9tao

Local refinement of E. coli Complex I D79N NuoA mutant membrane domain in LMNG

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NADH-quinone oxidoreductase subunit H

Escherichia coli BW25113

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit K × 1 （P0AFE4） NADH-quinone oxidoreductase subunit L × 1 （P33607） NADH-quinone oxidoreductase subunit A × 1 （P0AFC3） NADH-quinone oxidoreductase subunit J × 1 （P0AFE0） NADH-quinone oxidoreductase subunit M × 1 （P0AFE8） NADH-quinone oxidoreductase subunit N × 1 （P0AFF0） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NUOH_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–325； UniProt 1–325

NADH-quinone oxidoreductase subunit K

Escherichia coli BW25113

UniProt P0AFE4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit H × 1 （P0AFD4） NADH-quinone oxidoreductase subunit L × 1 （P33607） NADH-quinone oxidoreductase subunit A × 1 （P0AFC3） NADH-quinone oxidoreductase subunit J × 1 （P0AFE0） NADH-quinone oxidoreductase subunit M × 1 （P0AFE8） NADH-quinone oxidoreductase subunit N × 1 （P0AFF0） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NUOK_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–100； UniProt 1–100

NADH-quinone oxidoreductase subunit L

Escherichia coli BW25113

UniProt P33607

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit H × 1 （P0AFD4） NADH-quinone oxidoreductase subunit K × 1 （P0AFE4） NADH-quinone oxidoreductase subunit A × 1 （P0AFC3） NADH-quinone oxidoreductase subunit J × 1 （P0AFE0） NADH-quinone oxidoreductase subunit M × 1 （P0AFE8） NADH-quinone oxidoreductase subunit N × 1 （P0AFF0） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NUOL_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–613； UniProt 1–613

NADH-quinone oxidoreductase subunit A

Escherichia coli BW25113

UniProt P0AFC3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit H × 1 （P0AFD4） NADH-quinone oxidoreductase subunit K × 1 （P0AFE4） NADH-quinone oxidoreductase subunit L × 1 （P33607） NADH-quinone oxidoreductase subunit J × 1 （P0AFE0） NADH-quinone oxidoreductase subunit M × 1 （P0AFE8） NADH-quinone oxidoreductase subunit N × 1 （P0AFF0） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NUOA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–147； UniProt 1–147

NADH-quinone oxidoreductase subunit J

Escherichia coli BW25113

UniProt P0AFE0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit H × 1 （P0AFD4） NADH-quinone oxidoreductase subunit K × 1 （P0AFE4） NADH-quinone oxidoreductase subunit L × 1 （P33607） NADH-quinone oxidoreductase subunit A × 1 （P0AFC3） NADH-quinone oxidoreductase subunit M × 1 （P0AFE8） NADH-quinone oxidoreductase subunit N × 1 （P0AFF0） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NUOJ_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–184； UniProt 1–184

NADH-quinone oxidoreductase subunit M

Escherichia coli BW25113

UniProt P0AFE8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit H × 1 （P0AFD4） NADH-quinone oxidoreductase subunit K × 1 （P0AFE4） NADH-quinone oxidoreductase subunit L × 1 （P33607） NADH-quinone oxidoreductase subunit A × 1 （P0AFC3） NADH-quinone oxidoreductase subunit J × 1 （P0AFE0） NADH-quinone oxidoreductase subunit N × 1 （P0AFF0） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NUOM_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–509； UniProt 1–509

NADH-quinone oxidoreductase subunit N

Escherichia coli BW25113

UniProt P0AFF0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 7	NADH-quinone oxidoreductase subunit H × 1 （P0AFD4） NADH-quinone oxidoreductase subunit K × 1 （P0AFE4） NADH-quinone oxidoreductase subunit L × 1 （P33607） NADH-quinone oxidoreductase subunit A × 1 （P0AFC3） NADH-quinone oxidoreductase subunit J × 1 （P0AFE0） NADH-quinone oxidoreductase subunit M × 1 （P0AFE8） 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 12 (1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate × 5 CARDIOLIPIN × 1 Ubiquinone-8 × 2 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NUON_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–485； UniProt 1–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9tao
沉积日期 deposition_date	2025-11-18
结构标题 title	Local refinement of E. coli Complex I D79N NuoA mutant membrane domain in LMNG
关键词 keywords	PROTON TRANSPORT, bioenergetics; PROTON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9tao__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9tao__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9tao__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.00 Å
Rg（电子密度）	52.48 Å
总 Rg	52.38 Å
原子数	18587
残基数	2281
排除体积	346240 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9tao__assembly_1__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit H
分子量 formula_weight	36240.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H
原子数 atom_count	18764

