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9y9b

PLK4 in complex with Compound 6 (3-hydroxy-N-(3-(pyridin-2-yl)-1H-pyrazol-4-yl)-8-azabicyclo[3.2.1]octane-8-carboxamide)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 64.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase PLK4

Homo sapiens

UniProt O00444

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–275 未记录 SO4 SULFATE ION × 1 A1CTX (1R,3r,5S)-3-hydroxy-N-[3-(pyridin-2-yl)-1H-pyrazol-4-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octane-8-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 16% ethanol , 5 mM DTT 分辨率 2.70 Å R-free 0.335

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9Y9B Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2N19 STIL binding to the Polo-box domain 3 of PLK4 regulates centriole duplication 提交 2015-03-24 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03；压力 ambient
NMR样品组成 0.6-1.2 M [U-13C; U-15N; U-2H] PLK4-PB3, 20 mM MOPS, 30 mM sodium chloride, 2 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.6-1.2 M [U-2H,15N,methyl13C/rest-12C-ILV]-PB3 PLK4-PB3, 20 mM MOPS, 30 mM sodium chloride, 2 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1200 mM [U-2H,15N,13C,methyl13C/1H-ILV]-PB3 PLK4-PB3, 20 mM MOPS, 30 mM sodium chloride, 2 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 600 mM [U-2H, U-15N] PLK4-PB3, 20 mM MOPS, 30 mM sodium chloride, 2 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3COK Crystal structure of PLK4 kinase 提交 2008-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–275（274 aa） 片段：Protein kinase domain: Residues 2-275
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；100mM Sodium citrate pH 6.0, 16% PEG 4000, 200mM Ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 2.25 Å R-free 0.261
3COK Crystal structure of PLK4 kinase 提交 2008-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–275（274 aa） 片段：Protein kinase domain: Residues 2-275
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294 K；100mM Sodium citrate pH 6.0, 16% PEG 4000, 200mM Ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 2.25 Å R-free 0.261
4JXF Crystal Structure of PLK4 Kinase with an inhibitor: 400631 ((1R,2S)-2-{3-[(E)-2-{4-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]PHENYL}ETHENYL]-2H-INDAZOL-6-YL}-5'-METHOXYSPIRO[CYCLOPROPANE-1,3'-INDOL]-2'(1'H)-ONE) 提交 2013-03-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–269（266 aa） 片段：PLK4 kinase
未记录 631 (1R,2S)-2-{3-[(E)-2-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}ethenyl]-2H-indazol-6-yl}-5'-methoxyspiro[cyclopropane-1,3'-indol]-2'(1'H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；23% PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.5 0.16 M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.268
4N7V Crystal structure of human Plk4 cryptic polo box (CPB) in complex with a Cep152 N-terminal fragment 提交 2013-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 580–808（229 aa） 片段：UNP residues 580-808
链 B 580–808（229 aa） 片段：UNP residues 580-808
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295.15 K；22% PEG 4000, 3% Iso-propanol, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Lithium Sulfate , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K
分辨率 2.76 Å R-free 0.288
4N7Z Crystal structure of human Plk4 cryptic polo box (CPB) in complex with a Cep192 N-terminal fragment 提交 2013-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 580–808（229 aa） 片段：UNP residues 580-808
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295.15 K；20% PEG 1500, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.15K
分辨率 2.85 Å R-free 0.260
4N9J Crystal structure of the cryptic polo box domain of human Plk4 提交 2013-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 581–808（228 aa） 片段：cryptic polo box, UNP residues 580-808
链 B 581–808（228 aa） 片段：cryptic polo box, UNP residues 580-808
未记录 CL CHLORIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；100 mM Bis-Tris (pH 5.5), 2.0 M ammonium sulfate, 1% (v/v) methanol , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
4YUR Crystal Structure of Plk4 Kinase Domain Bound to Centrinone 提交 2015-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–275（274 aa） 片段：UNP residues 2-275
未记录 4J7 2-({2-fluoro-4-[(2-fluoro-3-nitrobenzyl)sulfonyl]phenyl}sulfanyl)-5-methoxy-N-(3-methyl-1H-pyrazol-5-yl)-6-(morpholin-4-yl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.1 M HEPES, 0.2 M MgCl2, 30% PEG 400
分辨率 2.65 Å R-free 0.270
4YYP Crystal structure of human PLK4-PB3 in complex with STIL-CC 提交 2015-03-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 884–970（87 aa） 片段：residues 884-970
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Thin needles grew in precipitant solution containing 100 mM Hepes, pH 7.0, 20 mM MgCl2 and 22% Poly(acrylic acid sodium salt) 5100. After extensive optimization and seeding plate-like crystals were grown in a drop consisting of 50% PLK4-PB3/STIL-CC complex solution, 33.3% precipitant solution (100 mM phosphate/citrate pH 4.2, 40% (v/v) Ethanol, 5% (w/v) PEG 1000) and 16.7% of seed stock solution.
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 B 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 T 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 U 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 V 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 W 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 X 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 Z 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 1 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 2 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 3 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 4 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 5 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 6 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 17 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 7 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 8 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 18 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 9 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 a 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 19 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 b 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 c 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 D 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 20 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 d 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 e 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 21 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 f 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 g 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 22 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 h 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 i 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 23 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 j 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 k 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 