9yxd

Crystal structure of recombinant human follicle stimulating hormone in complex with an anti-FSH alpha Fab

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 123.5 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glycoprotein hormones alpha chain

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 5 其他聚合物 1 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–116	未记录	Follitropin subunit beta × 1 （P01225） Fab light chain × 1 Fab heavy chain × 1 Ig-like domain-containing protein × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.05 M Calcium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 7, 30% v/v PEG 550 MME	分辨率 2.29 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9YXD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DZ7 Solution structure of the a-subunit of human chorionic gonadotropin [modeled without carbohydrate residues] 提交 2000-02-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.1；328 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR样品组成 90% WATER/10% D2O	分辨率未提供
1E9J SOLUTION STRUCTURE OF THE A-SUBUNIT OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN [INCLUDING A SINGLE GLCNAC RESIDUE AT ASN52 AND ASN78] 提交 2000-10-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.1；328 K；离子强度（mmCIF原始值）100	分辨率未提供
1FL7 HUMAN FOLLICLE STIMULATING HORMONE 提交 2000-08-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；0.9 - 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M glycine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 10K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1FL7 HUMAN FOLLICLE STIMULATING HORMONE 提交 2000-08-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 25–116（92 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；0.9 - 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M glycine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 10K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1FL7 HUMAN FOLLICLE STIMULATING HORMONE 提交 2000-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–116（92 aa）链 C 25–116（92 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；0.9 - 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M glycine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 10K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1HCN STRUCTURE OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN AT 2.6 ANGSTROMS RESOLUTION FROM MAD ANALYSIS OF THE SELENOMETHIONYL PROTEIN 提交 1994-07-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å
1HCN STRUCTURE OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN AT 2.6 ANGSTROMS RESOLUTION FROM MAD ANALYSIS OF THE SELENOMETHIONYL PROTEIN 提交 1994-07-01	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å
1HD4 SOLUTION STRUCTURE OF THE A-SUBUNIT OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN [MODELED WITH DIANTENNARY GLYCAN AT ASN78] 提交 2000-11-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.1；328 K；离子强度（mmCIF原始值）100	分辨率未提供
1HRP CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN 提交 1994-08-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.314
1HRP CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN 提交 1994-08-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.314
1QFW TERNARY COMPLEX OF HUMAN CHORIONIC GONADOTROPIN WITH FV ANTI ALPHA SUBUNIT AND FV ANTI BETA SUBUNIT 提交 1999-04-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；1.8 M ammonium Sulfate, 100 mM tris/HCl pH 8.0, protein concentration 3 mg/ml	分辨率 3.50 Å R-free 0.310
1XWD Crystal Structure of Human Follicle Stimulating Hormone Complexed with its Receptor 提交 2004-10-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；PEG 3350, lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
1XWD Crystal Structure of Human Follicle Stimulating Hormone Complexed with its Receptor 提交 2004-10-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；PEG 3350, lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
7FIG luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor(S277I)-chorionic gonadotropin-Gs complex 提交 2021-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 X 1–116（116 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7FIH luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor(S277I)-chorionic gonadotropin-Gs-Org43553 complex 提交 2021-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 X 2–116（115 aa）	未记录	55Z 5-azanyl-N-tert-butyl-2-methylsulfanyl-4-[3-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)phenyl]thieno[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7FII luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor-chorionic gonadotropin-Gs complex 提交 2021-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 X 1–116（116 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
7T9I Native human TSH bound to human Thyrotropin receptor in complex with miniGs399 (composite structure) 提交 2021-12-19	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7UTZ Human thyrotropin analog TR1402 bound to human Thyrotropin receptor in complex with miniGs399 (composite structure) 提交 2022-04-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 25–116（92 aa）	突变：Q13R, E14R, P16R, Q20R	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
7XW5 TSHR-thyroid stimulating hormone-Gs-ML109 complex 提交 2022-05-26	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 X 25–116（92 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 HOI ~{N}-[4-[[2-methoxy-5-[(2~{S})-5-oxidanyl-4-oxidanylidene-3-(phenylmethyl)-1,2-dihydroquinazolin-2-yl]phenyl]methoxy]phenyl]ethanamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 14 PLM PALMITIC ACID × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.96 Å
8I2G FSHR-Follicle stimulating hormone-compound 716340-Gs complex 提交 2023-01-14	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 X 25–116（92 aa）	突变：F17L	CLR CHOLESTEROL × 13 PLM PALMITIC ACID × 3 MYR MYRISTIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 O6F N-tert-butyl-N-ethyl-8-methoxy-9-propan-2-yloxy-1-thiophen-2-yl-5,6-dihydroimidazo[5,1-a]isoquinoline-3-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.80 Å

