SAXSdb — 9uuo

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone acetyltransferase SAS3

Saccharomyces cerevisiae S288C

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–831	未记录	NuA3 HAT complex component NTO1 × 1 （Q12311） Protein YNG1 × 1 （Q08465） Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 （P47128） Transcription initiation factor TFIID subunit 14 × 1 （P35189） ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9UUO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–831（831 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–831（831 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SAS3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–831； UniProt 1–831

NuA3 HAT complex component NTO1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12311

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–748	未记录	Histone acetyltransferase SAS3 × 1 （P34218） Protein YNG1 × 1 （Q08465） Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 （P47128） Transcription initiation factor TFIID subunit 14 × 1 （P35189） ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9UUO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 11–748（738 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–748（748 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NTO1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–748； UniProt 1–748

Protein YNG1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q08465

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–219	未记录	Histone acetyltransferase SAS3 × 1 （P34218） NuA3 HAT complex component NTO1 × 1 （Q12311） Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 （P47128） Transcription initiation factor TFIID subunit 14 × 1 （P35189） ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9UUO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2JMI NMR solution structure of PHD finger fragment of Yeast Yng1 protein in free state 提交 2006-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 141–219（79 aa）片段：PHD finger	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；20 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.54 mM [U-13C, U-15N] YNG1_PHD, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-15N] YNG1_PHD, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.54 mM [U-13C, U-15N] YNG1_PHD, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2JMJ NMR solution structure of the PHD domain from the yeast YNG1 protein in complex with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2006-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 141–219（79 aa）片段：PHD finger	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；20 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.52 mM [U-15N] YNG1_PHD, 2.5 mM H3(1-9)K4me3, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.48 mM [U-13C; U-15N] YNG1_PHD, 2.5 mM H3(1-9)K4me3, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 113–124（12 aa）片段：UNP residues 113-124	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 113–124（12 aa）片段：UNP residues 113-124	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 113–124（12 aa）片段：UNP residues 113-124	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 113–124（12 aa）片段：UNP residues 113-124	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–219（219 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–219（219 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å

共 5 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	YNG1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–219； UniProt 1–219

Chromatin modification-related protein EAF6

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P47128

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–113	未记录	Histone acetyltransferase SAS3 × 1 （P34218） NuA3 HAT complex component NTO1 × 1 （Q12311） Protein YNG1 × 1 （Q08465） Transcription initiation factor TFIID subunit 14 × 1 （P35189） ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9UUO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–113（113 aa）	未记录	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–113（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 1–113（113 aa）	未记录	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 Y 1–113（113 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–113（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 1–113（113 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å

共 7 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EAF6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113

