9ufn

Phage T4 hub in post-tail contraction, pre-genome-release state

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tail tube protein gp19

物种未注明

UniProt P13333

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 Baseplate tail-tube junction protein gp54 × 6 (P13341) Baseplate tail-tube junction protein gp48 × 6 (P13339) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Baseplate tail-tube junction protein gp54 × 1 (P13341) Baseplate tail-tube junction protein gp48 × 1 (P13339) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Baseplate tail-tube junction protein gp54 × 1 (P13341) Baseplate tail-tube junction protein gp48 × 1 (P13339) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TUBE_BPT4
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 B; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163

Baseplate tail-tube junction protein gp54

物种未注明

UniProt P13341

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 Tail tube protein gp19 × 12 (P13333) Baseplate tail-tube junction protein gp48 × 6 (P13339) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Tail tube protein gp19 × 2 (P13333) Baseplate tail-tube junction protein gp48 × 1 (P13339) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Tail tube protein gp19 × 2 (P13333) Baseplate tail-tube junction protein gp48 × 1 (P13339) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP54_BPT4
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–321; UniProt 1–320

Baseplate tail-tube junction protein gp48

物种未注明

UniProt P13339

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 24 Tail tube protein gp19 × 12 (P13333) Baseplate tail-tube junction protein gp54 × 6 (P13341) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Tail tube protein gp19 × 2 (P13333) Baseplate tail-tube junction protein gp54 × 1 (P13341) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Tail tube protein gp19 × 2 (P13333) Baseplate tail-tube junction protein gp54 × 1 (P13341) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BP48_BPT4
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–364; UniProt 1–364

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ufn
沉积日期 deposition_date2025-04-10
结构标题 titlePhage T4 hub in post-tail contraction, pre-genome-release state
关键词 keywordsBacteriophage, Myovirus, Phage T4, tail contraction, phage hub complex, tape-measure protein, genome release, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ufn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ufn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ufn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)60.84 Å
Rg(电子密度)61.12 Å
总 Rg61.11 Å
原子数34614
残基数4350
排除体积611130 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9ufn__assembly_1__model_1 24-meric (24) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 9ufn__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 9ufn__assembly_3__model_1 tetrameric (4) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 引用文献 (1)