9ryj

Aquifex aeolicus lumazine synthase 11-pentamer cage in complex with C5-symmetrized riboflavin synthase C-termini

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Riboflavin synthase

Aquifex aeolicus VF5

UniProt O67604

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase × 55 (O66529) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RISA_AQUAE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207 作者链 2; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207 作者链 3; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207 作者链 4; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207 作者链 5; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207

6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase

Aquifex aeolicus VF5

UniProt O66529

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 60 Riboflavin synthase × 5 (O67604) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RISB_AQUAE
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 A2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 A3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 A4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 A5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 B1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 B2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 B3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 B4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 B5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 C1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 C2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 C3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 C4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 C5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 D1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 D2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 D3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 D4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 D5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 E1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 E2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 E3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 E4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 E5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 F1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 F2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 F3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 F4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 F5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 G1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 G2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 G3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 G4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 G5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 H1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 H2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 H3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 H4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 H5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 I1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 I2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 I3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 I4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 I5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 J1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 J2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 J3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 J4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 J5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 K1; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 K2; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 K3; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 K4; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154 作者链 K5; PDB构建体 1–154; UniProt 1–154

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ryj
沉积日期 deposition_date2025-07-15
结构标题 titleAquifex aeolicus lumazine synthase 11-pentamer cage in complex with C5-symmetrized riboflavin synthase C-termini
关键词 keywordsprotein cage, protein engineering, self-assembly, geometry, pentamer, encapsulation, BIOSYNTHETIC PROTEIN; BIOSYNTHETIC PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ryj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ryj__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ryj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)66.11 Å
Rg(电子密度)64.76 Å
总 Rg65.09 Å
原子数65255
残基数8530
排除体积1167200 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9ryj__assembly_1__model_1 60-meric (60) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 引用文献 (1)