)
链 Z
1–164(164 aa)
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8ES8 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 (230-239) 提交 2022-10-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 Y
1–164(164 aa)
链 Z
1–164(164 aa)
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 8ES9 CryoEM structure of PN45428 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 提交 2022-10-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 Y
1–164(164 aa)
链 Z
1–164(164 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8J8I Membrane-bound structure of CD3z cytoplasmic domain 提交 2023-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
25–164(140 aa)
|
突变:C8S, D12L,M72V,M95V,M104V,M134V | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 1
NMR样品组成
0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CD3zTMCD, 20 mM None Bis-Tris, 60 mM None POPG, 90 % None H2O, 10 % None D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8JC0 V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex in LMNG 提交 2023-05-10 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 A
1–164(164 aa)
链 B
1–164(164 aa)
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.50 Å |
| 8TW4 TCR in nanodisc ND-I 提交 2023-08-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 X
1–164(164 aa)
链 Y
1–164(164 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TW6 TCR in nanodisc ND-II 提交 2023-08-20 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 X
1–164(164 aa)
链 Y
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8WY0 T cell receptor delta 2 gamma 9 with F283A, F290A, and F291A 提交 2023-10-30 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8WYI T cell receptor delta 2 gamma 9 with TCRD TM domain chimera of TRAC 提交 2023-10-31 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8YC0 T cell receptor V delta2 V gamma9 in GDN 提交 2024-02-17 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.12 Å |
| 8ZA6 Cryo-EM structure of the gdTCR-CD3 complex 提交 2024-04-24 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.43 Å |
| 9BBC TCR GDN detergent micelle 提交 2024-04-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 X
1–164(164 aa)
链 Y
1–164(164 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9C3E TCR - CD3 complex bound to HLA 提交 2024-05-31 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 X
1–164(164 aa)
链 Y
1–164(164 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9CI8 T cell receptor complex 提交 2024-07-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 a
27–57(31 aa)
链 b
27–57(31 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Hepes buffer saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9CIA T cell receptor complex 提交 2024-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 a
27–55(29 aa)
链 b
27–55(29 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;HEPES buffer saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9CQ4 G115 gamma delta TCR/CD3 complex bound by OKT3 Fab 提交 2024-07-19 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 Y
1–164(164 aa)
链 Z
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 9IRS Cryo-EM structure of the TCR-OKT3 complex 提交 2024-07-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.18 Å |
| 9IRU Cryo-em structure of TCR-4B1 complex 提交 2024-07-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.14 Å |
| 9JXZ V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex 提交 2024-10-12 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 LPE 1-O-OCTADECYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9JY1 delta epsilon/delta epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–164(164 aa)
链 B
1–164(164 aa)
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9JY2 Fab-CD3-delta epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 a
26–56(31 aa)
链 b
26–56(31 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9JY3 delta epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric |
链 A
26–56(31 aa)
链 B
26–56(31 aa)
链 a
26–56(31 aa)
链 b
26–56(31 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9JY4 gamma epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–164(164 aa)
链 B
1–164(164 aa)
链 a
1–164(164 aa)
链 b
1–164(164 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
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| UniProt名称 | CD3Z_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 a; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 b; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 |