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9x0j

IL-33 and Etokimab fab and Tozorakimab fab ternary complex structure

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 171.1 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-33 (109-270)

Homo sapiens

UniProt O95760

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 113–270 未记录 Tozorakimab-L Chain × 1 Tozorakimab-H Chain × 1 Etokimab-H Chain × 1 Etokimab-K Chain × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.57 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9X0J Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2KLL Solution structure of human interleukin-33 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 111–270（160 aa） 片段：UNP residues 110-270
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] Interleukin-33, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 5 mM beta-mercaptoethanol, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM Interleukin-33, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 5 mM [U-100% 2H] beta-mercaptoethanol, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Interleukin-33, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 5 mM beta-mercaptoethanol, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Interleukin-33, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 5 mM [U-100% 2H] beta-mercaptoethanol, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
4KC3 Cytokine/receptor binary complex 提交 2013-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 112–270（159 aa） 片段：UNP residues 112-270
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；12% PEG3350, 100 mM Sodium Malonate pH 4.5, 7% v/v MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.27 Å R-free 0.283
9WWH Crystal structure of IL-33 and antibody Tozorakimab fab binary complex 提交 2025-09-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 117–268（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate 0.1 M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.0 15% w/v Polyethylene glycol 20,000
分辨率 3.51 Å R-free 0.259
9WWH Crystal structure of IL-33 and antibody Tozorakimab fab binary complex 提交 2025-09-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 117–268（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate 0.1 M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.0 15% w/v Polyethylene glycol 20,000
分辨率 3.51 Å R-free 0.259
9WWH Crystal structure of IL-33 and antibody Tozorakimab fab binary complex 提交 2025-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 117–268（152 aa）
链 D 117–268（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate 0.1 M Na citrate tribasic dihydrate pH 5.0 15% w/v Polyethylene glycol 20,000
分辨率 3.51 Å R-free 0.259
9X05 IL-33 and Itepekimab fab and Tozorakimab fab ternary complex structure 提交 2025-09-29 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 113–270（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL33_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–158； UniProt 113–270

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9x0j

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9x0j
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9x0j
沉积日期 deposition_date2025-09-30
结构标题 titleIL-33 and Etokimab fab and Tozorakimab fab ternary complex structure
关键词 keywordsIL33, antibody Etokimab fab, antibody Tozorakimab fab, CYTOKINE/IMMUNE SYSTEM, CYTOKINE-IMMUNE SYSTEM complex; CYTOKINE/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier45.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron46.04 Å
零角强度 I(0) i0149003000.00
分子量 molecular_weight91875.0 kDa
排除体积 excluded_volume111550 ų
包络体积 envelope_volume181000 ų
水化壳体积 shell_volume35932 ų
包络直径 envelope_diameter165.2 Å
壳层 Rg shell_rg44.02 Å
包络 Rg envelope_rg46.21 Å
形状 Rg shape_rg45.99 Å
总 Rg total_rg46.09 Å
总原子数 total_atoms6496
残基数 n_residues995
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax171.1 Å
Rg (实空间) rg_real46.29 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.63 Å
I(0) (实空间) i0_real1.4900e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8260e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal45.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal148900000.0000
解质量估计 total_estimate0.6306
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary34.2 Å
偏度 Skewness skewness0.596
峰度 Kurtosis kurtosis-0.440
角度范围 angular_range— – 0.1750 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha9274000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.357; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.123; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)