共 15 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLHA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–92； UniProt 25–116

Follitropin subunit beta

Homo sapiens

UniProt P01225

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 5 其他聚合物 1 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 19–129	未记录	Glycoprotein hormones alpha chain × 1 （P01215） Fab light chain × 1 Fab heavy chain × 1 Ig-like domain-containing protein × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.05 M Calcium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 7, 30% v/v PEG 550 MME	分辨率 2.29 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YXD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FL7 HUMAN FOLLICLE STIMULATING HORMONE 提交 2000-08-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 19–129（111 aa）	突变：T26A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；0.9 - 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M glycine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 10K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1FL7 HUMAN FOLLICLE STIMULATING HORMONE 提交 2000-08-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 19–129（111 aa）	突变：T26A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；0.9 - 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M glycine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 10K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1FL7 HUMAN FOLLICLE STIMULATING HORMONE 提交 2000-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 19–129（111 aa）链 D 19–129（111 aa）	突变：T26A 突变：T26A	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；283 K；0.9 - 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M glycine, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 10K	分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1XWD Crystal Structure of Human Follicle Stimulating Hormone Complexed with its Receptor 提交 2004-10-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；PEG 3350, lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
1XWD Crystal Structure of Human Follicle Stimulating Hormone Complexed with its Receptor 提交 2004-10-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；PEG 3350, lithium sulfate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.92 Å R-free 0.259
4AY9 Structure of follicle-stimulating hormone in complex with the entire ectodomain of its receptor 提交 2012-06-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (V/V) ISOPROPANOL AND 20% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000	分辨率 2.50 Å R-free 0.269
4AY9 Structure of follicle-stimulating hormone in complex with the entire ectodomain of its receptor 提交 2012-06-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (V/V) ISOPROPANOL AND 20% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000	分辨率 2.50 Å R-free 0.269
4AY9 Structure of follicle-stimulating hormone in complex with the entire ectodomain of its receptor 提交 2012-06-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1M HEPES PH 7.5, 10% (V/V) ISOPROPANOL AND 20% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 4000	分辨率 2.50 Å R-free 0.269
4MQW Structure of follicle-stimulating hormone in complex with the entire ectodomain of its receptor (P31) 提交 2013-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；The FSH-FSHRED complex was concentrated by ultrafiltration to about 10 mg/ml in HBS. 0.1M imidazole and 20% Jeffamine M-600, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.237
4MQW Structure of follicle-stimulating hormone in complex with the entire ectodomain of its receptor (P31) 提交 2013-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；The FSH-FSHRED complex was concentrated by ultrafiltration to about 10 mg/ml in HBS. 0.1M imidazole and 20% Jeffamine M-600, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.237
4MQW Structure of follicle-stimulating hormone in complex with the entire ectodomain of its receptor (P31) 提交 2013-09-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 19–129（111 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；The FSH-FSHRED complex was concentrated by ultrafiltration to about 10 mg/ml in HBS. 0.1M imidazole and 20% Jeffamine M-600, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.237
8I2G FSHR-Follicle stimulating hormone-compound 716340-Gs complex 提交 2023-01-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 Y 19–127（109 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 13 PLM PALMITIC ACID × 3 MYR MYRISTIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 O6F N-tert-butyl-N-ethyl-8-methoxy-9-propan-2-yloxy-1-thiophen-2-yl-5,6-dihydroimidazo[5,1-a]isoquinoline-3-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 2.80 Å

