Chaperonin GroEL
Escherichia coli
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 2–526 链 B; UniProt 2–526 链 C; UniProt 2–526 链 D; UniProt 2–526 链 E; UniProt 2–526 链 F; UniProt 2–526 链 G; UniProt 2–526 链 H; UniProt 2–526 链 I; UniProt 2–526 链 J; UniProt 2–526 链 K; UniProt 2–526 链 L; UniProt 2–526 链 M; UniProt 2–526 链 N; UniProt 2–526 | 未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.20 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9YNJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AON CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASYMMETRIC CHAPERONIN COMPLEX GROEL/GROES/(ADP)7 提交 1997-07-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG3000, 0.25M SODIUM GLUTAMATE, 100MM CACODYLIC ACID, PH 5.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.291 |
| 1DK7 CRYSTAL STRUCTURE OF AN ISOLATED APICAL DOMAIN OF GROEL 提交 1999-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;292.3 K;PEG4K, LI2SO4, TRISHCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19.3K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.241 |
| 1DK7 CRYSTAL STRUCTURE OF AN ISOLATED APICAL DOMAIN OF GROEL 提交 1999-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;292.3 K;PEG4K, LI2SO4, TRISHCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19.3K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.241 |
| 1DKD CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 1DKD CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 1DKD CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 1DKD CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 1DKD CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
链 C
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 1DKD CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX 提交 1999-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
链 D
191–336(146 aa)
片段:APICAL DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;291 K;PEG4K, MgCl2, TrisCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 1FY9 CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEXA-SUBSTITUTED MUTANT OF THE MOLECULAR CHAPERONIN GROEL APICAL DOMAIN 提交 2000-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
184–376(193 aa)
片段:APICAL DOMAIN (RESIDUES 191-376)
|
突变:A212E/A223V/M233L/I305L/E308K/N326T | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;290 K;0.75-0.9M POTASSIUM TARTRATE, 50MM MES SODIUM, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.292 |
| 1FYA CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEXA-SUBSTITUTED MUTANT OF THE MOLECULAR CHAPERONIN GROEL APICAL DOMAIN 提交 2000-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
184–376(193 aa)
片段:APICAL DOMAIN (RESIDUES 191-376)
|
突变:A212E/A223T/M233L/I305L/E308K/N326T | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;290 K;0.75-0.9 M SODIUM POTASSIUM TARTRATE, 50 MM MES SODIUM, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.279 |
| 1JON GROEL (HSP60 CLASS) FRAGMENT COMPRISING RESIDUES 191-345 提交 1996-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
190–344(155 aa)
片段:POLYPEPTIDE BINDING (APICAL) DOMAIN, RESIDUES 191 - 345
|
突变:A262L, I267M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;290 K;11% PEG 4000, 50 MM TRIS-HCL, PH 8.5, 200 MM LISO4, 23 MG/ML PROTEIN, 17 DEG. C., temperature 290K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.287 |
| 1KID GROEL (HSP60 CLASS) FRAGMENT (APICAL DOMAIN) COMPRISING RESIDUES 191-376, MUTANT WITH ALA 262 REPLACED WITH LEU AND ILE 267 REPLACED WITH MET 提交 1996-12-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
181–375(195 aa)
片段:APICAL DOMAIN, RESIDUES 191 - 376
|
突变:A262L, I267M | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5;pH 8.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.224 |
| 1KP8 Structural Basis for GroEL-assisted Protein Folding from the Crystal Structure of (GroEL-KMgATP)14 at 2.0 A Resolution 提交 2001-12-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
链 H
1–547(547 aa)
链 I
1–547(547 aa)
链 J
1–547(547 aa)
链 K
1–547(547 aa)
链 L
1–547(547 aa)
链 M
1–547(547 aa)
链 N
1–547(547 aa)
|
突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V | SO4 SULFATE ION × 22 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 16 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 14 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.258 |
| 1LA1 Gro-EL Fragment (Apical Domain) Comprising Residues 188-379 提交 2002-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
188–379(192 aa)
片段:Apical Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;0.6 M NaCl, 14 % (w/v) PEG 6000, 100 mM Tris/HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.257 |
| 1MNF Domain motions in GroEL upon binding of an oligopeptide 提交 2002-09-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
链 H
1–547(547 aa)
链 I
1–547(547 aa)
链 J
1–547(547 aa)
链 K
1–547(547 aa)
链 L
1–547(547 aa)
链 M
1–547(547 aa)
链 N
1–547(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;300 K;PEG, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.259 |
| 1OEL CONFORMATIONAL VARIABILITY IN THE REFINED STRUCTURE OF THE CHAPERONIN GROEL AT 2.8 ANGSTROM RESOLUTION 提交 1995-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
|
突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V 突变:R13G, A126V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 1PCQ Crystal structure of groEL-groES 提交 2003-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–524(524 aa)
链 B
1–524(524 aa)
链 C
1–524(524 aa)
链 D
1–524(524 aa)
链 E
1–524(524 aa)
链 F
1–524(524 aa)
链 G
1–524(524 aa)
链 H
1–524(524 aa)
链 I
1–524(524 aa)
链 J
1–524(524 aa)
链 K
1–524(524 aa)
链 L
1–524(524 aa)
链 M
1–524(524 aa)
链 N
1–524(524 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.81 Å R-free 0.278 |
| 1SS8 GroEL 提交 2004-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–524(524 aa)
链 B
1–524(524 aa)
链 C
1–524(524 aa)
链 D
1–524(524 aa)
链 E
1–524(524 aa)
链 F
1–524(524 aa)
链 G
1–524(524 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION;pH 8;298 K;PEG 8000, 1.72 M ammonium slufate, 4 mM CaCl2, 100mM Tris-acetate , pH 8.0, EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |
| 1SS8 GroEL 提交 2004-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–524(524 aa)
链 B
1–524(524 aa)
链 C
1–524(524 aa)
链 D
1–524(524 aa)
链 E
1–524(524 aa)
链 F
1–524(524 aa)
链 G
1–524(524 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION;pH 8;298 K;PEG 8000, 1.72 M ammonium slufate, 4 mM CaCl2, 100mM Tris-acetate , pH 8.0, EVAPORATION, RECRYSTALLIZATION, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |
| 1SVT Crystal structure of GroEL14-GroES7-(ADP-AlFx)7 提交 2004-03-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–524(524 aa)
链 B
1–524(524 aa)
链 C
1–524(524 aa)
链 D
1–524(524 aa)
链 E
1–524(524 aa)
链 F
1–524(524 aa)
链 G
1–524(524 aa)
链 H
1–524(524 aa)
链 I
1–524(524 aa)
链 J
1–524(524 aa)
链 K
1–524(524 aa)
链 L
1–524(524 aa)
链 M
1–524(524 aa)
链 N
1–524(524 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;PEG3000, cacodylic acid, potassium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.274 |
| 1SX3 GroEL14-(ATPgammaS)14 提交 2004-03-30 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–525(525 aa)
链 B
1–525(525 aa)
链 C
1–525(525 aa)
链 D
1–525(525 aa)
链 E
1–525(525 aa)
链 F
1–525(525 aa)
链 G
1–525(525 aa)
链 H
1–525(525 aa)
链 I
1–525(525 aa)
链 J
1–525(525 aa)
链 K
1–525(525 aa)
链 L
1–525(525 aa)
链 M
1–525(525 aa)
链 N
1–525(525 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 16 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG 8000, bis-tris propane, ethylene glycol, glycerol, potassium chloride, calcium chloride, ATPgammaS, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.265 |
| 1SX4 GroEL-GroES-ADP7 提交 2004-03-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–524(524 aa)
链 B
1–524(524 aa)
链 C
1–524(524 aa)
链 D
1–524(524 aa)
链 E
1–524(524 aa)
链 F
1–524(524 aa)
链 G
1–524(524 aa)
链 H
1–524(524 aa)
链 I
1–524(524 aa)
链 J
1–524(524 aa)
链 K
1–524(524 aa)
链 L
1–524(524 aa)
链 M
1–524(524 aa)
链 N
1–524(524 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;PEG 3000, cacodylic acid, sodium glutamate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 2C7C FITTED COORDINATES FOR GROEL-ATP7-GROES CRYO-EM COMPLEX (EMD-1180) 提交 2005-11-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
链 H
1–547(547 aa)
链 I
1–547(547 aa)
链 J
1–547(547 aa)
链 K
1–547(547 aa)
链 L
1–547(547 aa)
链 M
1–547(547 aa)
链 N
1–547(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2;pH 7.5;12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 2C7D Fitted coordinates for GroEL-ADP7-GroES Cryo-EM complex (EMD-1181) 提交 2005-11-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
链 H
1–547(547 aa)
链 I
1–547(547 aa)
链 J
1–547(547 aa)
链 K
1–547(547 aa)
链 L
1–547(547 aa)
链 M
1–547(547 aa)
链 N
1–547(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2;pH 7.5;12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.70 Å |
| 2CGT GROEL-ADP-gp31 COMPLEX 提交 2006-03-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
链 H
1–547(547 aa)
链 I
1–547(547 aa)
链 J
1–547(547 aa)
链 K
1–547(547 aa)
链 L
1–547(547 aa)
链 M
1–547(547 aa)
链 N
1–547(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL, 10MM MGCL, 10MM KCL;pH 7.4;20MM TRIS-HCL, 10MM MGCL, 10MM KCL
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;GRIDS WERE BLOTED FOR 2-3 SECONDS AND THEN LEFT TO EQUILIBRATE FOR 2-3 SECONDS AND THEN PLUNGED INTO LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
|
突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;277 K;Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.296 |
| 2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;277 K;Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.296 |
| 2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;277 K;Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.296 |
| 2EU1 Crystal structure of the chaperonin GroEL-E461K 提交 2005-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
|
突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K 突变:E461K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;277 K;Reservoir solution: 43% (v/v) MPD, 100mM Imidazole, 170mM MgCl2.6H2O, dissolved in the ratio 1:1.5 with 22.5mg/ml protein, 50mM TRIS-HCL, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.29 Å R-free 0.296 |
| 2YEY Crystal structure of the allosteric-defective chaperonin GroEL E434K mutant 提交 2011-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–525(524 aa)
链 B
2–525(524 aa)
链 C
2–525(524 aa)
链 D
2–525(524 aa)
链 E
2–525(524 aa)
链 F
2–525(524 aa)
链 G
2–525(524 aa)
链 H
2–525(524 aa)
链 I
2–525(524 aa)
链 J
2–525(524 aa)
链 K
2–525(524 aa)
链 L
2–525(524 aa)
链 M
2–525(524 aa)
链 N
2–525(524 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.50 Å R-free 0.240 |
| 3C9V C7 Symmetrized Structure of Unliganded GroEL at 4.7 Angstrom Resolution from CryoEM 提交 2008-02-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 B
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 C
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 D
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 E
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 F
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 G
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 H
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 I
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 J
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 K
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 L
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 M
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 N
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2;pH 7.5;20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;ETHANE. Vitrobot, blot for 2 sec.
|
分辨率 4.70 Å |
| 3CAU D7 symmetrized structure of unliganded GroEL at 4.2 Angstrom resolution by cryoEM 提交 2008-02-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 B
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 C
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 D
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 E
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 F
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 G
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 H
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 I
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 J
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 K
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 L
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 M
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
链 N
2–527(526 aa)
片段:residues 2-527
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2;pH 7.5;20 mM Tris.HCl, pH 7.5, 50 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;ETHANE. Vitrobot, 2sec blot
|
分辨率 4.20 Å |
| 3VZ6 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonines, variant with Gly 184 replaced with Ile and Leu 185 replaced Val and Val 186 replaced with Leu. 提交 2012-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
191–376(186 aa)
片段:Apical domain, UNP residues 191-376
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;288 K;0.1M Tris-HCl,1M NaCl, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.288 |
| 3VZ7 Crystal Structure Analysis of the mini-chaperonin variant with Pro 187 Gly 提交 2012-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
191–376(186 aa)
片段:Apical domain, UNP residues 191-376
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;288 K;0.1M Tris-HCl, 1M NaCl, 3.75% Glycerol, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.249 |
| 3VZ8 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonin variant with Leu 185, Val 186, Pro 187, Arg 188 and Ser 190 replaced with all Gly 提交 2012-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
