9ynu

Tra1 and core modules including core tip of ctSAGA complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 225.6 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SCA7 domain-containing protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 Q； UniProt 1–1273	未记录	Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 Q 1–1273（1273 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOL Tra1 module of ctSAGA 提交 2025-10-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Q 1–1273（1273 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 Q 1–1273（1273 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0S6A1_CHATD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–1273； UniProt 1–1273

Spt20-like SEP domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0RYM2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–1192	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–1192（1192 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOL Tra1 module of ctSAGA 提交 2025-10-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–1192（1192 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 B 1–1192（1192 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0RYM2_CHATD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1192； UniProt 1–1192

Uncharacterized protein

物种未注明

UniProt G0S660

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–433	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–433（433 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOL Tra1 module of ctSAGA 提交 2025-10-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–433（433 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 C 1–433（433 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	G0S660_CHATD
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–433； UniProt 1–433

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

物种未注明

UniProt G0SH10

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–767	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 D 1–767（767 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 D 1–767（767 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	G0SH10_CHATD
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–767； UniProt 1–767

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

物种未注明

UniProt G0S770

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–480	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 E 1–480（480 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 E 1–480（480 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0S770_CHATD
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–480； UniProt 1–480

Transcription initiation factor TFIID subunit 10

物种未注明

UniProt G0RYR4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–204	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–204（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 G 1–204（204 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0RYR4_CHATD
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

Putative transcriptional coactivator HFI1 protein

物种未注明

UniProt G0SED0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–485	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNV Histone Acetyl Transferase (HAT) module of ctSAGA 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–485（485 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 H 1–485（485 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOL Tra1 module of ctSAGA 提交 2025-10-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 1–485（485 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 H 1–485（485 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0SED0_CHATD
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–485； UniProt 1–485

Transcription initiation factor TFIID subunit 12

物种未注明

UniProt G0S2A1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–770	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 I 1–770（770 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOL Tra1 module of ctSAGA 提交 2025-10-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 1–770（770 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 I 1–770（770 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0S2A1_CHATD
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–770； UniProt 1–770

SAGA complex subunit Spt7

Thermochaetoides thermophila

UniProt G0S267

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–1196	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） Non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （G0S842）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 K 1–1196（1196 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0S267_CHATD
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–1196； UniProt 1–1196

Non-specific serine/threonine protein kinase

物种未注明

UniProt G0S842

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–3893	未记录	SCA7 domain-containing protein × 1 （G0S6A1） Spt20-like SEP domain-containing protein × 1 （G0RYM2） Uncharacterized protein × 1 （G0S660） Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 1 （G0SH10） Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 1 （G0S770） Putative transcription initiation factor × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 1 （G0RYR4） Putative transcriptional coactivator HFI1 protein × 1 （G0SED0） Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 1 （G0S2A1） SAGA complex subunit Spt7 × 1 （G0S267）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YNU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YNW Tra1, Core and minimal HAT modules of ctSAGA, composite. 提交 2025-10-12	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–3893（3893 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9YOL Tra1 module of ctSAGA 提交 2025-10-13	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–3893（3893 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YOQ Core module of ctSAGA 提交 2025-10-13	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 1–3893（3893 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G0S842_CHATD
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–3893； UniProt 1–3893

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ynu
沉积日期 deposition_date	2025-10-12
结构标题 title	Tra1 and core modules including core tip of ctSAGA complex
关键词 keywords	ctSAGA complex, Histone Acetyl Transferase (HAT) Module, Tra1 module and Core module, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	82.02 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	82.74 Å
零角强度 I(0) i0	6982600000.00
分子量 molecular_weight	720460.0 kDa
排除体积 excluded_volume	906880 Å³
包络体积 envelope_volume	1553800 Å³
水化壳体积 shell_volume	162270 Å³
包络直径 envelope_diameter	286.6 Å
壳层 Rg shell_rg	73.06 Å
包络 Rg envelope_rg	82.47 Å
形状 Rg shape_rg	82.71 Å
总 Rg total_rg	82.73 Å
总原子数 total_atoms	100918
残基数 n_residues	6318
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	225.6 Å
Rg (实空间) rg_real	78.37 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.98 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.7720e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1780e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	79.68 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6937000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8970
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	83.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.369
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.541
角度范围 angular_range	— – 0.0950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.1610
最高正则化参数 α highest_alpha	435500000.0000
实空间数据点数 n_real_points	20
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.939; Stabil: 0.976; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.044

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SCA7 domain-containing protein
分子量 formula_weight	137082.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q
原子数 atom_count	100918

MDSRKDEEATIKVAPAKGTVLASKPHIWGKLKLKKPPVKQIKPGNWKEATLVEDKKKDKDGGAINAASPGPDVNQLDDRARDTFSNGRPLEDVLELLQCKLCRKGISRTAARDHIAKCLQIKKEKAQRKKEAREARERLKEAAREEEARRLEEEGAAKGDDDSDDDDGKEGAGKAGKKTKKTDVAGKKRKAEGELDKGKAKKKKDEPKPKVAKPKGPVDVERQCGVPLPNGQLCARSLTCKSHSMSAKRAVPGRSLPYDMLLAAYQKKNQAKQQKAALDANAPLEDEDDLNAGAVDSDEETAAVMSALANWNPQPVVPQPVFAPLKRQYQLARLHEQLQAATNGGRTNIFKVVGFGAQRLSDGHLGLYDAEDAPGEPDPVGLGSLSRRSSSIVAGEDDTTQQAQIAAVDHESQKEDAPLAEVCKKPCWKPKDRPGSVLDQEYVPMSGRSLSKVTKLKATGRAAANRQPKQSRRAASAIPESSKPLADAPVNTIVSKSSPALPTATPLYAFANLPTTDLRLQPAELAIQEMRKRLIAASSSSQSSISSTGVRAPRGRKRKEDRSMPGIHGSQPMENIHRATDGVRQTPENMAPTPKESPSDSTVEMRVLELGQLLAQEDSLAKSSPVLPNTPVVSLLGTSQNGATNGLKQGVQHIQRQMATKPTSVSRAISHSPMSSRPLFSAPSPPMMSHSLSPLTRAATPKALSSSPLVMSMLLPQQPPSHPFVSLPSGSTLSQAMQQSPIMTSMSKSGLTPAATRQPSPGVMPHSPPPRQGPGRPPKPRPADPVSPVNPTRSPNLPNASYLTTLGDLSTGMQPPQLPHMPQQQVPRVKLNQMRNQALASTFSPRPSYLPSQRLDPIREQAIKRAAERAAGLRMAQAQRQPQMQVHMNVQAQRTPQLQARTSPPTASPAETQGQMLSARAQAEDQGQNRLRMGQPQANTQLMRIDGPGMAAGMRQPIGNSQMDTMQPQRQVMNTPVVPAPQSSSPPSAERSSSQPQPVRDQIDSASVQAEAAQDETMNLDNDEMDDILREVKAQAEREAERQMAALSRTRPQAQQQAQNLRSTQNQSQMHALSPVASESSSPSLVMSASLPGLNEVNVRATVAAAAKKVAGSISPVANISSAATALSSPLDCRPYTTTSIPRPRLATTAPVPLMGATGPPAASGTTQNIGSFHVQQHRQRRQQQQLLQQHAQQHQQRLQQAAVHNNQQPFRFTYPAESMAAAVAIAGAHNLRPVVPLPPQAYLLSASQGGGRSGSRGSNIRNGSQARTQEQG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Spt20-like SEP domain-containing protein
分子量 formula_weight	128449.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAPTVTAAAPPVNPPSATKVKRPIPPGIQTNGVAPSRSSPSPSMAAKRAPSAVRQPSNPPSAGGTTPGATRPTIRIRRDPGPGPPLGRGQRSAGLRSASIATDPVTSPTFDAPPYVITPEYILKKFAGHPPSLIVHLYQNHFRFDQQEGMFQYKSPMRIFIEHLRNRTVPHEIMEYLIQGGVPFYEGCLIVQVFDHRTVNQTKEAAKPSSESSKTVPFSIHNHNPYITPSPYVPYPKEDTPADGSQTPASEKPSEDKDKENMPAPPVPADGQKAKGEPAKPTVYTVVLMPTAQALHTDLLLKTVTPRGASDSGGPPPTPHTAGPPPTPTAAGMPPPAKKQKRDHMELDPKNIYEVEAKILLATYPKLDLEPTKNAEETIAKLEKLAHPEHSHKPPEPKVRKRTVAEVAHDEALAAEQERYMLTLDERLSSKLAGAQAGANGADGDGQAPSASWEPRFERFKLIENIKQEHAEKKEQERIKQAEQERKLLQQKQEAAILQARQQQAEMERKRQEQIVLQQRQEAQRRLQQAQAAPVAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQARAQARAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQQAATAATMGQTPHAHPMQPSPLPAGMTAGMPVSMAQQAQARFSQVSQPQQMSSPIVQQGTPQAASSPMPPMAAVAMQHSNSNMGQAGSPPRPPSVVQNHPMGVPMAPSMSARGSQQSHAAGTPRVPSATPNIPHATPITRPQVVPTPRMTQASPPAGVMTPTPQQMGQAMLMNNQGIAQMPNVNINSLAAAQQMAAQQRLIQQYQQQLQQSGMVPGNVQANMLQQQLAARQQMMIQQQLLAQQQQRAGQMMNPNIQAQLAAQYQQSLNNMQQQQLAQMNPMQAAHMRQLLAAQQAQRQGMMGVNVNVNGMTPQQLAVMQQQIQLQQQAQLIQQQQQQQQQLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQAAQQQPQPGMPGHPPQAAVAPTAPQVPIAQLQPPQNQLAALMMNPAVQNQIRNHSNALYSKNLPALAERFGGNAQNIPPEALAEFRQKCLNQAKVQVLSMLQQQQAGGRLAAGLPPQVQAAQVQAMQQQAQALAVAQAQVQAAQQAAAAQAAQQQGGMGQGM

