SAXSdb — 9lj1

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 5

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 90–698 链 B； UniProt 90–698 链 D； UniProt 90–698 链 G； UniProt 90–698	未记录	Calmodulin-3 × 4 （P0DP25） 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9LJ1	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6B8Q Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.5 (KCNQ5) AB domain complex 提交 2017-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 361–394（34 aa）链 A 530–564（35 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M magnesium formate, 20% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
6B8Q Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.5 (KCNQ5) AB domain complex 提交 2017-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 361–394（34 aa）链 C 530–564（35 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M magnesium formate, 20% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
6B8Q Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.5 (KCNQ5) AB domain complex 提交 2017-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 361–394（34 aa）链 E 530–564（35 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M magnesium formate, 20% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
6B8Q Crystal Structure of the Mg2+/CaM:Kv7.5 (KCNQ5) AB domain complex 提交 2017-10-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 361–394（34 aa）链 G 530–564（35 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M magnesium formate, 20% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
9J38 human KCNQ5-CaM in apo state 提交 2024-08-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 90–698（609 aa）链 B 90–698（609 aa）链 C 90–698（609 aa）链 D 90–698（609 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9LIZ Human KCNQ5-CaM in complex with PIP2 提交 2025-01-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 90–698（609 aa）链 B 90–698（609 aa）链 D 90–698（609 aa）链 G 90–698（609 aa）	未记录	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9LJ5 Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in an open conformation. 提交 2025-01-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 90–698（609 aa）链 B 90–698（609 aa）链 D 90–698（609 aa）链 G 90–698（609 aa）	未记录	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 8 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

共 4 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNQ5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–610； UniProt 90–698 作者链 B； PDB构建体 2–610； UniProt 90–698 作者链 D； PDB构建体 2–610； UniProt 90–698 作者链 G； PDB构建体 2–610； UniProt 90–698

Calmodulin-3

Homo sapiens

UniProt P0DP25

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–149 链 E； UniProt 1–149 链 F； UniProt 1–149 链 H； UniProt 1–149	未记录	Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 5 × 4 （Q9NR82） 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9LJ1	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7BYL Cryo-EM structure of human KCNQ4 提交 2020-04-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7BYM Cryo-EM structure of human KCNQ4 with retigabine 提交 2020-04-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7BYN Cryo-EM structure of human KCNQ4 with linopirdine 提交 2020-04-23	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 3 FCC 1-phenyl-3,3-bis(pyridin-4-ylmethyl)indol-2-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7CR3 human KCNQ2-CaM in apo state 提交 2020-08-12	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–149（149 aa）链 E 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7CR4 human KCNQ2-CaM in complex with ztz240 提交 2020-08-12	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–149（149 aa）链 E 1–149（149 aa）链 G 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	GB9 N-(6-chloranylpyridin-3-yl)-4-fluoranyl-benzamide × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7CR7 human KCNQ2-CaM in complex with retigabine 提交 2020-08-12	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–149（149 aa）链 E 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
7VNP Structure of human KCNQ4-ML213 complex with PIP2 提交 2021-10-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 8 K POTASSIUM ION × 4 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å
7VNQ Structure of human KCNQ4-ML213 complex in nanodisc 提交 2021-10-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.96 Å
7VNR Structure of human KCNQ4-ML213 complex in digitonin 提交 2021-10-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7XNI human KCNQ1-CaM in apo state 提交 2022-04-28	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–149（149 aa）链 E 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7XNK human KCNQ1-CaM in complex with ML277 提交 2022-04-29	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7XNL human KCNQ1-CaM-ML277-PIP2 complex in state A 提交 2022-04-29	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7XNN human KCNQ1-CaM-ML277-PIP2 complex in state B 提交 2022-04-29	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–149（149 aa）链 D 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8BD2 Calcium-bound Calmodulin variant G113R 提交 2022-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.69；298.1 K；离子强度（mmCIF原始值）127；压力 1 NMR样品组成 100 mM potassium chloride, 5 mM calcium chloride, 2 mM sodium azide, 20 mM HEPES, 0.1 mM 2,2,3,3-tetradeutero TSP-d4, 1 mM (Ser81-Lys148-U-15N,13C) Calmodulin G113R, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
8Z5M human phosphorylase kinase alpha/gamma/delta subcomplex - inactive state 提交 2024-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8Z5P human phosphorylase kinase - inactive state 提交 2024-04-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 D 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8Z5Q human phosphorylase kinase - inactive state 提交 2024-04-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）链 L 1–149（149 aa）链 P 1–149（149 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.24 Å
8Z5R human phosphorylase kinase alpha/gamma/delta subcomplex - phosphorylation and Ca2+ bound state 提交 2024-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–149（149 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.52 Å
8Z5T human phosphorylase kinase - phosphorylation and Ca2+ bound state 提交 2024-04-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）链 L 1–149（149 aa）链 P 1–149（149 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9IXY Human KCNQ2-CaM-Ebio2 Complex in the Presence of PIP2 提交 2024-07-29	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 G 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	A1L3C ~{N}-[7-[bis(fluoranyl)methoxy]-1-prop-2-ynyl-indazol-3-yl]-3,3-dimethyl-butanamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9LIZ Human KCNQ5-CaM in complex with PIP2 提交 2025-01-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–149（149 aa）链 E 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9LJ5 Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in an open conformation. 提交 2025-01-14	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 1–149（149 aa）链 E 1–149（149 aa）链 F 1–149（149 aa）链 H 1–149（149 aa）	未记录	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 8 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 E； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 F； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 H； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9lj1
沉积日期 deposition_date	2025-01-14
结构标题 title	Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in a closed conformation.
关键词 keywords	voltage-gated potassium channel, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.30 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.69 Å
零角强度 I(0) i0	702073000.00
分子量 molecular_weight	225730.0 kDa
排除体积 excluded_volume	285810 Å³
包络体积 envelope_volume	401980 Å³
水化壳体积 shell_volume	78023 Å³
包络直径 envelope_diameter	131.2 Å
壳层 Rg shell_rg	49.55 Å
包络 Rg envelope_rg	40.49 Å
形状 Rg shape_rg	41.67 Å
总 Rg total_rg	42.16 Å
总原子数 total_atoms	31832
残基数 n_residues	1952
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	126.9 Å
Rg (实空间) rg_real	42.00 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.74 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.0210e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1610e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.30 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	702300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8955
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	54.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.007
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.521
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	47460000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.921; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.953; Smooth: 0.921

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 5
分子量 formula_weight	70463.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,D,G
原子数 atom_count	31832

MLGKPLSYTSSQSCRRNVKYRRVQNYLYNVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDANKEFSTYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKALHTCSPTKKEQGEASSSQKLSFKERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSSQPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSREKITAEHETTDDLSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSLEGGSSGGWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Calmodulin-3
分子量 formula_weight	19615.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,C,F,H

MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAKLEGGSSGGLVPRGSGGSSGGHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate
分子量 formula_weight	340.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ;
分子量 formula_weight	746.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	90473

fit	/app/data/saxs_computation/lj/9lj1/9lj1.fit
pddf	/app/data/pr_computation/lj/9lj1/9lj1.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/lj/9lj1/9lj1.dat

Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in a closed conformation.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Calmodulin-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)