9nb1

CRYO-EM STRUCTURE OF human U7 SNRNP WITH MUTANT LSM11 that disrupts contacts with CPSF73

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMD3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 21–146； UniProt 1–126

U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10

Homo sapiens

UniProt Q969L4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LSM10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123

Small nuclear ribonucleoprotein E

Homo sapiens

UniProt P62304

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RUXE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

Small nuclear ribonucleoprotein F

Homo sapiens

UniProt P62306

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RUXF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–86； UniProt 1–86

Small nuclear ribonucleoprotein G

Homo sapiens

UniProt P62308

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RUXG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76

Symplekin

Homo sapiens

UniProt Q92797

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SYMPK_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–1072； UniProt 30–1101

;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;

Homo sapiens

UniProt P14678

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RSMB_HUMAN
Isoform	P14678-2
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q9UKF6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 × 1 （Q9P2I0） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CPSF3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–684； UniProt 1–684

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q9P2I0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10 × 1 （Q969L4） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） Symplekin × 1 （Q92797） CstF77 × 1 modified H2a pre-mRNA × 1 U7 snRNA × 1 ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11 × 1 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3 × 1 （Q9UKF6） ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CPSF2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–782； UniProt 1–782

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9nb1
沉积日期 deposition_date	2025-02-13
结构标题 title	CRYO-EM STRUCTURE OF human U7 SNRNP WITH MUTANT LSM11 that disrupts contacts with CPSF73
关键词 keywords	;3' end processing, U7 snRNP, Histone pre-mRNA, RNA BINDING PROTEIN, RNA BINDING PROTEIN-RNA complex ;; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9nb1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9nb1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9nb1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.90 Å
Rg（电子密度）	42.09 Å
总 Rg	42.35 Å
原子数	16565
残基数	1980
排除体积	292330 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9nb1__assembly_1__model_1`	13-meric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3
分子量 formula_weight	16111.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	16565

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNAPMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10
分子量 formula_weight	14102.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAVSHSVKERTISENSLIILLQGLQGRVTTVDLRDESVAHGRIDNVDAFMNIRLAKVTYTDRWGHQVKLDDLFVTGRNVRYVHIPDDVNITSTIEQQLQIIHRVRNFGGKGQGRWEFPPKNCK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein E
分子量 formula_weight	10817.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLKGDNITLLQSVSN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein F
分子量 formula_weight	9734.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEEDGEMRE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein G
分子量 formula_weight	9579.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERVLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Symplekin
分子量 formula_weight	120355.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MTTSERVVDLLNQAALITNDSKITVLKQVQELIINKDPTLLDNFLDEIIAFQADKSIEVRKFVIGFIEEACKRDIELLLKLIANLNMLLRDENVNVVKKAILTMTQLYKVALQWMVKSRVISELQEACWDMVSAMAGDIILLLDSDNDGIRTHAIKFVEGLIVTLSPRMADSEIPRRQEHDISLDRIPRDHPYIQYNVLWEEGKAALEQLLKFMVHPAISSINLTTALGSLANIARQRPMFMSEVIQAYETLHANLPPTLAKSQVSSVRKNLKLHLLSVLKHPASLEFQAQITTLLVDLGTPQAEIARNMPSSKDTRKRPRDDSDSTLKKMKLEPNLGEDDEDKDLEPGPSGTSKASAQISGQSDTDITAEFLQPLLTPDNVANLVLISMVYLPEAMPASFQAIYTPVESAGTEAQIKHLARLMATQMTAAGLGPGVEQTKQCKEEPKEEKVVKTESVLIKRRLSAQGQAISVVGSLSSMSPLEEEAPQAKRRPEPIIPVTQPRLAGAGGRKKIFRLSDVLKPLTDAQVEAMKLGAVKRILRAEKAVACSGAAQVRIKILASLVTQFNSGLKAEVLSFILEDVRARLDLAFAWLYQEYNAYLAAGASGSLDKYEDCLIRLLSGLQEKPDQKDGIFTKVVLEAPLITESALEVVRKYCEDESRTYLGMSTLRDLIFKRPSRQFQYLHVLLDLSSHEKDKVRSQALLFIKRMYEKEQLREYVEKFALNYLQLLVHPNPPSVLFGADKDTEVAAPWTEETVKQCLYLYLALLPQNHKLIHELAAVYTEAIADIKRTVLRVIEQPIRGMGMNSPELLLLVENCPKGAETLVTRCLHSLTDKVPPSPELVKRVRDLYHKRLPDVRFLIPVLNGLEKKEVIQALPKLIKLNPIVVKEVFNRLLGTQHGEGNSALSPLNPGELLIALHNIDSVKCDMKSIIKATNLCFAERNVYTSEVLAVVMQQLMEQSPLPMLLMRTVIQSLTMYPRLGGFVMNILSRLIMKQVWKYPKVWEGFIKCCQRTKPQSFQVILQLPPQQLGAVFDKCPELREPLLAHVRSFTPHQQAHIPNSIMTILEAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	CstF77
分子量 formula_weight	1094.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

NDIYRQRQ

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	modified H2a pre-mRNA
分子量 formula_weight	16627.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCACUGAAUCAGAUAAAGAGCUGUAACAC

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	U7 snRNA
分子量 formula_weight	19097.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Z

AGUGUUACAGCUCUUUUAGAAUUUGUCUAGUAGGCUUUCUGGCUUUUUACCGGAAAGCCC

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;
分子量 formula_weight	10911.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm11
分子量 formula_weight	28399.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MHHHHHHSGGSMEERERGARSAGAGSPARPPSPRLDVSSDSFDPLLALYAPRLPPIPYPNAPCFNNVAEYESFLRTGVRGGGRGRGRARGAAAGSGVPAAPGPSGRTRRRPDAPAPDPEEAQEAERAMVAKEEGDGAAGAGRRGPGRSRKAPRNVLTRMPLHEGSPLGELHRCIREGVKVNVHIRTFKGLRGVCTGFLVAFDKFWNMALTDVDETYRKPVLQSRKKKRKPKVDYQQVFTRHINQIFIRGENVLLVHLAQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3
分子量 formula_weight	77580.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.27.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSAIPAEESDQLLIRPLGAGQEVGRSCIILEFKGRKIMLDCGIHPGLEGMDALPYIDLIDPAEIDLLLISHFHLDHCGALPWFLQKTSFKGRTFMTHATKAIYRWLLSDYVKVSNISADDMLYTETDLEESMDKIETINFHEVKEVAGIKFWCYHAGHVLGAAMFMIEIAGVKLLYTGDFSRQEDRHLMAAEIPNIKPDILIIESTYGTHIHEKREEREARFCNTVHDIVNRGGRGLIPVFALGRAQELLLILDEYWQNHPELHDIPIYYASSLAKKCMAVYQTYVNAMNDKIRKQININNPFVFKHISNLKSMDHFDDIGPSVVMASPGMMQSGLSRELFESWCTDKRNGVIIAGYCVEGTLAKHIMSEPEEITTMSGQKLPLKMSVDYISFSAHTDYQQTSEFIRALKPPHVILVHGEQNEMARLKAALIREYEDNDEVHIEVHNPRNTEAVTLNFRGEKLAKVMGFLADKKPEQGQRVSGILVKRNFNYHILSPCDLSNYTDLAMSTVKQTQAIPYTGPFNLLCYQLQKLTGDVEELEIQEKPALKVFKNITVIQEPGMVVLEWLANPSNDMYADTVTTVILEVQSNPKIRKGAVQKVSKKLEMHVYSKRLEIMLQDIFGEDCVSVKDDSILSVTVDGKTANLNLETRTVECEEGSEDDESLREMVELAAQRLYEALTPVH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2
分子量 formula_weight	88597.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MTSIIKLTTLSGVQEESALCYLLQVDEFRFLLDCGWDEHFSMDIIDSLRKHVHQIDAVLLSHPDPLHLGALPYAVGKLGLNCAIYATIPVYKMGQMFMYDLYQSRHNTEDFTLFTLDDVDAAFDKIQQLKFSQIVNLKGKGHGLSITPLPAGHMIGGTIWKIVKDGEEEIVYAVDFNHKREIHLNGCSLEMLSRPSLLITDSFNATYVQPRRKQRDEQLLTNVLETLRGDGNVLIAVDTAGRVLELAQLLDQIWRTKDAGLGVYSLALLNNVSYNVVEFSKSQVEWMSDKLMRCFEDKRNNPFQFRHLSLCHGLSDLARVPSPKVVLASQPDLECGFSRDLFIQWCQDPKNSIILTYRTTPGTLARFLIDNPSEKITEIELRKRVKLEGKELEEYLEKEKLKKEAAKKLEQSKEADIDSSDESDIEEDIDQPSAHKTKHDLMMKGEGSRKGSFFKQAKKSYPMFPAPEERIKWDEYGEIIKPEDFLVPELQATEEEKSKLESGLTNGDEPMDQDLSDVPTKCISTTESIEIKARVTYIDYEGRSDGDSIKKIINQMKPRQLIIVHGPPEASQDLAECCRAFGGKDIKVYMPKLHETVDATSETHIYQVRLKDSLVSSLQFCKAKDAELAWIDGVLDMRVSKVDTGVILEEGELKDDGEDSEMQVEAPSDSSVIAQQKAMKSLFGDDEKETGEESEIIPTLEPLPPHEVPGHQSVFMNEPRLSDFKQVLLREGIQAEFVGGVLVCNNQVAVRRTETGRIGLEGCLCQDFYRIRDLLYEQYAIV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.850 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.85 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	45961

CRYO-EM STRUCTURE OF human U7 SNRNP WITH MUTANT LSM11 that disrupts contacts with CPSF73

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

U7 snRNA-associated Sm-like protein LSm10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Symplekin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9nb1__assembly_1__model_1

9nb1__assembly_1__model_1 | I(q)

9nb1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment