9qon

Ternary complex of the human 20S proteasome in complex with Importin-9 and two homodimers of Akirin-2 - focussed refinement on the alpha subunits, Ipo-9 and Ak2

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Importin-9

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IPO9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1041； UniProt 1–1041

Akirin-2

Homo sapiens

UniProt Q53H80

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AKIR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 C； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 D； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

Proteasome subunit alpha type-3

Homo sapiens

UniProt P25788

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255

Proteasome subunit alpha type-6

Homo sapiens

UniProt P60900

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

Proteasome subunit alpha type-2

Homo sapiens

UniProt P25787

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234

Proteasome subunit alpha type-4

Homo sapiens

UniProt P25789

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

Proteasome subunit alpha type-7

Homo sapiens

UniProt O14818

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248

Proteasome subunit alpha type-5

Homo sapiens

UniProt P28066

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P25786）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–241； UniProt 1–241

Proteasome subunit alpha type-1

Homo sapiens

UniProt P25786

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	Importin-9 × 1 （Q96P70） Akirin-2 × 3 （Q53H80） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P60900） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 1 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P28066）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9qon
沉积日期 deposition_date	2025-03-26
结构标题 title	Ternary complex of the human 20S proteasome in complex with Importin-9 and two homodimers of Akirin-2 - focussed refinement on the alpha subunits, Ipo-9 and Ak2
关键词 keywords	20S proteasome, 20S, proteasome, nuclear iport, akirin, akirin2, importin 9, importin, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9qon__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9qon__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9qon__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	42.59 Å
Rg（电子密度）	41.98 Å
总 Rg	42.41 Å
原子数	32930
残基数	2120
排除体积	294420 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9qon__assembly_1__model_1`	11-meric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Importin-9
分子量 formula_weight	116062.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	32930

MAAAAAAGAASGLPGPVAQGLKEALVDTLTGILSPVQEVRAAAEEQIKVLEVTEEFGVHLAELTVDPQGALAIRQLASVILKQYVETHWCAQSEKFRPPETTERAKIVIRELLPNGLRESISKVRSSVAYAVSAIAHWDWPEAWPQLFNLLMEMLVSGDLNAVHGAMRVLTEFTREVTDTQMPLVAPVILPEMYKIFTMAEVYGIRTRSRAVEIFTTCAHMICNMEELEKGAAKVLIFPVVQQFTEAFVQALQIPDGPTSDSGFKMEVLKAVTALVKNFPKHMVSSMQQILPIVWNTLTESAAFYVRTEVNYTEEVEDPVDSDGEVLGFENLVFSIFEFVHALLENSKFKSTVKKALPELIYYIILYMQITEEQIKVWTANPQQFVEDEDDDTFSYTVRIAAQDLLLAVATDFQNESAAALAAAATRHLQEAEQTKNSGTEHWWKIHEACMLALGSVKAIITDSVKNGRIHFDMHGFLTNVILADLNLSVSPFLLGRALWAASRFTVAMSPELIQQFLQATVSGLHETQPPSVRISAVRAIWGYCDQLKVSESTHVLQPFLPSILDGLIHLAAQFSSEVLNLVMETLCIVCTVDPEFTASMESKICPFTIAIFLKYSNDPVVASLAQDIFKELSQIEACQGPMQMRLIPTLVSIMQAPADKIPAGLCATAIDILTTVVRNTKPPLSQLLICQAFPAVAQCTLHTDDNATMQNGGECLRAYVSVTLEQVAQWHDEQGHNGLWYVMQVVSQLLDPRTSEFTAAFVGRLVSTLISKAGRELGENLDQILRAILSKMQQAETLSVMQSLIMVFAHLVHTQLEPLLEFLCSLPGPTGKPALEFVMAEWTSRQHLFYGQYEGKVSSVALCKLLQHGINADDKRLQDIRVKGEEIYSMDEGIRTRSKSAKNPERWTNIPLLVKILKLIINELSNVMEANAARQATPAEWSQDDSNDMWEDQEEEEEEEEDGLAGQLLSDILATSKYEEDYYEDDEEDDPDALKDPLYQIDLQAYLTDFLCQFAQQPCYIMFSGHLNDNERRVLQTIGI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Akirin-2
分子量 formula_weight	22525.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C,D

MACGATLKRTLDFDPLLSPASPKRRRCAPLSAPTSAAASPLSAAAATAASFSAAAASPQKYLRMEPSPFGDVSSRLTTEQILYNIKQEYKRMQKRRHLETSFQQTDPCCTSDAQPHAFLLSGPASPGTSSAASSPLKKEQPLFTLRQVGMICERLLKEREEKVREEYEEILNTKLAEQYDAFVKFTHDQIMRRYGEQPASYVS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-3
分子量 formula_weight	28469.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDESDDDNM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-6
分子量 formula_weight	27432.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLVALAERD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-2
分子量 formula_weight	25927.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-4
分子量 formula_weight	29525.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKHEEEEAKAEREKKEKEQKEKDK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-7
分子量 formula_weight	27929.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-5
分子量 formula_weight	26436.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSGTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKDI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-1
分子量 formula_weight	29595.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTADARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMSIGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQRKAQPAQPADEPAEKADEPMEH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	61740

Ternary complex of the human 20S proteasome in complex with Importin-9 and two homodimers of Akirin-2 - focussed refinement on the alpha subunits, Ipo-9 and Ak2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Importin-9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Akirin-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9qon__assembly_1__model_1

9qon__assembly_1__model_1 | I(q)

9qon__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment