9x2x

GSK3beta complexed with BiS-5

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 89.4 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glycogen synthase kinase-3 beta

Homo sapiens

UniProt P49841

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 27–383 未记录 BiS-5 × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;283 K;0.15M DL-malic acid, 20% PEG 3350 分辨率 1.79 Å R-free 0.207
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 27–383 未记录 BiS-5 × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;283 K;0.15M DL-malic acid, 20% PEG 3350 分辨率 1.79 Å R-free 0.207

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 114 个其他 PDB 条目、176 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GSK3B_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–359; UniProt 27–383 作者链 C; PDB构建体 3–359; UniProt 27–383

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9x2x

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9x2x
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9x2x
沉积日期 deposition_date2025-10-08
结构标题 titleGSK3beta complexed with BiS-5
关键词 keywordskinase, cyclic peptide, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier27.96
回转半径 Rg (电子) rg_electron27.18
零角强度 I(0) i0207240000.00
分子量 molecular_weight77348.0 kDa
排除体积 excluded_volume75237 ų
包络体积 envelope_volume127770 ų
水化壳体积 shell_volume38237 ų
包络直径 envelope_diameter94.4
壳层 Rg shell_rg35.34
包络 Rg envelope_rg27.20
形状 Rg shape_rg27.17
总 Rg total_rg27.76
总原子数 total_atoms5876
残基数 n_residues714
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax89.4
Rg (实空间) rg_real27.86
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.54
I(0) (实空间) i0_real2.0720e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.6990e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal27.90
I(0) (倒空间) i0_reciprocal207200000.0000
解质量估计 total_estimate0.8925
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.9
偏度 Skewness skewness0.286
峰度 Kurtosis kurtosis-0.345
角度范围 angular_range— – 0.2850 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha46490000.0000
实空间数据点数 n_real_points58
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.885; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.944

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)