Transcription initiation factor TFIID subunit 14

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P35189

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–244	未记录	Histone acetyltransferase SAS3 × 1 （P34218） NuA3 HAT complex component NTO1 × 1 （Q12311） Protein YNG1 × 1 （Q08465） Chromatin modification-related protein EAF6 × 1 （P47128） ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.68 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9UUO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2L7E The structure of a domain from yeast 提交 2010-12-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–123（123 aa）片段：YEATS domain residues 1-123	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.12；压力 ambient NMR样品组成 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3QRL Crystal Structure of the Taf14 YEATS domain 提交 2011-02-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–137（137 aa）片段：YEATS Domain (UNP Residues 1-137)	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；42.5% (v/v) PEG-600, 100 mM Sodium Citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.235
5D7E Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9ac 提交 2015-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–137（137 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M sodium citrate and 48% PEG600 (v/v)	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
5IOK Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9cr 提交 2016-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–137（137 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)	分辨率 2.22 Å R-free 0.239
5SVA Mediator-RNA Polymerase II Pre-Initiation Complex 提交 2016-08-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric	链 n 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 15.30 Å
6LQZ Solution structure of Taf14ET-Sth1EBMC 提交 2020-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 174–244（71 aa）片段：Taf14ET	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taf14ET, 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Sth1EBMC, 20 mM Phosphate buffer, 100 mM sodium chloride, 1 % v/v inhabitor cocktail, 0.04 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6MIN Crystal structure of Taf14 YEATS domain G82A mutant in complex with histone H3K9cr 提交 2018-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–137（137 aa）片段：YEATS domain residues 1-137	突变：G82A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
6MIO Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9pr 提交 2018-09-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–137（137 aa）片段：YEATS domain residues 1-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；46% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)	分辨率 1.85 Å R-free 0.232
6MIP Crystal structure of Taf14 YEATS domain G82A mutant 提交 2018-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–137（137 aa）片段：YEATS domain residues 1-137	突变：G82A	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；48% PEG600 with 0.2 M sodium citrate (pH 6.0)	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
6MIQ Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with histone H3K9bu 提交 2018-09-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–137（137 aa）片段：YEATS domain residues 1-137	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；44% PEG600 (v/v) and 0.2 M citric acid (pH 6.0)	分辨率 1.75 Å R-free 0.218
7F4A Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9bz peptide 提交 2021-06-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–137（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；48% PEG 600, 0.04M citric acid	分辨率 2.00 Å R-free 0.204
7UHE Taf14 ET domain in complex with C-terminal tail of Taf2 提交 2022-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 168–243（76 aa）片段：ET domain 链 C 168–243（76 aa）片段：ET domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；2.4 M sodium malonate	分辨率 1.66 Å R-free 0.234
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 176–243（68 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 176–243（68 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 176–243（68 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
8U77 Crystal structure of Taf14 in complex with Yng1 提交 2023-09-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 176–243（68 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；40% PEG 400, 0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M LiSO4	分辨率 1.93 Å R-free 0.221
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9VKW Cryo-EM structure of the NuA3 complex bound to Ace-coenzyme A 提交 2025-06-24	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–244（244 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å

共 15 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TAF14_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–244； UniProt 1–244

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9uuo
沉积日期 deposition_date	2025-05-07
结构标题 title	The NuA3 histone acetyltransferase complex
关键词 keywords	DNA, nucleosome, histone acetylation, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	35.43 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.65 Å
零角强度 I(0) i0	375781000.00
分子量 molecular_weight	156530.0 kDa
排除体积 excluded_volume	195730 Å³
包络体积 envelope_volume	252210 Å³
水化壳体积 shell_volume	58835 Å³
包络直径 envelope_diameter	121.1 Å
壳层 Rg shell_rg	42.43 Å
包络 Rg envelope_rg	34.73 Å
形状 Rg shape_rg	34.64 Å
总 Rg total_rg	35.20 Å
总原子数 total_atoms	11004
残基数 n_residues	1340
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	113.3 Å
Rg (实空间) rg_real	35.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.79 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.7580e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8290e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	35.38 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	375800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8935
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	45.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.221
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.411
角度范围 angular_range	— – 0.2250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	149300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	46
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.894; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.940

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone acetyltransferase SAS3
分子量 formula_weight	97723.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	11004

MSLTANDESPKPKKNALLKNLEIDDLIHSQFVRSDTNGHRTTRRLFNSDASISHRIRGSVRSDKGLNKIKKGLISQQSKLASENSSQNIVNRDNKMGAVSFPIIEPNIEVSEELKVRIKYDSIKFFNFERLISKSSVIAPLVNKNITSSGPLIGFQRRVNRLKQTWDLATENMEYPYSSDNTPFRDNDSWQWYVPYGGTIKKMKDFSTKRTLPTWEDKIKFLTFLENSKSATYINGNVSLCNHNETDQENEDRKKRKGKVPRIKNKVWFSQIEYIVLRNYEIKPWYTSPFPEHINQNKMVFICEFCLKYMTSRYTFYRHQLKCLTFKPPGNEIYRDGKLSVWEIDGRENVLYCQNLCLLAKCFINSKTLYYDVEPFIFYILTEREDTENHPYQNAAKFHFVGYFSKEKFNSNDYNLSCILTLPIYQRKGYGQFLMEFSYLLSRKESKFGTPEKPLSDLGLLTYRTFWKIKCAEVLLKLRDSARRRSNNKNEDTFQQVSLNDIAKLTGMIPTDVVFGLEQLQVLYRHKTRSLSSLDDFNYIIKIDSWNRIENIYKTWSSKNYPRVKYDKLLWEPIILGPSFGINGMMNLEPTALADEALTNETMAPVISNNTHIENYNNSRAHNKRRRRRRRSSEHKTSKLHVNNIIEPEVPATDFFEDTVSSLTEYMCDYKNTNNDRLIYQAEKRVLESIHDRKGIPRSKFSTETHWELCFTIKNSETPLGNHAARRNDTGISSLEQDEVENDVDTELYVGENAKEDEDEDEDFTLDDDIEDEQISEENDEEEDTYEEDSDDDEDGKRKGQEQDENDIESHIRKERVRKRRKITLIEDDEE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	NuA3 HAT complex component NTO1
分子量 formula_weight	86146.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MNRGSLDDGPKLREEKHFQDFYPDLNADTLLPFIVPLVETKDNSTDTDSDDISNRNNREIGSVKSVQTKELIFKGRVTTEPLVLKKNEVEFQKCKITTNELKGKKNPYCVRFNESFISRYYHINKVRNRKSYKQQQKEFDGVEAPYFTKFSSKEAPNITISTSTKSAIQKFASISPNLVNFKPQYDMDEQDELYLHYLNKRYFKDQMSHEIFEILMTTLETEWFHIEKHIPSTNSLIARHNILRDCKNYELYGSDDGTGLSMDQACAVCLGTDSDNLNTIVFCDGCDIAVHQECYGIIFIPEGKWLCRRCMISKNNFATCLMCPSHTGAFKQTDTGSWVHNICALWLPELYFSNLHYMEPIEGVQNVSVSRWKLNCYICKKKMGACIQCFQRNCFTAYHVTCARRAGLYMSKGKCTIQELASNQFSQKYSVESFCHKHAPRGWQTSIEGINKARKYFSLLSTLQTETPQHNEANDRTNSKFNKTIWKTPNQTPVAPHVFAEILQKVVDFFGLANPPAGAFDICKYWSMKRELTGGTPLTACFENNSLGSLTEEQVQTRIDFANDQLEDLYRLKELTTLVKKRTQASNSLSRSRKKVFDIVKSPQKYLLKINVLDIFIKSEQFKALERLVTEPKLLVILEKCKHCDFDTVQIFKEEIMHFFEVLETLPGASRILQTVSSKAKEQVTNLIGLIEHVDIKKLLSRDFIINDDKIEERPWSGPVIMEEEGLSDAEELSAGEHRMLKLILNSG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein YNG1
分子量 formula_weight	25391.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MEHLANENSDSDIRYSFLSTLDHLPCELIRSLRLMQTIDLFKNEEDEPGMERACRDLLLVATYINDLVDDQIHFLKQHKKELEIQKSVTKNFNSSLENIKSKLTLEEPGAYKEPKLLLKINLKKAKSRERKESITSPTIGINQGDVTEGNNNQEEVYCFCRNVSYGPMVACDNPACPFEWFHYGCVGLKQAPKGKWYCSKDCKEIANQRSKSKRQKRRK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Chromatin modification-related protein EAF6
分子量 formula_weight	12915.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MTDELKSYEALKAELKKSLQDRREQEDTFDNLQQEIYDKETEYFSHNSNNNHSGHGGAHGSKSHYSGNIIKGFDTFSKSHHSHADSAFNNNDRIFSLSSATYVKQQHGQSQND

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 14
分子量 formula_weight	27473.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MVATVKRTIRIKTQQHILPEVPPVENFPVRQWSIEIVLLDDEGKEIPATIFDKVIYHLHPTFANPNRTFTDPPFRIEEQGWGGFPLDISVFLLEKAGERKIPHDLNFLQESYEVEHVIQIPLNKPLLTEELAKSGSTEETTANTGTIGKRRTTTNTTAEPKAKRAKTGSASTVKGSVDLEKLAFGLTKLNEDDLVGVVQMVTDNKTPEMNVTNNVEEGEFIIDLYSLPEGLLKSLWDYVKKNTE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.68 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	89035

fit	/app/data/saxs_computation/uu/9uuo/9uuo.fit
pddf	/app/data/pr_computation/uu/9uuo/9uuo.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/uu/9uuo/9uuo.dat

The NuA3 histone acetyltransferase complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone acetyltransferase SAS3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

NuA3 HAT complex component NTO1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein YNG1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromatin modification-related protein EAF6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)