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Uncharacterized protein
分子量 formula_weight	48541.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MALSDNNPEEVDGMFLSNLRSDLELEEIWRMLQSGVTSPEDSQPTVSLDASSSGDKTMSSESQVALQDDADDELLVSILAGKVPLSELLANDNELLQSDGLSSAVCSADSDQEEDDNNDAGYGEEPDPRDVIANWFELCQMMYVSGETGEPSLETTGIIEDIVRQQVIEIIRHDAPKVSRLRTFLAWKDVRKNVKDSDDKGADADIAPGDDPVGAVVPGATVDDTARKTKKSRVGLPWEPASFYSVEVPEREDEEDEEEEEMNYITLQRLRKADERTKAMTKEEYVTWSEFRQASFTYRKGKRFREWAGFGLVTDSKPSDDIIDILGFLTFEMVQTLTEEALKIKEQEDLHRERTGENQSNANNPNGSANSSLSKKRKLTGGGGLFDPPNEGRTPVEPRHIQEAFRRLQQRPKKARAMLNGTKLQQRTQLKLF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 5
分子量 formula_weight	83784.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSNPAPQAAGQGAAGTPYGNPPPSAGGAGSGSAGASAPSTTPSAQNLNQIVTDYLKKKGFTRTEAVFRQETAHLGPDGRPVNRNDDPGPKKYLKAFLLLKNWIDNNLDIYKFELRKLLWPVFVYSYLELVSQGYVDDAKHLLETLRSHFEAVHQDQLALLDTVTLPQHVSENHTTRLYRENKYRIPLNQSLSGNLFHFLEREADNGGATIIYILQTHCSVETSARGPIEPYSFEAIYRRARNLDLDEADAHEGIPGIFTGVTNRDVLDTSARLKLGPLPMEPELREDVRAELEEEDQRNPPMDNRPTLVEEFDKKIKREESADSPSRNDLPLPASRARDVVMEMQKVRENRDRFVIEGRTGGIGIPVSACMFTFHNTLGTVSCMDFSNDHKLVAVGTMDSYIRVWSLDGKPLKSALENEKNLKVNNRKLIGHSGPVYGVSFSDSIANLDRNIYGEGDDKKPDTSSKLLLSCSADGQIRLWSLEIWACLCIYKAHDGPVFRVLWGPHGHYFASAGWDKTVRVFTQDHASAVRIMVGHDTSISALAWHPNGTYVFSASDEMDKSIRMWSVITGNCVRIFTGHTHYITALECAHNGKILASADTGGNIFIWDIEKGTLIKKCRGHGKGGIPSLSFSAESNVLVSGGLDCTVRVWDIELPADPNKNNPLAPSTTQSGQQSDGTTATGDTIAVGGSADGRNITVGGQGTQAGGAGTSGSGVAGAVTGKKKAKEVQITPDQISAFATKKTPVLKVRFTRMNLIVAGGCYDPER