24 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 l 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 m 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 25 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 n 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 o 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 26 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 p 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 q 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 27 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 r 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 s 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 28 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 t 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 u 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 29 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 v 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 w 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 F 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 30 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 x 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 y 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 H 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 J 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 L 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 N 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 O 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 P 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHY PB3 Domain of Human PLK4 (apo) 提交 2016-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
链 R 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；100 nl protein solution (52.3 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 100 nl mother liquor (32.27% v/v PPG400, 100 mM NaCl, 50 mM MgCl2, unbuffered)
分辨率 3.31 Å R-free 0.295
5LHZ PB3 Domain of Human PLK4 in Complex with Coiled-Coil Domain of STIL 提交 2016-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；150nl Protein solution (41.87 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 50 nl mother liquor (100mM MES pH 6.0, 191.7 mM Zn acetate, 10% Isopropanol)
分辨率 2.51 Å R-free 0.282
5LHZ PB3 Domain of Human PLK4 in Complex with Coiled-Coil Domain of STIL 提交 2016-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；150nl Protein solution (41.87 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 50 nl mother liquor (100mM MES pH 6.0, 191.7 mM Zn acetate, 10% Isopropanol)
分辨率 2.51 Å R-free 0.282
5LHZ PB3 Domain of Human PLK4 in Complex with Coiled-Coil Domain of STIL 提交 2016-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 884–970（87 aa） 片段：UNP residues 884-970
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；150nl Protein solution (41.87 mg/ml protein in 20 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM DTT) and 50 nl mother liquor (100mM MES pH 6.0, 191.7 mM Zn acetate, 10% Isopropanol)
分辨率 2.51 Å R-free 0.282
6N45 Crystal structure of the cryptic polo box domain of human activated Plk4 variant 1 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 581–808（228 aa）
链 B 581–808（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；4.3M Ammonium Acetate 0.1M BisTris propane pH 8.0
分辨率 2.64 Å R-free 0.314
6N46 Crystal structure of the cryptic polo box domain of a human activated Plk4 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 581–808（228 aa）
链 B 581–808（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；281 K；22.5% (w/v) PEG2000 3% (w/v) dextran sulfate sodium salt 0.1M bicine (pH 8.5) 24 uM nonaethylene glycol monododecyl ether (C12E9) 8% (w/v) glycerol
分辨率 3.71 Å R-free 0.309
6N46 Crystal structure of the cryptic polo box domain of a human activated Plk4 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 581–808（228 aa）
链 D 581–808（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；281 K；22.5% (w/v) PEG2000 3% (w/v) dextran sulfate sodium salt 0.1M bicine (pH 8.5) 24 uM nonaethylene glycol monododecyl ether (C12E9) 8% (w/v) glycerol
分辨率 3.71 Å R-free 0.309
6N46 Crystal structure of the cryptic polo box domain of a human activated Plk4 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 581–808（228 aa）
链 F 581–808（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；281 K；22.5% (w/v) PEG2000 3% (w/v) dextran sulfate sodium salt 0.1M bicine (pH 8.5) 24 uM nonaethylene glycol monododecyl ether (C12E9) 8% (w/v) glycerol
分辨率 3.71 Å R-free 0.309
6N46 Crystal structure of the cryptic polo box domain of a human activated Plk4 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 581–808（228 aa）
链 H 581–808（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；281 K；22.5% (w/v) PEG2000 3% (w/v) dextran sulfate sodium salt 0.1M bicine (pH 8.5) 24 uM nonaethylene glycol monododecyl ether (C12E9) 8% (w/v) glycerol
分辨率 3.71 Å R-free 0.309
6W38 Crystal structure of the FAM46C/Plk4 complex 提交 2020-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 585–807（223 aa） 片段：UNP residues 585-807
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 SMALL TUBES；pH 10；293 K；0.2 M Tris, pH 10
分辨率 4.48 Å R-free 0.295
6W3I Crystal structure of a FAM46C mutant in complex with Plk4 提交 2020-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 585–807（223 aa） 片段：UNP residues 585-807
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% v/v pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH), 0.05 M ammonium sulfate, 0.05 M Bis-Tris, pH 6.0
分辨率 3.80 Å R-free 0.261
6W3J Crystal structure of the FAM46C/Plk4/Cep192 complex 提交 2020-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 585–807（223 aa） 片段：UNP residues 585-807
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 SMALL TUBES；pH 10；293 K；0.2 M Tris, pH 10
分辨率 4.38 Å R-free 0.314
8XPG The Crystal Structure of polo box domain of Plk4 from Biortus. 提交 2024-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 581–808（228 aa）
链 B 581–808（228 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.00M Ammonium sulfate, 100mM TRIS, pH7.0, 200mM Lithium sulfate
分辨率 2.70 Å R-free 0.260
9O63 Crystal structure of PLK4 and RP1664 complex 提交 2025-04-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–275（274 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 A1CAD 5-cyclopropyl-N~2~-[2,6-difluoro-4-(methanesulfonyl)phenyl]-N~2~-methyl-6-(1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-N~4~-(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；9 - 14% PEG4K, 0.1 M Na Cit; pH 5.4 - 5.5, 0.2 M (NH4)2SO4
分辨率 2.26 Å R-free 0.264
9Y9N PLK4 in complex with Compound 25 ((R)-7-hydroxy-N-(3-(1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-6-yl)-1H-pyrazol-4-yl)-7-(trifluoromethyl)-4-azaspiro[2.5]octane-4-carboxamide) 提交 2025-09-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–269（266 aa）
未记录 A1CTV (7R)-7-hydroxy-N-{(5P)-5-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-6-yl]-1H-pyrazol-4-yl}-7-(trifluoromethyl)-4-azaspiro[2.5]octane-4-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；1.4 M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic pH 5.6
分辨率 1.81 Å R-free 0.237