MSWISPELIEILLTILKAVVILLVVVTCGAFMSFGERRLLGLFQNRYGPNRVGWGGSLQLVADMIKMFFKEDWIPKFSDRVIFTLAPMIAFTSLLLAFAIVPVSPGWVVADLNIGILFFLMMAGLAVYAVLFAGWSSNNKYSLLGAMRASAQTLSYEVFLGLSLMGVVAQAGSFNMTDIVNSQAHVWNVIPQFFGFITFAIAGVAVCHRHPFDQPEAEQELADGYHIEYSGMKFGLFFVGEYIGIVTISALMVTLFFGGWQGPLLPPFIWFALKTAFFMMMFILIRASLPRPRYDQVMSFGWKICLPLTLINLLVTAAVILWQAQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit K
分子量 formula_weight	10853.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MIPLQHGLILAAILFVLGLTGLVIRRNLLFMLIGLEIMINASALAFVVAGSYWGQTDGQVMYILAISLAAAEASIGLALLLQLHRRRQNLNIDSVSEMRG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit L
分子量 formula_weight	66483.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MNMLALTIILPLIGFVLLAFSRGRWSENVSAIVGVGSVGLAALVTAFIGVDFFANGEQTYSQPLWTWMSVGDFNIGFNLVLDGLSLTMLSVVTGVGFLIHMYASWYMRGEEGYSRFFAYTNLFIASMVVLVLADNLLLMYLGWEGVGLCSYLLIGFYYTDPKNGAAAMKAFVVTRVGDVFLAFALFILYNELGTLNFREMVELAPAHFADGNNMLMWATLMLLGGAVGKSAQLPLQTWLADAMAGPTPVSALIHAATMVTAGVYLIARTHGLFLMTPEVLHLVGIVGAVTLLLAGFAALVQTDIKRVLAYSTMSQIGYMFLALGVQAWDAAIFHLMTHAFFKALLFLASGSVILACHHEQNIFKMGGLRKSIPLVYLCFLVGGAALSALPLVTAGFFSKDEILAGAMANGHINLMVAGLVGAFMTSLYTFRMIFIVFHGKEQIHAHAVKGVTHSLPLIVLLILSTFVGALIVPPLQGVLPQTTELAHGSMLTLEITSGVVAVVGILLAAWLWLGKRTLVTSIANSAPGRLLGTWWYNAWGFDWLYDKVFVKPFLGIAWLLKRDPLNSMMNIPAVLSRFAGKGLLLSENGYLRWYVASMSIGAVVVLALLMVLR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit A
分子量 formula_weight	16473.3 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MSMSTSTEVIAHHWAFAIFLIVAIGLCCLMLVGGWFLGGRARARSKNVPFESGIDSVGSARLRLSAKFYLVAMFFVIFNVEALYLFAWSTSIRESGWVGFVEAAIFIFVLLAGLVYLVRIGALDWTPARSRRERMNPETNSIANRQR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit J
分子量 formula_weight	19889.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MEFAFYICGLIAILATLRVITHTNPVHALLYLIISLLAISGVFFSLGAYFAGALEIIVYAGAIMVLFVFVVMMLNLGGSEIEQERQWLKPQVWIGPAILSAIMLVVIVYAILGVNDQGIDGTPISAKAVGITLFGPYVLAVELASMLLLAGLVVAFHVGREERAGEVLSNRKDDSAKRKTEEHA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit M
分子量 formula_weight	56560.1 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MLLPWLILIPFIGGFLCWQTERFGVKVPRWIALITMGLTLALSLQLWLQGGYSLTQSAGIPQWQSEFDMPWIPRFGISIHLAIDGLSLLMVVLTGLLGVLAVLCSWKEIEKYQGFFHLNLMWILGGVIGVFLAIDMFLFFFFWEMMLVPMYFLIALWGHKASDGKTRITAATKFFIYTQASGLVMLIAILALVFVHYNATGVWTFNYEELLNTPMSSGVEYLLMLGFFIAFAVKMPVVPLHGWLPDAHSQAPTAGSVDLAGILLKTAAYGLLRFSLPLFPNASAEFAPIAMWLGVIGIFYGAWMAFAQTDIKRLIAYTSVSHMGFVLIAIYTGSQLAYQGAVIQMIAHGLSAAGLFILCGQLYERIHTRDMRMMGGLWSKMKWLPALSLFFAVATLGMPGTGNFVGEFMILFGSFQVVPVITVISTFGLVFASVYSLAMLHRAYFGKAKSQIASQELPGMSLRELFMILLLVVLLVLLGFYPQPILDTSHSAIGNIQQWFVNSVTTTRP

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	NADH-quinone oxidoreductase subunit N
分子量 formula_weight	52072.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MTITPQNLIALLPLLIVGLTVVVVMLSIAWRRNHFLNATLSVIGLNAALVSLWFVGQAGAMDVTPLMRVDGFAMLYTGLVLLASLATCTFAYPWLEGYNDNKDEFYLLVLIAALGGILLANANHLASLFLGIELISLPLFGLVGYAFRQKRSLEASIKYTILSAAASSFLLFGMALVYAQSGDLSFVALGKNLGDGMLNEPLLLAGFGLMIVGLGFKLSLVPFHLWTPDVYQGAPAPVSTFLATASKIAIFGVVMRLFLYAPVGDSEAIRVVLAIIAFASIIFGNLMALSQTNIKRLLGYSSISHLGYLLVALIALQTGEMSMEAVGVYLAGYLFSSLGAFGVVSLMSSPYRGPDADSLFSYRGLFWHRPILAAVMTVMMLSLAGIPMTLGFIGKFYVLAVGVQAHLWWLVGAVVVGSAIGLYYYLRVAVSLYLHAPEQPGRDAPSNWQYSAGGIVVLISALLVLVLGVWPQPLISIVRLAMPLM

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli BW25113
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	679895
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BW25113

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	(1R)-2-(dodecanoyloxy)-1-[(phosphonooxy)methyl]ethyl tetradecanoate
分子量 formula_weight	564.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	Ubiquinone-8
分子量 formula_weight	727.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 12 Entity 12 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	177

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.61 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	86927

Local refinement of E. coli Complex I D79N NuoA mutant membrane domain in LMNG

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NADH-quinone oxidoreductase subunit H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH-quinone oxidoreductase subunit K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH-quinone oxidoreductase subunit L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH-quinone oxidoreductase subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH-quinone oxidoreductase subunit J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH-quinone oxidoreductase subunit M

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NADH-quinone oxidoreductase subunit N

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9tao__assembly_1__model_1

9tao__assembly_1__model_1 | I(q)

9tao__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source