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 6
分子量 formula_weight	52463.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MATNEGPKLLWNPENVRDVADALGITLSEEPLRLLAQDVEYRIGQVIVESLRFMRAANRTTLTVQDVSLALRVLDVEPLYGYESTRPLRYGEASLGPGQPLFYIDDEEVDFEKVINAPLPKVPRDMTFTAHWLAVEGVQPSIPQNPTTAETSSKDLLPKGPGANPALAALAGNDNVSFRPSVKHVISKELILYFDKIQAAILDDDPDEEKMRLRQAALESVRSDPGLHQLLPYFVNFITNQVTHHLDDLFILRQMMELAEAVVQNPTLFIDPYASALAAPVLTCLMSRKLGKNPSSNDEGALGAGNSIDSTLREQYSLRELAASLLSMIARKYGASNALLRPKLTRTCLKHFLDPTRPPAVLFGAISGVAASGGPEAVRVLVLPNLKTFDSAVLQPLREKAGPVAELEYEMLVGGIVKAVQSIVGDQAALGALTNGINGADLTREGEQVIEFLGPIVGQRIAQLRNHTLNRSILEVRHLE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Putative transcription initiation factor
分子量 formula_weight	28834.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSAATTAPQTNGILPSTTASGAQTISNTPQPSTSQPAPSATPAQSQTPATTQPQQPTSTTTPSPRPRDARTLELLLTAQGVTSFEPRVSQLLLDFAYRHTAAVLSDALHLSADPYISHAGARPSASSGAAPVNVGEASITANAVALAISSRLGYQFRGGGGGYYGGGGGGASKDWMLELARERNKVALPRVLPSEWGVRLPGERFVLSGVSWGLKDVWAGQEGESEEESEPEEQGDKMEVDENGKNGEAEDGVEVEGGTMEDVFGDEGLEDEEMGEA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 10
分子量 formula_weight	21417.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MATNQSIDNSVSQPAAPTASANGTSQPAGETTSMFPGIPSASVPEPKLPTRKDASLREFLNKMDDYAPIIPDAVTNYYMTRAGLPPPPQTDIRLARLLALATQKFIADIAADAYQYSRIRASNTNANNPMGSLGAAAGFPIPGQPSNQPGGKEQGRGGPLGIQRPGYGGGGQGGSQNRTVLTMEDLGMAVSEFGVNVKRSEFYR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Putative transcriptional coactivator HFI1 protein
分子量 formula_weight	52133.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MVDINPAALSRPSIGLSTPSFPGKSGSINVSVPSSASASASASSAHSKPQKTSLVPPRIDLEPIYTALKAAIGAEQWPVYKETLTNFLIGRLNQAELSERIDPILASQDGQKEHLHNQLIAAIYANVTREMPDPGLAPWVSANDKPTTAQTKPVTGDANERRLKGEVMQLPARDRRRIKELAHNDFDPYDALANVLMEHARAKPPKIAEPPASAGGLKMNFDLEIRKRYAQPLAVESGEFPDTSNIESRMLPFCYEAGLSSGHAPDAAQFMSIATETFIKEVMSAIFSRTRSNGPGDSGSAGFGLGSGWIQTHRYRKQLAKEEEAFQRGEISRDKMGLLPVEAKAASERGPLGMADVRLALEMGDCGLAGFPVIVKSVIYGWREGELENWEDYTYVDPSRPDGIAIPSRGDGDVEMGGVGVNGVVKGEPEPQQQPLANGVHDVDAMDIDGVSVAGGAANEIWWEGAEPETSDLLNAVLDSCLAVN

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Transcription initiation factor TFIID subunit 12
分子量 formula_weight	83091.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MNQTPAQGQGQGQPGQGMANRPPNAPSAANVAAPGGAPRQQGTPMYRPEMMRNIPLLSDEEKTKYERGLQQLWLMHDNTAPGSAENIEAKKKIAEFGRVLLTKLQQRRQQQQLQQQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQVQQQMQQQAQQPQTQPQQGQPQQQLQQAQVQQQVQQQQQIPQQQQQAPQQQQQQQQPQQLGQPGQQVQMMPQNQQPQVAQNVQPVAPTTVPQQQPAPATQTAPNQMGAPNSAAAQLRSLPAHIVSHVKDVTFLAPNNVVDKAGWIDQLKLQYAQKLFVMDSAGRQIKQIAASLADQSLPPEERKKLEEKKQTLEKQYNDAISFANTVRKQYMQKPAQNGAAVQNAANVARPQSAQGASAMTQPGAGVGNGTPVAAPVNPMQSSAAAINTAIETAKKQQMAAGRMAGAVNAMAAQVQSPATPVQAQVSPATQVHATQQSVPQQPQQIQQAQPTQQPQAQVKIEPGTAPHPAPLNTTMAGPTGVPSAAAPAQNAARMQTPTSATPTSANPNIRPLTHAAAMNLASQQRPGMPAVPTAASGAAPGTPMGIMGAAQQQQQQQPGHSHAHPPQPTQAPPPHSTNPKLPIPKVLHDKAIQMPQPVPNIGGAGSGRPTYTSGVMNQPALPKTPAFQLEGEGERVLNKKKLDELVRQVCGGTAEGQDGNMLTPEVEESVLNMADAFVDNVLHQACRNAKERGSKVLEIRDIQLVLERVYNIRIPGYASEELRTVRKVQPNSNWIKKMSAVQAAKVVPGKGDI

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	SAGA complex subunit Spt7
分子量 formula_weight	134981.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MSIANGNHPWPSPGGPFTNGGPPRTPSAALDARPHDASQTTSLSLMPEASSATDINSDDIDHRRALFADLFRRADERLNLLFDERGEYNLSAIESFKRPPSPPAPSLLPPVTDHTPIQEPPRKRAKRVIDEDDYGDDDEEDEDDKPVDKKPPQQTSQLSNNVLLSPSKTSESPAHSSPSPEKQALEKPPETSQQQLGQGQQQPKSTEDARKELEQARIATEEIAKRSFHTLFYTLEHDRTAMLEQQQLEESEKQLQAEMDKAGSGNAQQNQPGHGSLSSANLGASSLTLKHLIARIDQKRERVRASDAELRSLMNEVRKNRSKWASEENIGQEELYEALEKVLSELKAHTEYSTPFLQRVSKREAPDYYTFIKQPMDLGTMTKKLKSLQYKSKAEFVYDLNLIWDNCLKYNQDMNHPLRRMANGMRKEADKLIPLIPDITIRSRAEVEAEERRKQNGGVDDDAGDDSDDEPIMSSRGRVAGTKGTSNKSRKAPKEGTPAAGDQKPVVQVNGVQVKGQREGSEAVDGSNGLGTPPVGGSATPAPGLNGHGSSQNADAMDVDGPSINGMALVGEEAAEQTYEDEAYKIWKQVTKKDRALIAKERYQLFANNKLNVEEPALLRTKAGMRRFLKSRREAEALGLIKTAYSDSSVTSSAGAKDGVAPKPNETLAEGMEEEADRAVPSYYEPQTIIPDIDPKLQWVEDGEGQVINQFEDMLQLVPPGHFTAPSSRLTRRIDANIRQMQETRKLCSKIGVIKQMQIQTHPFVEADIEPHYISGEGPVMAGEVCRSALQRSVAKIFYHAGFEELQPSALDCITDIASDYFQKLVRTFNVYREAEKKPATGAAAERGARFVPRFTPEEVILHTLDENGHDIDSLEAYARDEVERLGNKLAQIHERMKGHLADLLRPALAPDAGADGSGAFNDGSEQFVTGDFAEELGEDFFGFRALGLDKELGLDMLSVPLHLLQSRVRSQYQLQNQAGAGSAAADLFEPLPPPEPVTKESIMNEIGLVRNFFLAKLHASGDKPLVEDEDLPPKQRKARPRLGATGKIVSPQKRSPKEQMALAKKKKKLEQQQQQQQAQQQEQGKGDNKKGAAKTVSLSLPQPAAGQQVNGLTLPSLSAPNPSSQGGEVNGESIVVNTSLSDTQQSGDVTTTQGEKDLEMEMEMELEKAAGDEDGMDDGDMVFEAGMMSPESLERGSDYKDHDGDYKDDDDKGLEASENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Thermochaetoides thermophila
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	209285
宿主生物 host_organism	Thermochaetoides thermophila

