9rku

Agrobacterium phage 7-7-1 baseplate

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baseplate protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Structural protein × 6 （J7FAD9） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Tail sheath protein × 12 （J7FA80） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7FAQ1_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 Ac； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 Ad； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 Ae； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189

Putative tail biosynthetic protein

物种未注明

UniProt J7F9D2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Structural protein × 6 （J7FAD9） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Tail sheath protein × 12 （J7FA80） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7F9D2_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Af； PDB构建体 1–454； UniProt 1–454 作者链 Ag； PDB构建体 1–454； UniProt 1–454 作者链 Ah； PDB构建体 1–454； UniProt 1–454

Structural protein

物种未注明

UniProt J7FAD9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Tail sheath protein × 12 （J7FA80） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7FAD9_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 Ai； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 Aj； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 Ak； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 Al； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 Am； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286 作者链 An； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

Baseplate protein

物种未注明

UniProt J7F8X4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Structural protein × 6 （J7FAD9） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Tail sheath protein × 12 （J7FA80） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7F8X4_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 Ao； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Ap； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Aq； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Ar； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 As； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 At； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Au； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Av； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Aw； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Ax； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Ay； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396 作者链 Az； PDB构建体 1–396； UniProt 1–396

Putative tail biosynthetic protein

物种未注明

UniProt J7FAD8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Structural protein × 6 （J7FAD9） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Tail sheath protein × 12 （J7FA80） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7FAD8_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 A1； PDB构建体 1–398； UniProt 1–398 作者链 A2； PDB构建体 1–398； UniProt 1–398 作者链 A3； PDB构建体 1–398； UniProt 1–398 作者链 A4； PDB构建体 1–398； UniProt 1–398 作者链 A5； PDB构建体 1–398； UniProt 1–398 作者链 A6； PDB构建体 1–398； UniProt 1–398

Putative structural protein

物种未注明

UniProt J7FA56

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Structural protein × 6 （J7FAD9） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Tail sheath protein × 12 （J7FA80） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7FA56_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 A0； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178 作者链 A7； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178 作者链 A8； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178 作者链 A9； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178 作者链 BA； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178 作者链 BB； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178

Tail sheath protein

物种未注明

UniProt J7FA80

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Structural protein × 6 （J7FAD9） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Structural protein × 12 （J7F8Z8）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	J7FA80_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 BC； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BD； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BE； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BF； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BG； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BH； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BI； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BJ； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BK； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BL； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BM； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503 作者链 BN； PDB构建体 1–503； UniProt 1–503

Structural protein

物种未注明

UniProt J7F8Z8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 60	Baseplate protein × 3 （J7FAQ1） Putative tail biosynthetic protein × 3 （J7F9D2） Structural protein × 6 （J7FAD9） Baseplate protein × 12 （J7F8X4） Putative tail biosynthetic protein × 6 （J7FAD8） Putative structural protein × 6 （J7FA56） Tail sheath protein × 12 （J7FA80）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	J7F8Z8_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 BO； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BP； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BQ； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BR； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BS； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BT； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BU； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BV； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BW； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BX； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BY； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 BZ； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9rku
沉积日期 deposition_date	2025-06-14
结构标题 title	Agrobacterium phage 7-7-1 baseplate
关键词 keywords	Flagella phage, Agrobacterium sp. H13-3, Baseplate, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9rku__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9rku__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9rku__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	85.22 Å
Rg（电子密度）	84.29 Å
总 Rg	84.47 Å
原子数	284548
残基数	18903
排除体积	2551400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9rku__assembly_1__model_1`	60-meric （60）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Baseplate protein
分子量 formula_weight	20893.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ac,Ad,Ae
原子数 atom_count	284548

MTTTKTFDERNRDTQDGFERHVFRKLDHTDTGAIVTVEGSGTMDEDVPVINSGYGFNPEDDEELEVFLLSDGSDASGKFGVMTIPRNKQRKWPKKTGGIQHPFNADKFVQLDDDSIWLKDGKFTLGDNRSLSITVEGNNVVIDTGGGELDIRSSKLMHNGVNIGDSHVHPQQADSDGDTEADTDPPKRD

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Putative tail biosynthetic protein
分子量 formula_weight	49304.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Af,Ag,Ah

MIKPMRIFIGGEELETYTSARLQRTKKQLTGSLTVEIFLNYVPSKPVIVNAVRGKEILVYVMGELAFTGIIDKRKGKTVAGSQPRDASGRFAYSGGPGSMSDEGGSDVTVNFAKGQGYSVTLTARGRTKYLVDSSHSHPTGSFKDTSDRKVIEALVKEHKVVLDWQGTEVKEPKITLRDGNRIFNEIFERCNQNCHFAYETRDGKLLVTDGTTGVVGEDIVLGQNILDFSAEQSEDRANSEITVKGHRVAKDVWGKNAIVQPVQSVADSWVGANIPLTIQHYGDATNESLQRRAKFEADRRAAESKSVNVTVFHVAQQGGIPWDIGNIHYVEIPPEGIFDVMECVSLTYSVDAKSTLETQLELAPPPSESISGASSGLLSSISNSLADISTKGVARRVQAGIKLIAGQYPSTWTSAALSAITTPVNVIASVVNSLLLNEDESTPKQPPLRLPPE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Structural protein
分子量 formula_weight	31474.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ai,Aj,Ak,Al,Am,An

MNVLVPGIDGMVSAGKFEYSGCCPPDFADMDECTLATSYVGLLPSGPLWDRAKYEAITTITATGNCAACWTEDHCPTLVDYAVNVGARLASVIDMTLWPAVRESDPFTAVTSTADWLERFKWVNCFETSCRSKALGEITPIEYMTECGPVYVAINYPPSIKQAFESALIKSLERLSMGIIKNLASINFVIEPLKVRVVPLDTTNACENETLCVTFEKTSDFFDGVNQNPCGIPSPVAAYIDRDVMQLPSELPKYIWPGHMAAECVVRSLLSHVSRFCVVRTDQTPD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Baseplate protein
分子量 formula_weight	43428.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ao,Ap,Aq,Ar,As,At,Au,Av,Aw,Ax,Ay,Az

MACTIQRPEPQALRDKIATRFSTNVLGGAEIIPESNEFYVVTLEYAMQEEFFAFAEQMWREQDPRYACCENLVKMAARRGVYPKPAQFAQGYVRMTGVPGSALNQNLRFQFENQTYEAASVVPDQLPATGVLVLRVSAVTPGPSGNIRVTEGSLVTPVPGISSAVTAYGGNFCGGDDAEECEPFRTRYLQRLQYEPRLTVEWLKSKAMEWPCVTDVFDLGPNCCSVNALGEVECPNNIEFYVLFRDTFDCGLAPQCVVDEITDWLFGSPQGLGQGEAEFGICGKVRTATAVNLDIYLNGLSCATPAQARVVEQRITDFINRHPPSTNLTVEQLRFIGLQVLGSSFAFDVAIRSPGDASQSGLRFNACGDAEIDCDYKACLNSVQVINNNVTTSGCL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Putative tail biosynthetic protein
分子量 formula_weight	43729.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A1,A2,A3,A4,A5,A6

MAGPCYNPNEHYLPASFKGVPFDADSSDSEHGRNGAEAEFVFGERTGYADLGIKIRSYSIRARFQTNDHVALSNAFIAVLESTGPGLLVHPTRGPVMAACRSARVTDSKVDAAGVTYIDIDFVEANDTVTGFGLVGSLIALALSPIITATEESFKRYYSPENVRYYNSETVIATMAEAVQQVQTGYLALSGNDTSQEKWTIVRDFRNVLIDEFTFFDPANSWNVLRNGFSYLDSAAVGQDKFTILRNIINWSSSHSELDGESADAQNAIFSAVRVLATAYLSKAYMETVASTVNEGLAQYDQIAAILEQEAQIAQEDCHDNEFFLSIREFSVSVARVMVNRAYNSPALIVYSFPGTMHSLVVAWEIFGDAKRSRELEGRNTGAPWAIGPKVIAERVRA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Putative structural protein
分子量 formula_weight	19321.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A7,A8,A9,A0,BA,BB

MTCNFETADRRKRFWTTQVAACGQSSDDCGDCARPGLQLLCNGEGRITIATDNYVAGLALNILLTDASKADTGCGWTPGNRGGFWGDSFRSDNMRSGSKIRQVTARGSMRETVALIRAYAIDDLKKLVAYGVAKSVDVDLTYQGSNKIDMTIMIQGVDGNESRVGLTGERIANAWVWS

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Tail sheath protein
分子量 formula_weight	54120.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BN,BC,BD,BE,BF,BG,BH,BI,BJ,BK,BL,BM

MAQDALSDGFVRLCIDPSLNFFGEGCKILVEGQITDDATAAENVVTCVNSELDLVERFGQGSVLTESLRKVFCMCKSGVSVYALPRADAAAAVSAVYTLTVTGTALTDGRVQLYMGEAEYSLDIGVDEGDTPTQIAAKIVAAISPDFPYEATAAAGVITLTARNGGTIGNHLSVIYTNLGSCTSVTPEGVTVAFAQTTPGSVNPEPNDYASVVNECCFAVYVLSSDDTDWQENLRDWIRSAWDCSKPQCFGHGYVFNKGTLGQVLADGDNSAELSRLALPTTYPVLPYLTNAAYGALSACSTCENPELNVQGQTYGLLSCINMPESCTPGWEFTEVTQLQNNGFVVSGPATTSGQGNFTSPYIYNDVTNYLRDEKNRPNATFRDASSRRLAAATGVALATFLQQFNGLAVFTKNTNIKTGIIGTNLRLMLGKIRKWASDNVGVLFSEFDNINEDIQLVSDFDVQPKCVGQPGVFHLNMRYRPPVRGARINVNLVPALFDNCDR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Structural protein
分子量 formula_weight	14503.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	BO,BP,BQ,BR,BS,BT,BU,BV,BW,BX,BY,BZ

MACNKQNGVKNILITFTHCDTGEVIGPISHEQPDDTLPTYKTCAWTNTALTNGAVMRSASNATMTLPVVRDPRVPLAWYQGCAQIDAQVEKFDGTVMTLTEGAVTEPEESDGRAVTMTIIAAEIDELLPPGSLAAA

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.44 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	8161

Agrobacterium phage 7-7-1 baseplate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baseplate protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Putative tail biosynthetic protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Structural protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Putative tail biosynthetic protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Putative structural protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tail sheath protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Structural protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9rku__assembly_1__model_1

9rku__assembly_1__model_1 | I(q)

9rku__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer