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1E88
Solution structure of 6F11F22F2, a compact three-module fragment of the gelatin-binding domain of human fibronectin
提交 2000-09-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
305–464(160 aa)
片段:6F11F22F2, RESIDUES 305-464
|
未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5;298 K
NMR样品组成
2MM 6F11F22F2, 20MM PHOSPHATE BUFFER
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分辨率未提供
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1E8B
Solution structure of 6F11F22F2, a compact three-module fragment of the gelatin-binding domain of human fibronectin
提交 2000-09-18
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
305–464(160 aa)
片段:6F11F22F2, RESIDUES 305-464
|
未记录
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5;298 K
NMR样品组成
2MM 6F11F22F2, 20MM PHOSPHATE BUFFER
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分辨率未提供
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1FBR
FOURTH AND FIFTH FIBRONECTIN TYPE I MODULE PAIR
提交 1995-08-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
183–275(93 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率未提供
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1FNA
CRYSTAL STRUCTURE OF THE TENTH TYPE III CELL ADHESION MODULE OF HUMAN FIBRONECTIN
提交 1994-01-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1452–1542(91 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率 1.80 Å
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1FNF
FRAGMENT OF HUMAN FIBRONECTIN ENCOMPASSING TYPE-III REPEATS 7 THROUGH 10
提交 1995-09-30
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1173–1540(368 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;pH 5.8
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.308
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1FNH
CRYSTAL STRUCTURE OF HEPARIN AND INTEGRIN BINDING SEGMENT OF HUMAN FIBRONECTIN
提交 1999-01-28
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1721–1991(271 aa)
片段:HEPARIN AND INTEGRIN BINDING
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 0.1M HEPES, PH7.5, 0.8M NA, K TARTRATE
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分辨率 2.80 Å
R-free 0.295
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1J8K
NMR STRUCTURE OF THE FIBRONECTIN EDA DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURES
提交 2001-05-22
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1631–1724(94 aa)
片段:EXTRA DOMAIN 2 (RESIDUES 1631-1724)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;293 K;离子强度(mmCIF原始值)400mM sodium sulfate;压力 1
NMR样品组成
2mM EDA U-15N,13C; 50mM phosphate buffer, 400mM sodium sulfate; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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1O9A
Solution structure of the complex of 1F12F1 from fibronectin with B3 from FnBB from S. dysgalactiae
提交 2002-12-11
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
48–140(93 aa)
片段:N-TERMINAL F1 MODULE PAIR, RESIDUES 48-140
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5;298 K
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分辨率未提供
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1OWW
Solution structure of the first type III module of human fibronectin determined by 1H, 15N NMR spectroscopy
提交 2003-03-31
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
608–701(94 aa)
片段:Residues 608-701 of SWS P02751
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;313 K;离子强度(mmCIF原始值)unbuffered;压力 ambient
NMR样品组成
1-2 mM [U-15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
|
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1Q38
Anastellin
提交 2003-07-28
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
631–705(75 aa)
片段:Type 3 (FN3) domain
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 ambient
NMR样品组成
1.5 mM anastellin U-15N, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 140 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 2 mM CHAPS | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.5 mM anastellin U-15N,13C, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 140 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 2 mM CHAPS | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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1QGB
SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL F1 MODULE PAIR FROM HUMAN FIBRONECTIN
提交 1999-04-21
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
48–140(93 aa)
片段:N-TERMINAL F1 MODULE PAIR
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4;310 K
NMR样品组成
2.2 mM [U-15N] 1F1-2F1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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1QO6
Solution structure of a pair of modules from the gelatin-binding domain of fibronectin
提交 1999-11-04
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
305–405(101 aa)
片段:FIBRONECTIN TYPE-I AND FIBRONECTIN TYPE-II MODULE PAIR FROM COLLAGEN-BINDING DOMAIN
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5;310 K;压力 1
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分辨率未提供
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1TTF
THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE TENTH TYPE III MODULE OF FIBRONECTIN: AN INSIGHT INTO RGD-MEDIATED INTERACTIONS
提交 1993-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1447–1540(94 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
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1TTG
THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE TENTH TYPE III MODULE OF FIBRONECTIN: AN INSIGHT INTO RGD-MEDIATED INTERACTIONS
提交 1993-07-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1447–1540(94 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
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2CG6
Second and third fibronectin type I module pair (crystal form I).