共 5 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FSHB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–111； UniProt 19–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9yxd
沉积日期 deposition_date	2025-10-27
最后修订 last_revision	2026-03-11
结构标题 title	Crystal structure of recombinant human follicle stimulating hormone in complex with an anti-FSH alpha Fab
关键词 keywords	Gonadotropin, Glycoprotein hormone, cystine knot cytokine, GPCR signaling, HORMONE; HORMONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	36.34 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.42 Å
零角强度 I(0) i0	113027000.00
分子量 molecular_weight	82735.0 kDa
排除体积 excluded_volume	102400 Å³
包络体积 envelope_volume	138680 Å³
水化壳体积 shell_volume	34751 Å³
包络直径 envelope_diameter	132.5 Å
壳层 Rg shell_rg	39.26 Å
包络 Rg envelope_rg	35.95 Å
形状 Rg shape_rg	36.35 Å
总 Rg total_rg	36.82 Å
总原子数 total_atoms	5827
残基数 n_residues	743
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	123.5 Å
Rg (实空间) rg_real	36.68 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.48 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1300e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2250e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	36.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	113000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6044
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	36.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.503
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.369
角度范围 angular_range	— – 0.2200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	7501000.0000
实空间数据点数 n_real_points	45
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.817; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.028; Positv: 1.000; Valcen: 0.737; Smooth: 0.583

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glycoprotein hormones alpha chain
分子量 formula_weight	10217.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6146

APDVQDCPECTLQENPFFSQPGAPILQCMGCCFSRAYPTPLRSKKTMLVQKNVTSESTCCVAKSYNRVTVMGGFKVENHTACHCSTCYYHKS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Follitropin subunit beta
分子量 formula_weight	12500.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

NSCELTNITIAIEKEECRFCISINTTWCAGYCYTRDLVYKDPARPKIQKTCTFKELVYETVRVPGCAHHADSLYTYPVATQCHCGKCDSDSTDCTVRGLGPSYCSFGEMKE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fab light chain
分子量 formula_weight	24264.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DIELTQSPDSLSVSLGQRATISCRASESVDSYGNSFMQWYQQKPGQPPKLLIYRASNLESGIPARFSGTGSRTDFTLTINPVEADDVATYYCQQSDEYPYMYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDSQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Fab heavy chain
分子量 formula_weight	24301.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

QVQLQQSGAELVKPGASVKLSCKASDYTFTSYWMHWVKQRPGQGLEWIGEINPTNGRTYYNEKFKSKATLTVDKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYYCARRYGNSFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHT

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Ig-like domain-containing protein
分子量 formula_weight	14075.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

HHHHHHQVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTISRYAMSWFRQAPGKEREFVAVARRSGDGAFYADSVQGRFTVSRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAIDSDTFYSGSYDYWGQGTQVTVSS

来源 Source

来源生物 organism	Lama glama
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9844
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
分子量 formula_weight	209.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	319

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	76.010 Å
晶胞边长 b length_b	101.103 Å
晶胞边长 c length_c	161.240 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	2.290 Å
最低分辨率 resolution_low	29.850 Å
R 因子 r_factor	0.2030
R_work r_work	0.2013
R_free r_free	0.2351

fit	/app/data/saxs_computation/yx/9yxd/9yxd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/yx/9yxd/9yxd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/yx/9yxd/9yxd.dat

Crystal structure of recombinant human follicle stimulating hormone in complex with an anti-FSH alpha Fab

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glycoprotein hormones alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Follitropin subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)