191–376(186 aa)
片段:Apical domain, UNP residues 192-376
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;288 K;0.1M Tris-HCl, 1.61M NaCl, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.272 |
| 3VZ8 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonin variant with Leu 185, Val 186, Pro 187, Arg 188 and Ser 190 replaced with all Gly 提交 2012-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
191–376(186 aa)
片段:Apical domain, UNP residues 192-376
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;288 K;0.1M Tris-HCl, 1.61M NaCl, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.272 |
| 3VZ8 Crystal Structure Analysis of the Mini-chaperonin variant with Leu 185, Val 186, Pro 187, Arg 188 and Ser 190 replaced with all Gly 提交 2012-10-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
191–376(186 aa)
片段:Apical domain, UNP residues 192-376
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.9;288 K;0.1M Tris-HCl, 1.61M NaCl, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.272 |
| 3WVL Crystal structure of the football-shaped GroEL-GroES complex (GroEL: GroES2:ATP14) from Escherichia coli 提交 2014-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
|
突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;35% PEG 550 MME, 0.1M HEPES, 1mM ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.79 Å R-free 0.250 |
| 3WVL Crystal structure of the football-shaped GroEL-GroES complex (GroEL: GroES2:ATP14) from Escherichia coli 提交 2014-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A 突变:D52A, D398A | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;35% PEG 550 MME, 0.1M HEPES, 1mM ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.79 Å R-free 0.250 |
| 3ZPZ Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–527(526 aa)
链 B
2–527(526 aa)
链 C
2–527(526 aa)
链 D
2–527(526 aa)
链 E
2–527(526 aa)
链 F
2–527(526 aa)
链 G
2–527(526 aa)
链 H
2–527(526 aa)
链 I
2–527(526 aa)
链 J
2–527(526 aa)
链 K
2–527(526 aa)
链 L
2–527(526 aa)
链 M
2–527(526 aa)
链 N
2–527(526 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM HEPES, 5 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT;pH 7.6;50 MM HEPES, 5 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 8.90 Å |
| 3ZQ0 Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–525(524 aa)
链 B
2–525(524 aa)
链 C
2–525(524 aa)
链 D
2–525(524 aa)
链 E
2–525(524 aa)
链 F
2–525(524 aa)
链 G
2–525(524 aa)
链 H
2–525(524 aa)
链 I
2–525(524 aa)
链 J
2–525(524 aa)
链 K
2–525(524 aa)
链 L
2–525(524 aa)
链 M
2–525(524 aa)
链 N
2–525(524 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT;pH 7.6;50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGIN
|
分辨率 9.20 Å |
| 3ZQ1 Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–527(526 aa)
链 B
2–527(526 aa)
链 C
2–527(526 aa)
链 D
2–527(526 aa)
链 E
2–527(526 aa)
链 F
2–527(526 aa)
链 G
2–527(526 aa)
链 H
2–527(526 aa)
链 I
2–527(526 aa)
链 J
2–527(526 aa)
链 K
2–527(526 aa)
链 L
2–527(526 aa)
链 M
2–527(526 aa)
链 N
2–527(526 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT;pH 7.6;50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGING,
|
分辨率 15.90 Å |
| 4AAQ ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL, 10 MM MGCL2 AND 200UM ATP;pH 7.4;50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL, 10 MM MGCL2 AND 200UM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME
|
分辨率 8.00 Å |
| 4AAR ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP;pH 7.4;50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME
|
分辨率 8.00 Å |
| 4AAS ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | PO4 PHOSPHATE ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP;pH 7.4;50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME
|
分辨率 8.50 Å |
| 4AAU ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | MG MAGNESIUM ION × 14 PO4 PHOSPHATE ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP;pH 7.4;50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME
|
分辨率 8.50 Å |
| 4AB2 ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 PO4 PHOSPHATE ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP;pH 7.4;50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME
|
分辨率 8.50 Å |
| 4AB3 ATP-triggered molecular mechanics of the chaperonin GroEL 提交 2011-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES | PO4 PHOSPHATE ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP;pH 7.4;50 MM TRIS-HCL PH 7.4, 50 MM KCL AND 10 MM MGCL2, 200 UM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFIED WITH A VITROBOT AT 100 PERCENT HUMIDITY WITH 2-3 SECONDS BLOTTING TIME
|
分辨率 8.50 Å |
| 4V43 Structural and mechanistic basis for allostery in the bacterial chaperonin GroEL 提交 2002-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–547(547 aa)
链 B
1–547(547 aa)
链 C
1–547(547 aa)
链 D
1–547(547 aa)
链 E
1–547(547 aa)
链 F
1–547(547 aa)
链 G
1–547(547 aa)
链 H
1–547(547 aa)
链 I
1–547(547 aa)
链 J
1–547(547 aa)
链 K
1–547(547 aa)
链 L
1–547(547 aa)
链 M
1–547(547 aa)
链 N
1–547(547 aa)
|
突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 3.52 Å R-free 0.298 |
| 4V43 Structural and mechanistic basis for allostery in the bacterial chaperonin GroEL 提交 2002-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 1
1–547(547 aa)
链 2
1–547(547 aa)
链 O
1–547(547 aa)
链 P
1–547(547 aa)
链 Q
1–547(547 aa)
链 R
1–547(547 aa)
链 S
1–547(547 aa)
链 T
1–547(547 aa)
链 U
1–547(547 aa)
链 V
1–547(547 aa)
链 W
1–547(547 aa)
链 X
1–547(547 aa)
链 Y
1–547(547 aa)
链 Z
1–547(547 aa)
|
突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A 突变:D398A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.0
|
分辨率 3.52 Å R-free 0.298 |
| 4WGL Crystal structure of a GroEL D83A/R197A double mutant 提交 2014-09-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A 突变:D83A, R197A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;293 K;25% PEG 3000, 0.1M acetic acid
|
分辨率 3.13 Å R-free 0.233 |
| 4WSC Crystal structure of a GroELK105A mutant 提交 2014-10-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A 突变:K105A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG 4000, HEPES
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.256 |
| 5OPW Crystal structure of the GroEL mutant A109C 提交 2017-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 B
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 C
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 D
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 E
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 F
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 G
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 H
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 I
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 J
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 K
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 L
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 M
2–548(547 aa)
片段:GroEL
链 N
2–548(547 aa)
片段:GroEL
|
突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;291 K;0.1 M sodium citrate, pH 5.5, and 15 % PEG 6000
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.252 |
| 5OPX Crystal structure of the GroEL mutant A109C in complex with GroES and ADP BeF2 提交 2017-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric |
链 A
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 B
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 C
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 D
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 E
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 F
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 G
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 H
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 I
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 J
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 K
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 L
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 M
1–548(548 aa)
片段:GroEL
链 N
1–548(548 aa)
片段:GroEL
|
突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C 突变:A109C | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291 K;10 mM ATP, 3 mM BeF2, 0.1 M Tris, pH 8.0, 0.2 M NaCl and 20 % PEG 4000
|
分辨率 3.64 Å R-free 0.256 |
| 7PBJ Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("wide" conformation). 提交 2021-08-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 Ad
2–525(524 aa)
链 Ae
2–525(524 aa)
链 Ak
2–525(524 aa)
链 Al
2–525(524 aa)
链 Ar
2–525(524 aa)
链 As
2–525(524 aa)
链 Ay
2–525(524 aa)
链 Az
2–525(524 aa)
链 Bf
2–525(524 aa)
链 Bg
2–525(524 aa)
链 Bm
2–525(524 aa)
链 Bn
2–525(524 aa)
链 Bt
2–525(524 aa)
链 Bu
2–525(524 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7PBX Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("tight" conformation). 提交 2021-08-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 Ac
2–525(524 aa)
链 Ad
2–525(524 aa)
链 Ai
2–525(524 aa)
链 Aj
2–525(524 aa)
链 Ao
2–525(524 aa)
链 Ap
2–525(524 aa)
链 Au
2–525(524 aa)
链 Av
2–525(524 aa)
链 Ba
2–525(524 aa)
链 Bb
2–525(524 aa)
链 Bg
2–525(524 aa)
链 Bh
2–525(524 aa)
链 Bm
2–525(524 aa)
链 Bn
2–525(524 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 7VWX CryoEM structure of football-shaped GroEL:ES2 with RuBisCO 提交 2021-11-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.60 Å |
| 7XOJ Cryo-EM structure of GroEL bound to unfolded substrate (UGT1A) at 2.8 Ang. resolution (Consensus Refinement) 提交 2022-05-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 2.80 Å |
| 7XOK Cryo-EM structure of double occupied ring (DOR) of GroEL-UGT1A complex at 2.7 Ang. resolution 提交 2022-05-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 2.70 Å |
| 7XOL Cryo-EM structure of single empty ring 2 (SER2) of GroEL-UGT1A complex at 3.2 Ang. resolution 提交 2022-05-01 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.26 Å |
| 7XOM Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL complexed with polyalanine model of UGT1A from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.20 Å |
| 7XON Cryo-EM structure of empty ring subunit 1 (ER1) from single empty ring of GroEL-UGT1A complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.10 Å |
| 7XOO Cryo-EM structure of empty ring subunit 2 (ER2) from GroEL-UGT1A single empty ring complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.00 Å |
| 7XOP Cryo-EM structure of occupied ring subunit 1 (OR1) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl, 150mM NaCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.20 Å |
| 7XOQ Cryo-EM structure of occupied ring subunit 2 (OR2) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.30 Å |
| 7XOR Cryo-EM structure of occupied ring subunit 3 (OR3) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.30 Å |
| 7XOS Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex 提交 2022-05-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 K
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Sample containing GorEL-UGT1A was made fresh and used without undergoing any freeze-thaw cycles to avoid degradation in the solution.
The sample was in a buffer solution of 150mM NaCl, 20mM Tris-HCl at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3 ul of 33 mg/ml GroEL-UGT1A was placed on Holey carbon Quanitifoil copper grids (300 mesh size R1.2/1.3)
and blotted for 3 seconds (blot force =1)
|
分辨率 3.20 Å |
| 8BA7 CryoEM structure of nucleotide-free GroEL-Rubisco. 提交 2022-10-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).
|
分辨率 4.40 Å |
| 8BA8 CryoEM structure of GroEL-ADP.BeF3-Rubisco. 提交 2022-10-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).
|
分辨率 3.40 Å |
| 8BA9 CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco. 提交 2022-10-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–525(524 aa)
链 B
2–525(524 aa)
链 C
2–525(524 aa)
链 D
2–525(524 aa)
链 E
2–525(524 aa)
链 F
2–525(524 aa)
链 G
2–525(524 aa)
链 H
2–525(524 aa)
链 I
2–525(524 aa)
链 J
2–525(524 aa)
链 K
2–525(524 aa)
链 L
2–525(524 aa)
链 M
2–525(524 aa)
链 N
2–525(524 aa)
|
未记录 | AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).
|
分辨率 3.70 Å |
| 8BAA CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco, class II. 提交 2022-10-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).
|
分辨率 4.20 Å |
| 8BKZ GroEL:GroES-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 BA
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 O
1–548(548 aa)
链 Q
1–548(548 aa)
链 S
1–548(548 aa)
链 V
1–548(548 aa)
链 X
1–548(548 aa)
链 Z
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8BL2 Structure of GroEL-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8BL7 Structure of GroEL-nucleotide complex in ADP-like conformation plunged 13 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8BLC Structure of the GroEL-ATP complex plunge-frozen 50 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8BLD Structure of the GroEL(ATP7/ADP7) complex plunged 13 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8BLE Structure of GroEL-nucleotide complex in ADP-like conformation plunged 50 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8BLF Structure of the GroEL(ATP7/ADP7) complex plunged 50 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8BLY Structure of the GroEL-ATP complex plunge-frozen 13 ms after mixing with ATP 提交 2022-11-10 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8BM0 Structure of GroEL:GroES-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
链 O
1–548(548 aa)
链 Q
1–548(548 aa)
链 R
1–548(548 aa)
链 T
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8BM1 Structure of GroEL:GroES-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
链 O
1–548(548 aa)
链 Q
1–548(548 aa)
链 R
1–548(548 aa)
链 T