提交 2006-02-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
93–182(90 aa)
片段:RESIDUES 93-182 (62-151 IN COORDINATES)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5;0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1M NA ACETATE PH 4.5, 2% MPD, 5% PEG MME 550
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分辨率 1.55 Å
R-free 0.231
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2CG7
SECOND AND THIRD FIBRONECTIN TYPE I MODULE PAIR (CRYSTAL FORM II).
提交 2006-02-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
93–182(90 aa)
片段:RESIDUES 93-182 (62-151 IN COORDINATES)
|
未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;WATER AND 0.02% SODIUM AZIDE, pH 7.00
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分辨率 1.20 Å
R-free 0.219
|
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2CK2
Structure of core-swapped mutant of fibronectin
提交 2006-04-10
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1447–1542(96 aa)
片段:RESIDUES 1447-1542
链 B
1447–1542(96 aa)
片段:RESIDUES 1447-1542
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突变:YES
突变:YES
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ACE ACETYL GROUP × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.1;50% PEG-400, 0.1 M ACTEATE, 0.2 M LITHIUM SULPHATE, PH 5.1
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.268
|
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2CKU
Solution structure of 2F13F1 from human fibronectin
提交 2006-04-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
93–182(90 aa)
片段:2ND AND 3RD F1 MODULES, RESIDUES 93-182 (62-151 IN COORDINATES)
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
298 K
|
分辨率未提供
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2EC3
Solution structure of the 11th FN1 domain from human Fibronectin 1
提交 2007-02-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2239–2299(61 aa)
片段:Fibronectin type-I
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成
1.14 mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl (pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
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2FN2
SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE GLYCOSYLATED SECOND TYPE TWO MODULE OF FIBRONECTIN, 20 STRUCTURES
提交 1997-08-06
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
375–433(59 aa)
片段:RESIDUES 375 - 433
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未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0 mM;压力 10E+5 PA
NMR样品组成
H2O/D2O(9:1) OR D2O
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分辨率未提供
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2FNB
NMR STRUCTURE OF THE FIBRONECTIN ED-B DOMAIN, NMR, 20 STRUCTURES
提交 1998-12-16
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1261–1355(95 aa)
片段:TYPE III DOMAIN
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)63 mM;压力 1
|
分辨率未提供
|
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2H41
Solution structure of the second type III domain of human Fibronectin: minimized average structure
提交 2006-05-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
721–809(89 aa)
片段:Fibronectin type-III 2(2F3)
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM NaCl, 20mM Na2HPO4;压力 ambient
NMR样品组成
2.5mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 4% Radially compressed polyacrylamide gel, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供
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2H45
Solution structure of the second type III domain of human Fibronectin: ensemble of 25 structures
提交 2006-05-23
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
721–809(89 aa)
片段:Fibronectin type-III 2(2F3)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM NaCl, 20mM Na2HPO4;压力 ambient
NMR样品组成
2.5mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
2mM 2F3 U-13C,15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
1mM 2F3 U-15N, 20mM NaPi pH 7.0, 20mM NaCl, 4% Radially compressed polyacrylamide gel, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供
|
|
2HA1
Complex of the first and second type III domains of human Fibronectin in solution
提交 2006-06-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
609–809(201 aa)
片段:Fibronectin first and second type III domain pair (1F3-2F3)
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未记录
|
未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;303 K;离子强度(mmCIF原始值)150mM NaCl, 20mM Na2HPO3;压力 ambient
NMR样品组成
1.0mM 1F3-2F3 U-15N, 150mM NaCl, 20mM NaPi pH 7.0, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.0mM 1F3-2F3 U-15N, 13C, 150mM NaCl, 20mM NaPi pH 7.0, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.6mM 1F3-2F3 U-15N, 150mM NaCl, 20mM NaPi pH 7.0, 4% Radially compressed polyacrylamide gel, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供
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2N1K
Structure of the Third Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-04-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
808–905(98 aa)
片段:third FN3 domain (UNP residues 808-905)
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;298.15 K;离子强度(mmCIF原始值)0.17;压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-99% 15N] 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 3FN3, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 0.9 mM 3FN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
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2OCF
Human estrogen receptor alpha ligand-binding domain in complex with estradiol and the E2#23 FN3 monobody
提交 2006-12-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 D
1447–1540(94 aa)
片段:E2#23 FN3 MONOBODY, Fibronectin type III Domain 10, Residues 1447-1540
|
突变:R1452T, D1453K, R1524L, G1525R, D1526L, S1527M, P1528L, S1530G
|
EST ESTRADIOL × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;289 K;2.5M NaCl, 0.1M Imidazole, pH 8.0, 0.2M Zn(OAc)2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.95 Å
R-free 0.251
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2RKY
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
183–275(93 aa)
片段:UNP residues 183-275
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未记录
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SCN THIOCYANATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;100mM Tris-HCl, pH8.5, 0.15M Potassium thiocyanate, 20% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.216
|
|
2RKY
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
183–275(93 aa)
片段:UNP residues 183-275
|
未记录
|
SCN THIOCYANATE ION × 3
K POTASSIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;100mM Tris-HCl, pH8.5, 0.15M Potassium thiocyanate, 20% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.216
|
|
2RKZ
Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182
|
未记录
|
SIN SUCCINIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
2RKZ
Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182
|
未记录
|
SIN SUCCINIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
2RKZ
Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182
|
未记录
|
SIN SUCCINIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
2RKZ
Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
2RKZ
Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 E
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
2RKZ
Crystal structure of the second and third fibronectin f1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-1
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.8M SUCCINIC ACID, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
2RL0
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
184–272(89 aa)
片段:UNP residues 184-272
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;291 K;0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
2RL0
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
184–272(89 aa)
片段:UNP residues 184-272
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;291 K;0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
2RL0
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
184–272(89 aa)
片段:UNP residues 184-272
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;291 K;0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
2RL0
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
184–272(89 aa)
片段:UNP residues 184-272
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;291 K;0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
2RL0
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 I
184–272(89 aa)
片段:UNP residues 184-272
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;291 K;0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
2RL0
Crystal structure of the fourth and fifth fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2007-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 K
184–272(89 aa)
片段:UNP residues 184-272
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.2;291 K;0.2M NACL, 0.1M BIS TRIS, 14% PEG3350, pH6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.266
|
|
3CAL
Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2008-02-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182, Second and third F1 modules
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.95M succinic acid, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.217
|
|
3CAL
Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of staphylococcus aureus fnbpa-5
提交 2008-02-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
93–182(90 aa)
片段:UNP residues 93-182, Second and third F1 modules
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;0.95M succinic acid, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.217
|
|
3CH8
The crystal structure of PDZ-Fibronectin fusion protein
提交 2008-03-08
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1538–1631(94 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;31% isopropanol, 0.1M HEPES, 0.2M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.260
|
|
3EJH
Crystal Structure of the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair in Complex with a Type-I Collagen Peptide
提交 2008-09-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
516–608(93 aa)
片段:8-9FnI
|
突变:N528Q, R534K
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;2.5 M NaCl, 0.1 M BisTris pH 6.5 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.242
|
|
3EJH
Crystal Structure of the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair in Complex with a Type-I Collagen Peptide
提交 2008-09-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
