9pzm

Augmin V junction with NEDD1 (WD)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AUGMIN subunit 2

Arabidopsis thaliana

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 3 × 1 （Q0WQE7） AUGMIN subunit 5 × 1 （Q9FMB4） AUGMIN subunit 6 × 1 （Q94BP7） AUGMIN subunit 7 × 1 （Q0WTP1） AUGMIN subunit 8 × 1 （Q9SUH5） Protein NEDD1 × 1 （B3H5K9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUG2_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–148； UniProt 22–169

AUGMIN subunit 3

Arabidopsis thaliana

UniProt Q0WQE7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 2 × 1 （O48767） AUGMIN subunit 5 × 1 （Q9FMB4） AUGMIN subunit 6 × 1 （Q94BP7） AUGMIN subunit 7 × 1 （Q0WTP1） AUGMIN subunit 8 × 1 （Q9SUH5） Protein NEDD1 × 1 （B3H5K9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUG3_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617

AUGMIN subunit 5

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9FMB4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 2 × 1 （O48767） AUGMIN subunit 3 × 1 （Q0WQE7） AUGMIN subunit 6 × 1 （Q94BP7） AUGMIN subunit 7 × 1 （Q0WTP1） AUGMIN subunit 8 × 1 （Q9SUH5） Protein NEDD1 × 1 （B3H5K9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUG5_ARATH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–777； UniProt 1–796

AUGMIN subunit 6

Arabidopsis thaliana

UniProt Q94BP7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 2 × 1 （O48767） AUGMIN subunit 3 × 1 （Q0WQE7） AUGMIN subunit 5 × 1 （Q9FMB4） AUGMIN subunit 7 × 1 （Q0WTP1） AUGMIN subunit 8 × 1 （Q9SUH5） Protein NEDD1 × 1 （B3H5K9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUG6_ARATH
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–328； UniProt 1–328

AUGMIN subunit 7

Arabidopsis thaliana

UniProt Q0WTP1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 2 × 1 （O48767） AUGMIN subunit 3 × 1 （Q0WQE7） AUGMIN subunit 5 × 1 （Q9FMB4） AUGMIN subunit 6 × 1 （Q94BP7） AUGMIN subunit 8 × 1 （Q9SUH5） Protein NEDD1 × 1 （B3H5K9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUG7_ARATH
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–329； UniProt 1–329

AUGMIN subunit 8

Arabidopsis thaliana

UniProt Q9SUH5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 2 × 1 （O48767） AUGMIN subunit 3 × 1 （Q0WQE7） AUGMIN subunit 5 × 1 （Q9FMB4） AUGMIN subunit 6 × 1 （Q94BP7） AUGMIN subunit 7 × 1 （Q0WTP1） Protein NEDD1 × 1 （B3H5K9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUG8_ARATH
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–165； UniProt 429–593

Protein NEDD1

Arabidopsis thaliana

UniProt B3H5K9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	AUGMIN subunit 2 × 1 （O48767） AUGMIN subunit 3 × 1 （Q0WQE7） AUGMIN subunit 5 × 1 （Q9FMB4） AUGMIN subunit 6 × 1 （Q94BP7） AUGMIN subunit 7 × 1 （Q0WTP1） AUGMIN subunit 8 × 1 （Q9SUH5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NEDD1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–310； UniProt 10–319

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9pzm
沉积日期 deposition_date	2025-08-11
结构标题 title	Augmin V junction with NEDD1 (WD)
关键词 keywords	Microtubule nucleator, PLANT PROTEIN; PLANT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9pzm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9pzm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9pzm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.86 Å
Rg（电子密度）	68.01 Å
总 Rg	67.49 Å
原子数	14092
残基数	1785
排除体积	249670 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9pzm__assembly_1__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	AUGMIN subunit 2
分子量 formula_weight	16952.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	14092

SDALSIASDLGFAVAPPPSQEELQSFASSNGERGDDLIRVLRELSVVQRKIADLQVELQGRKDDKNVAHLTHVGEMQKKIETLSRITQILKDVIQNKDRIIARLQQPYSLDCIPVEAEYQKQFSELLMKAASDYGALTASVSDFQWSQSMQG

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	AUGMIN subunit 3
分子量 formula_weight	69809.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSSARLCSLVAELGYEGAGKLDPDSFEWPFQYDDARPILDWICSSLRPSNVLSLAELSLYEQFQRDGKLLEGDDLDQAYDSISAFSSRRNNQEAVFGAEESIKEVRDATLAHKAEALELQRQLRRLQTQYDLLTGQSSALIQGRRARVAATSAVSGQITAIEDSLSARNLQMNGVLGRLASTSQELAHYHSGEEDGIYLAYSDFHAYLAGDSACTKELNQWFAKQLDTGPYRLVAEEGKSKCSWVSLDDTSNMLRDLEKSQHQRVAELQRLRSIFGTSERQWIEAQVENAKQQAILLTLKSQVTSVEAHIHFDLHSLRRKHADLVEEISTLYQKEEKLLSETIPELCWELAQLQDTYILQGDYDLKVMRQELYISKQKVFINHLVNQLARHQFLKLACQLEKKNMLGAFSLLKVIESELQGYLSATRSRVGRCSALIQAASDVQEQGAVDDRDSFLHGVRDLLSIHSNTQAGLSTYVSAPAIIQQIVALQSDLSSLQSDLENSLPDDRNRCINELCTHIQNLQQLLFASSTTAQPILTPWPLMKELDEMGKINSKLSTAVEEVTLEHRNKREIVKHHAKDVELQRRVFVDFFCNPERLRNQVRELNALVRARQASSS

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	AUGMIN subunit 5
分子量 formula_weight	87231.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MQSLSSSAPTPEAILEWLQKEMGYRQLGPYNGSSKSHVPSIDAIRKICRGNMIPIWNFLINRVKSEKTVERIRRNITVHGGSSNASIGSSVNPGKEESKSKGRRKDKTVTGESSSYAEDREAALQERELAAKEVERLRNIVRRQRKDLKARMLEVSREEAERKRMLDERANYRHKQALLEAYDQQCDEATRIFAEYHKRLQVYVNQANDAQRSVNSSNEVLSSLSANSEREAVYSTVKGTKSADDVILMETTRERNIRIVCDLLASRMIERIRNSFPAYEGNGICSLPELETAKLGFEYDGEITDEMKTVIVNSLRGPPLLLQAIAAYTLRIKTLISREMEKIDVRADAEMLRYKFENNRVTDNSSSDVSSPSNNQLLERQKAHVQQFLATEDALNKAAEARDLCHKFINRLHGSADTATHSFVGGTTQSGSNLRQFELDVWGKEREAAGLRASLNTLLSEIQRLNKLCAERKEAEDSLKKKWKKIEEFDARRSELETIYTTLLKANMDAVAFWNQQPLAAREYASATVIPASEVVVDISNSAKDFIEKEVSAFFQSPDNSLYMLPATPQGLLESMGANGSTGPEAVAYAEKNAALLTARAGARDPSAIPSICRISAALQYPAGLEGSDASLASVLESLEFCLRVRGSEACVLEDLAKAIDLVHIRQDLVESGHSLLDHAFRAQQKYERTTNYCLDLASEQENTISDQWLPELRTAVQNAQASSEHCKYVRGLLDEWWEQPASTVVDWVTVDGQSVAAWQNHVKQLLAFYDKESLRT

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	AUGMIN subunit 6
分子量 formula_weight	36708.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MTMDREKERELELESAMYTNCLLLGLDPNVIGLGASNGTPRVGLFRHSNPKLGEQLLYFILSSLRGPAQSSKDFDKVWPIFDSAQSRDFRKVVQAIISELESQGALPRSNSRVSSLATCCGPRFVELLWQLSLHALREVHRRTFPADVASNPLPSSLTDVSFSHAATLLPVTKARIVLERRRFLKNAETAVQRQAMWSNLAHEMTAEFRGLCAEEAYLQQELEKLNDLRNKVKQEGEVWDDLVSSSSQNSHLVSKATRLWDSIMARKGQHEVLASGPIEDLIAHREHRYRISGSALLAAMDQSSQVPRAELLSAHSDDSASLADDKEL

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	AUGMIN subunit 7
分子量 formula_weight	37047.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAAKQMEEIQKKLRLLSYPRANAPAQSLLFAGMERYALLEWLFFKLLGDKSPFSQQNLQGDAGVRDEETVRIQYLAEIAKFLGITPTVDIEAIQGHGTYEDRMEMLRNIVDLVEASLFSDNQEWSIDEQVAKDIQLIDAIAERQSLIFSEECKLFPADVQIQSIYPLPDVSELETKLSEQAKILSNLQQKVDDLAAKHAYNPDEEYTEVESQLRARLESFLETARAFNTIYTKEIRPWTHMMEVPQLHGFGPAANRLLEAYNMLLKFLGNLKNLRDSHAALSIGSSGTVAGEPSSVTRIVSDCEAALTVLNRDLGILSASIAREQGERL

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	AUGMIN subunit 8
分子量 formula_weight	18658.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

EDVHQLRLLHNRYLQWRFAIARAESVMYIQRLTSEETLFNVWHAISELQDHVTRQRIGLQQLKLEIKLNSLLNDQMVSLEDWATLERDHVSSLVGAISDLEANTLRLPATGGTKADTESLKAAMSSALDVMQAMGSSIWSLLSKVEEMNIMVTELAVVVTKESSM

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Protein NEDD1
分子量 formula_weight	33256.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

WRLLAASGGDTVKLFDVSADSGDPCVLSYTPSPGCAVNSVKWNHTNLVVASTGEDKKISLWRKNGQSLGTVPVTGKDGGDSAEECLSAISFSKKGSRYICSGGTGQIVKIWDLQRKLCIKKLKGHTSTITGVMYNCKDEHLASVSVGGDLIVHNLASGARATELKDPNGQVLRLLDYSRSSRHLLVTAGDDGTVHLWDTTGRSPKMSWLKQHSAPTAGVCFSPSNEKIIASVGMDKKLYTYDSGSRRSSSCIAYEAPFSSLAFGDNGYILVAGTSNGRVVFYDIRGKPQPVTVLHAFSNSEDVTSLSWQT

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	thale cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	8.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	49000

Augmin V junction with NEDD1 (WD)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AUGMIN subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AUGMIN subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AUGMIN subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AUGMIN subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AUGMIN subunit 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AUGMIN subunit 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein NEDD1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9pzm__assembly_1__model_1

9pzm__assembly_1__model_1 | I(q)

9pzm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source