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Non-specific serine/threonine protein kinase
分子量 formula_weight	444670.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MATSLIEDVVKKLSVAETGTGNSLSERSLLVLPLMQVSCYTELKVKAEAACALRDSLDHYTAGPAYPAFLKKVMPVFIHILRQQPVFQTTGEQGHMQKLRNCILEILHRLPTSQTPPEHFEPYAHEIVDLLLELVRTDNEDNVILCVKILSDIMRHQHKIMSGKVQTFLNLIQELFEQLDKVVRDQLDNTSTTGPPGPPSTPGSTQSSFLPHQQSPRPGSPVTTGVTDFGADANQQANRLLPRGMYSFKVLAECPIIVVSIFQVHRSAVTPNVKAFVPLIKSALLCQAKAQDQAHREAAARGTIHIGVSPNIKNRAAFGDFITAQVKTMSFLAYLLRQYSSQLSDFLPHLPDIIVRLLRDCPRDKSSARKELFVAIRHIINFNFRKIFLPKIDELLDERTLVGDGLTVHETMRPLAYSMLADLIHHVRDQLSPEQIRKTVEVYTRNLQDNFPGTSFQTMSAKLLLNMAECIARLPNKVDARHYLIMILNAIADKFAAMNRQYPNAVKLSKQYAQQAAKNVPETYLADKENPPDWDEIDIFNATPIKISNPRDRAADPVVDNKFLFRNLMTGLKNTFYQLKSCNIPGAVDLTGAPAHWTDVAYGFTAEEVKVIAKLFREGAYVFRYYEIEKPAAESPYSSPVEYMANFYMVSSSKEEKELLETFATVFHCIDPATFHEVFQQEIPRLYEMIHEHTALLHIPQFFLASEATSPSFCGILLRFLMERIEDVGSADIKKSSILLRLFKLAFMAVTLFANQNEQVLLPHVVDIVTKSIELSTKAEEPMNYFLLLRSLFRSIGGGKFEHLYKQILPLLEMLLDVLNNLLMAARKPAERDLYVELCLTVPARLSNLLPHLSFLMRPLVVALRAGTELVGQGLRTLELCVDNLTADYLDPIMAPVIDELMTALFDHLKPHPYSHFHAHTTLRILGKLGGRNRKFMTEALPVTFQQYVDDRASFDLRLIGSKRDRAFPAHLGIDLAIQKLTEIPKPVKGGVPQLSRQYDPYYKRQALNLIIAQTKLRVGFDSVPEDLPRLVRLQVEDLVKKNRDVDISLFEVSDKERSIAKKNEEQALLKRLLKALLYAESIPEFKQEVDALLVNLARHFTLIEIGRSVIDMKKAYTPFDTKSGEGPLFIDNRVLSEAILESLANENLEVREAAKRLIKEMHNAAVTVFGSPMHVPRMTFWSSLASTFCHGCYEEEWFTKQGGALGIQTLLTEIDLGDLWVAAKQIEFVRALMYVVKDMPQDLPEKTRRTAQVTLEQLLARITRNAKKQDCLPPPPPPAPPGSHPPQPPPRPPRLAQLVMMLNSELAHMNRHVRATARRSIEAIAAAAQAEVWELLEPHKKHILGPIYAKPLRALPFAIQIGYIDAVTYYMSLKRDFVPFDENLNRLLMESLALADASDESLAGKTLEFRTHDFIVNLRVSCIKILSRAMSFEEFGSGSNNPTRPKVVSVFFKCLYSDSQPTIDAANDALKAVLQHTTKLPKDLLQSGLRPVLASLQDAKRLTVHSLDNLGRLLRLLTTYFKVEIGTRLLEHVKQIADPNFLQQLSFTFFEQNNAMKVIAAVFNIFHLLPDAARQFKERVIDNVLDLEQKLRRTHHSPFRLPLYKYLNKYPSDIWAFTLQKLEDLRYGRFLAQVLRHPDSQVLRDYGAANVEFIIKTCNTVVVSGKETKFIAIINTINMLDALCQFPTANSQSWLDNKEHIEWLKTVGKELELQQKKNSLTPNLRLPAHQASEQLMNILTKALDRNPNDLDALFSLVEGITSDDFRETPALLSHIYNKIIRSDSIDFWRITILRCLDIYSGKTASQRMKWYLLHNIVNPIIAMDVMRTWDDPNKASRLLDRTVIDSINTKIWKVNLPDPQEDLLQPRVDHTRMEVLQLSAMLVKYRHALLQDARKDFIKFAWTYIRLDDVINKHAAYVVIGYFIAHYETPAKIVSQIYFSLLKTNQNEGRALVTQALELMAPVMPKRCPFPPGDRNPVWALAPRRILAEESQNVQQMTAIFHYLVRHPDLFYDTRDKFAMLIIQCLRKVASPPNPSNDNRKLALNMMWLIWQWEQRRVESKLSEPLRAPSESPNSNKRKLDEQQGLSPSATRQAEFQIPSVGRHKMIRYLVEFIAQLNERYPLPSARPSDPPTTTSFLLPSPSNELCKKATALLYNLLQPQYWGDLVEEMDLFPNVTDLVLAGEKSATLLSADPSDPEKCDDKLITSIINTLQVVRIVLHFKSDRWILDNMPQIQKILEKCLKSANPEIQDCLHMADRKYDGDRDVKPTIKRILDAVPEDIPMEDADGDIEPESQTSELIAWLSGIATESMAAGNYVSGINILWSLGHRKPSIIDQHIPAIMRSLQSKLARDHVSHYAALGHQASGLRPQADPNAPTEMKAYDLEIQTNLILKAIEVTAMRMEILGDNRRPFLSVLATIVEKSLHIPLCEKILEMVEGWVFRSEGTWPTLKEKTAVLHKMISFEHRTDPTMLHKFLNLVLRIYEDPKITRTELTVRMEHAFLIGTRAQDVEMRNKFMSIFDKCLSKTASARLAYVILGQNWDTLADSYWLAQASQLLLGAVDMNPTIQLHQDDFRTLPISQLVAPYAKDSREPSVMIDDKFEAFMANHRRFLAELGDVRARDVLEPLMQLQHIDANFAHELWVALFPMFWSAVPKEDRPDLERGLVTLLTKDYHSRQMDKRPNVVQSLMAGAVKTWPHCKIPPHVLKFEAKTYDAWYTALHQLENAAIKPEIDSAAVRESNLDALVDLYSTLGEDDLFYGTWRRRCQFVETNAGLSYEQHGMWEKAQRMYESAQIKARTGVIPFSEAEYMLWEDHWVLCAQKLQQWEILQDFAKHENFQDLLLECAWRNTEYWQNQENRDQLDTVIKGVMDAPTPRRYFFQAFMSLLKLHNKQETPQDFNRVVDEAIQLSIRKWHQLPKRLTAAHVPLLQNFQQLVELHDASVICQSLAQTNASNLDVKSGELKLLLGSWRDRLPNMWDDIVAWQDLVTWRQHVFGLINATYLQLIPQQAQNAGGASFAYRGYHETAWIINRFAHVARKHALPEVCISQLSRIYTLPNIEIQEAFLKLREQAKCHYQNPDELTSGLDVINNTNLNYFSAPQKAEFYTLKGMFLEKLGQKEEADTAFGTALYFDITAAKAWAEWGYFNDRKFKENPSDLPSAKQALTSYLQAASSYKNHKSRKLIARILWLLSLDDANGTIAAGFDDFKGEIYVWWWIIFIPQLLVGLGYKEAPRVQAILLKIAKTYPQALYFLLRTNREDMLTIKKNQEAKERARQRAAQAAIPNKPNGSPQLTKKDGAAGAADGRPPTANGETPKPPEIKIEGAAPNAPTAATPQAAANAPQVPGAAPAEQQTGGVQKKPPWELTEEIMSVLKTAFPLLALSMETMVDQIQKHFKCPPDEDAYRLIVALLNDGLSYVSRMPASYAKDVKLPAATENNITRFAETILPNHIRPTFEADFVKVKPTMYEYIHNLRKWRDKFEEKLDRRASPAPLESFAHYSPHLSEFRYQKFDDVEIPGQYLQHKDKNQDFIRIDRFLPNVDLVRTIGASHRRLRIRGHDGSVHAFAVQHPAARHCRREERVLQLFRQLNQTLANKKESRRRDLQFTLPLMVPLAPHIRIVQEDTSYITLQSVYEDHCRRHGMNKDEPILFTMEKLRGLMDAKALQKPEQAVTAKLEVYRAIQEKFVDHTIVLEYFQGAYPNFADFWLFRRRFSYQLAALTFMTYTMHIDKRYPHKMNIARGSGNIWGSEAVSYMAPSRPLFQNTEPVPFRLTPNLQTLMGPLATEGIFAASVMAIARCLTEPEQHLEHALTLFVRDEMMFWFTNSHRTMSLTENQLRETVQANCDMIVKKALALAQTPQGNLPAHQTVTDLIAKATNPMNLALCDALWMPYL

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	171646

fit	/app/data/saxs_computation/yn/9ynu/9ynu.fit
pddf	/app/data/pr_computation/yn/9ynu/9ynu.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/yn/9ynu/9ynu.dat

Tra1 and core modules including core tip of ctSAGA complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SCA7 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Spt20-like SEP domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Uncharacterized protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Putative transcriptional coactivator HFI1 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription initiation factor TFIID subunit 12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAGA complex subunit Spt7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Non-specific serine/threonine protein kinase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)