516–608(93 aa)
片段:8-9FnI
|
突变:N528Q, R534K
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;2.5 M NaCl, 0.1 M BisTris pH 6.5 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.242
|
|
3GXE
Complex of a Low Affinity Collagen Site with the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair
提交 2009-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
516–608(93 aa)
片段:8-9FnI, UNP residues 516-608
|
突变:N528Q, R534K
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293.1 K;0.1M HEPES pH 7.5, 4.3M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.1K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.271
|
|
3GXE
Complex of a Low Affinity Collagen Site with the Fibronectin 8-9FnI Domain Pair
提交 2009-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
516–608(93 aa)
片段:8-9FnI, UNP residues 516-608
|
突变:N528Q, R534K
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293.1 K;0.1M HEPES pH 7.5, 4.3M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.1K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.271
|
|
3R8Q
Structure of Fibronectin domain 12-14
提交 2011-03-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1722–1992(271 aa)
片段:unp residues 1722-1992
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;0.1 M Na HEPES, 0.8 M sodium dihydrogen phosphate, 0.8 M potassium dihydrogen phosphate, supplemented with 35% glycerol for cryo-protection, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.236
|
|
3ZRZ
Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of Streptococcus pyogenes SfbI-5
提交 2011-06-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
93–182(90 aa)
片段:SECOND AND THIRD F1 MODULES, RESIDUES 93-182
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;CRYSTALS OF THE PROTEIN/PEPTIDE COMPLEX (0.3 MM/3.5 MM, PH 7.7) WERE GROWN USING SITTING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM A 1:1 DILUTION WITH WELL SOLUTION (0.1 M TRIS PH 7.0, 1.5 M (NH4)2SO4 AT 18 DEGREES CENTIGRADE
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.222
|
|
3ZRZ
Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of Streptococcus pyogenes SfbI-5
提交 2011-06-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
93–182(90 aa)
片段:SECOND AND THIRD F1 MODULES, RESIDUES 93-182
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;291 K;CRYSTALS OF THE PROTEIN/PEPTIDE COMPLEX (0.3 MM/3.5 MM, PH 7.7) WERE GROWN USING SITTING DROP VAPOUR DIFFUSION FROM A 1:1 DILUTION WITH WELL SOLUTION (0.1 M TRIS PH 7.0, 1.5 M (NH4)2SO4 AT 18 DEGREES CENTIGRADE
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.222
|
|
4GH7
Crystal structure of Anticalin N7A in complex with oncofetal fibronectin fragment Fn7B8
提交 2012-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1173–1448(276 aa)
片段:Fn7B8, UNP residues 1173-1448
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;17-19%(w/v) PEG3350, 0.1M Na-citrate, pH 5.5-6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.259
|
|
4GH7
Crystal structure of Anticalin N7A in complex with oncofetal fibronectin fragment Fn7B8
提交 2012-08-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1173–1448(276 aa)
片段:Fn7B8, UNP residues 1173-1448
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;17-19%(w/v) PEG3350, 0.1M Na-citrate, pH 5.5-6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.259
|
|
4LXO
Crystal structure of 9,10Fn3-elegantin chimera
提交 2013-07-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1357–1540(184 aa)
|
突变:L1408P, V1490C, T1491R, G1492A, S1496N, A1498D, S1499C
|
CA CALCIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M calcium acetate, 7%(w/v) PEG10000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.193
|
|
4LXO
Crystal structure of 9,10Fn3-elegantin chimera
提交 2013-07-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1357–1540(184 aa)
|
突变:L1408P, V1490C, T1491R, G1492A, S1496N, A1498D, S1499C
|
CA CALCIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;293 K;0.2M calcium acetate, 7%(w/v) PEG10000, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.42 Å
R-free 0.193
|
|
4MMX
Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to the tenth domain of Fibronectin
提交 2013-09-09
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1539–1631(93 aa)
片段:Fibronectin type-III domain 10 (UNP residues 1448-1540)
|
未记录
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5
MN MANGANESE (II) ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277.15 K;12% PEG3350, 0.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 3.32 Å
R-free 0.269
|
|
4MMY
Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to the tenth domain of Fibronectin with the IAKGDWND motif
提交 2013-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1448–1540(93 aa)
片段:Fibronectin type-III domain 10 (UNP residues 1448-1540)
|
突变:TGRGDSPASS to IARGDWNDG
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5
MN MANGANESE (II) ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277.15 K;12% PEG3350, 0.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 3.18 Å
R-free 0.252
|
|
4MMZ
Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to an antagonistic tenth domain of Fibronectin
提交 2013-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1539–1631(93 aa)
片段:Fibronectin type-III domain 10 (UNP residues 1448-1540)
|
突变:GRGDSPAS to PRGDWNEG
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8
MN MANGANESE (II) ION × 8
NA SODIUM ION × 1
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277.15 K;12% PEG3350, 0.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.255
|
|
4PZ5
Crystal structure of the second and third fibronectin F1 modules in complex with a fragment of BBK32 from Borrelia burgdorferi
提交 2014-03-28
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
93–182(90 aa)
片段:2FN1-3FN1, UNP RESIDUES 93-182
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.9;291 K;1.4 M Na/K phosphate, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.96 Å
R-free 0.199
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 10
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 J
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
CIT CITRIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 F
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 7
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 G
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 8
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 H
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5DFT
Structure of the Eleventh Type III Domain from Human Fibronectin
提交 2015-08-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 9
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 I
1539–1635(97 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;1.1M sodium citrate, 0.1M citric acid and 0.1M sodium iodine
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.248
|
|
5J6Z
Structure of anastellin bound to beta-strands A and B from the third type III domain of fibronectin
提交 2016-04-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
806–834(29 aa)
片段:residues 806-834
链 B
631–705(75 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)166;压力 100000
NMR样品组成
0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] AB, 0.6 mM anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM AB, 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-99% 15N] AB, 0.6 mM anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM AB, 0.6 mM [U-99% 15N] anastellin, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 140 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
5M0A
Solution structure of isolated 15th Fibronectin III domain from human fibronectin
提交 2016-10-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
2108–2193(86 aa)
片段:15th Fibronectin III domain, UNP residues 2108-2193
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)161;压力 1
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)161;压力 1
NMR样品组成
10 mM TRIS, 150 mM sodium chloride, 0.02 ug/mL TSP, 1 mM sodium azide, 0.35 mM [U-13C; U-15N] 15th Fibronectin III domain from human fibronectin, 0.5 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mM [U-2H] TRIS, 0.35 mM [U-13C; U-15N] 15th Fibronectin III domain from human fibronectin, 150 mM sodium chloride, 1 mM sodium azide, 0.02 ug/mL TSP, 0.5 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供
|
|
5N47
Structure of Anticalin N7E in complex with the three-domain fragment Fn7B8 of human oncofetal fibronectin
提交 2017-02-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1173–1448(276 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;17 % (w/v) PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na-malonate
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.241
|
|
5N47
Structure of Anticalin N7E in complex with the three-domain fragment Fn7B8 of human oncofetal fibronectin
提交 2017-02-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1173–1448(276 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;17 % (w/v) PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na-malonate
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.241
|
|
5N47
Structure of Anticalin N7E in complex with the three-domain fragment Fn7B8 of human oncofetal fibronectin
提交 2017-02-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
1173–1448(276 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;17 % (w/v) PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Na-malonate
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.241
|
|
5N48
Structure of Anticalin N9B in complex with extra-domain B of human oncofetal fibronectin
提交 2017-02-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1266–1357(92 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;29 % (w/v) PEG4000, 0.1 M Na-malonate
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.208
|
|
5N48
Structure of Anticalin N9B in complex with extra-domain B of human oncofetal fibronectin
提交 2017-02-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
1266–1357(92 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;29 % (w/v) PEG4000, 0.1 M Na-malonate
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.208
|
|
6HNF
Structure in solution of human fibronectin type III-domain 14
提交 2018-09-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1904–1991(88 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)162.7;压力 1030
NMR样品组成
1.0 mM [U-13C; U-15N] FNIII14, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供
|
|
6MFA
Fragment of human fibronectin containing the 4th-7th type III domains
提交 2018-09-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
903–1268(366 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M MES pH 5.5, 7% PEG 6000
|
分辨率 1.75 Å
R-free 0.238
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 10
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 J
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 11
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 K
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 12
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 L
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 13
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1085–1173(89 aa)
链 G
1085–1173(89 aa)
链 H
1085–1173(89 aa)
链 J
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 14
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1085–1173(89 aa)
链 D
1085–1173(89 aa)
链 F
1085–1173(89 aa)
链 L
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 15
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
1085–1173(89 aa)
链 E
1085–1173(89 aa)
链 I
1085–1173(89 aa)
链 K
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 6
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 F
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 7
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 G
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 8
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 H
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6MSV
Structure of the 6th type III domain from human fibronectin
提交 2018-10-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 9
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 I
1085–1173(89 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2.0 M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.295
|
|
6NAJ
Integrin AlphaVBeta3 ectodomain bound to Hr10 variant of the 10th domain of Fibronectin.
提交 2018-12-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
1539–1629(91 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7
MN MANGANESE (II) ION × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;277 K;100 M Sodium Acetate, PEG4000, 800 mM Sodium Chloride.
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.268
|
|
6XAX
Structure of a fragment of human fibronectin containing the 11th type III domain, extra domain A, and the 12th type III domain
提交 2020-06-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1630–1903(274 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2M Ca(CH3COO)2, 0.1M imidazole pH 8.0, 10%(w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.312
|
|
6XAX
Structure of a fragment of human fibronectin containing the 11th type III domain, extra domain A, and the 12th type III domain
提交 2020-06-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1630–1903(274 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.2M Ca(CH3COO)2, 0.1M imidazole pH 8.0, 10%(w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.312
|
|
6XAY
Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
1447–1722(276 aa)
|
突变:V1643G
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.296
|
|
6XAY
Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1447–1722(276 aa)
|
突变:V1643G
|
GOL GLYCEROL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.296
|
|
6XAY
Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
1447–1722(276 aa)
|
突变:V1643G
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.296
|
|
6XAY
Structure of a fragment of human fibronectin containing the 10th, 11th and 12th type III domains
提交 2020-06-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
1447–1722(276 aa)
|
突变:V1643G
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.5M (NH4)2SO4, 0.1M Citric acid pH 4.0, 30%(v/v)PEG 600, 10%(v/v) glycerol
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.296
|
|
7NWL
Cryo-EM structure of human integrin alpha5beta1 (open form) in complex with fibronectin and TS2/16 Fv-clasp
提交 2021-03-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 C
1173–1540(368 aa)
|
未记录
|
MN MANGANESE (II) ION × 7
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8PEQ
Complex of diubiquitin-derived artificial binding protein (Affilin) variant Af2 with its target oncofetal fibronectin (fragment 7B8)
提交 2023-06-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
1174–1447(274 aa)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.3;298 K;500 mM lithium sulfate, 15% PEG 8000 (w/v)
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.251
|
|
8PEQ
Complex of diubiquitin-derived artificial binding protein (Affilin) variant Af2 with its target oncofetal fibronectin (fragment 7B8)
提交 2023-06-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1174–1447(274 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.3;298 K;500 mM lithium sulfate, 15% PEG 8000 (w/v)
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.251
|
|
8PEQ
Complex of diubiquitin-derived artificial binding protein (Affilin) variant Af2 with its target oncofetal fibronectin (fragment 7B8)
提交 2023-06-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
1174–1447(274 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.3;298 K;500 mM lithium sulfate, 15% PEG 8000 (w/v)
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.251
|