共 18 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PLK4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–276； UniProt 2–275

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9y9b

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9y9b
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9y9b
沉积日期 deposition_date2025-09-13
最后修订 last_revision2026-02-18
结构标题 titlePLK4 in complex with Compound 6 (3-hydroxy-N-(3-(pyridin-2-yl)-1H-pyrazol-4-yl)-8-azabicyclo[3.2.1]octane-8-carboxamide)
关键词 keywordsPLK4, type 1 inhibitor, SBDD, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier19.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.21 Å
零角强度 I(0) i024311900.00
分子量 molecular_weight25233.0 kDa
排除体积 excluded_volume24479 ų
包络体积 envelope_volume40418 ų
水化壳体积 shell_volume18046 ų
包络直径 envelope_diameter67.4 Å
壳层 Rg shell_rg25.00 Å
包络 Rg envelope_rg19.43 Å
形状 Rg shape_rg19.14 Å
总 Rg total_rg19.98 Å
总原子数 total_atoms1923
残基数 n_residues233
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax64.5 Å
Rg (实空间) rg_real19.97 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.35 Å
I(0) (实空间) i0_real2.4310e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7720e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal19.97 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal24310000.0000
解质量估计 total_estimate0.8170
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary22.7 Å
偏度 Skewness skewness0.362
峰度 Kurtosis kurtosis-0.350
角度范围 angular_range— – 0.4000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha5397000.0000
实空间数据点数 n_real_points72
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.880; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)