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8BMD Structure of GroEL-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-10 | 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8BMO Structure of GroEL:GroES complex exhibiting ADP-conformation in trans ring obtained under the continuous turnover conditions 提交 2022-11-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 O
1–548(548 aa)
链 P
1–548(548 aa)
链 R
1–548(548 aa)
链 S
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8BMT Structure of GroEL:GroES-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 BA
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
链 P
1–548(548 aa)
链 R
1–548(548 aa)
链 T
1–548(548 aa)
链 X
1–548(548 aa)
链 Z
1–548(548 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8P4M CryoEM structure of a C7-symmetrical GroEL7-GroES7 cage in presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification
|
分辨率 2.50 Å |
| 8P4N CryoEM structure of a GroEL7-GroES7 cage with encapsulated disordered substrate MetK in the presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification
|
分辨率 2.90 Å |
| 8P4O CryoEM structure of a GroEL7-GroES7 cage with encapsulated ordered substrate MetK in the presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification
|
分辨率 3.04 Å |
| 8QXS CryoEM structure of a GroEL14-GroES7 complex in presence of ADP-BeFx with wide GroEL7 trans ring conformation 提交 2023-10-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification
|
分辨率 3.12 Å |
| 8QXT CryoEM structure of a GroEL14-GroES7 complex in presence of ADP-BeFx with narrow GroEL7 trans ring conformation 提交 2023-10-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification
|
分辨率 2.90 Å |
| 8QXU In situ structure average of GroEL14-GroES7 complexes with wide GroEL7 trans ring conformation in Escherichia coli cytosol obtained by cryo electron tomography 提交 2023-10-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 12.00 Å |
| 8QXV In situ structure average of GroEL14-GroES7 complexes with narrow GroEL7 trans ring conformation in Escherichia coli cytosol obtained by cryo electron tomography 提交 2023-10-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:21-meric |
链 A
2–548(547 aa)
链 B
2–548(547 aa)
链 C
2–548(547 aa)
链 D
2–548(547 aa)
链 E
2–548(547 aa)
链 F
2–548(547 aa)
链 G
2–548(547 aa)
链 H
2–548(547 aa)
链 I
2–548(547 aa)
链 J
2–548(547 aa)
链 K
2–548(547 aa)
链 L
2–548(547 aa)
链 M
2–548(547 aa)
链 N
2–548(547 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 13.60 Å |
| 8S32 GroEL with bound GroTAC peptide 提交 2024-02-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:28-meric |
链 A
1–548(548 aa)
链 B
1–548(548 aa)
链 C
1–548(548 aa)
链 D
1–548(548 aa)
链 E
1–548(548 aa)
链 F
1–548(548 aa)
链 G
1–548(548 aa)
链 H
1–548(548 aa)
链 I
1–548(548 aa)
链 J
1–548(548 aa)
链 K
1–548(548 aa)
链 L
1–548(548 aa)
链 M
1–548(548 aa)
链 N
1–548(548 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;ATP was added to the sample immediately before disposing on a grid
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å |
| 9YKC Cryo-EM structure of GroEL-gammaATP 提交 2025-10-06 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–526(525 aa)
链 B
2–526(525 aa)
链 C
2–526(525 aa)
链 D
2–526(525 aa)
链 E
2–526(525 aa)
链 F
2–526(525 aa)
链 G
2–526(525 aa)
链 H
2–526(525 aa)
链 I
2–526(525 aa)
链 J
2–526(525 aa)
链 K
2–526(525 aa)
链 L
2–526(525 aa)
链 M
2–526(525 aa)
链 N
2–526(525 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 14 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9YKE GroEL Apoenzyme 提交 2025-10-07 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
2–526(525 aa)
链 B
2–526(525 aa)
链 C
2–526(525 aa)
链 D
2–526(525 aa)
链 E
2–526(525 aa)
链 F
2–526(525 aa)
链 G
2–526(525 aa)
链 H
2–526(525 aa)
链 I
2–526(525 aa)
链 J
2–526(525 aa)
链 K
2–526(525 aa)
链 L
2–526(525 aa)
链 M
2–526(525 aa)
链 N
2–526(525 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
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| UniProt名称 | CH60_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 B; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 C; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 D; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 E; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 F; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 G; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 H; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 I; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 J; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 K; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 L; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 M; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 作者链 N; PDB构建体 1–525; UniProt 2–526 |