9zwk

High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1 state in lipid nanodisc

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 145.8 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit

Escherichia coli K-12

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–557	未记录	Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit × 1 （P03960） Potassium-transporting ATPase KdpC subunit × 1 （P03961） Potassium-transporting ATPase KdpF subunit × 1 （P36937） K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.34 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9ZWK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
6HRA Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1 outward-facing state (state 1) 提交 2018-09-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6HRB Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E2 inward-facing state (state 2) 提交 2018-09-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BGY Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with MgF4 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：Q116R	PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MF4 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；A 10x stock solution of MgF4 was added to the protein mixture containing all other buffer components to produce final concentrations 1 mM MgCl2 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 2.90 Å
7BH1 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E1 state with K 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.38 Å
7BH2 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with BeF3 and K+ 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture, at a 1:10 volume, to produce the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.00 Å
7LC3 CryoEM Structure of KdpFABC in E1-ATP state 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；AMPPCP was added to the protein after size-exclusion chromatography and incubated 1 hr prior to freezing cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
7LC6 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2-P state with BeF3 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：Q116R	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture with the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.70 Å
7ZRD Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, stabilised with the inhibitor orthovanadate 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2 VO4 VANADATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
7ZRE Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRG Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1_ATPearly conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRH Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRI Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRJ Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7ZRK Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 12 CDL CARDIOLIPIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7ZRL Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E2-P conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
7ZRM Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9OC4 High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P-ADP state in lipid nanodisc 提交 2025-04-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9ZWL High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1-ATP state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2mM MgCl2, 1mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
9ZWM High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.25 Å
9ZWN High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9ZWO High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2 state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å

共 22 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KDPA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–557； UniProt 1–557

Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit

Escherichia coli K-12

UniProt P03960

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–682	未记录	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit × 1 （P03959） Potassium-transporting ATPase KdpC subunit × 1 （P03961） Potassium-transporting ATPase KdpF subunit × 1 （P36937） K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.34 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9ZWK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SVJ The solution structure of the nucleotide binding domain of KdpB 提交 2004-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 316–451（136 aa）片段：N-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.4MM KDPBN U-15N,13C, 50MM PHOSPHATE BUFFER, 100MM NACL, 0.05% SODIUM AZIDE; 1.2MM KDPBN U-15N, 50MM PHOSPHATE BUFFER, 100MM NACL, 0.05% SODIUM AZIDE	分辨率未提供
1U7Q THE SOLUTION STRUCTURE OF THE NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN OF KDPB 提交 2004-08-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 316–451（136 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.4MM U-15N,13C KDPBN, 50MM PHOSPHATE BUFFER, 100MM NACL, 0.05% SODIUM AZIDE; 1.2MM U-15N KDPBN, 50MM PHOSPHATE BUFFER, 100MM NACL, 0.05% SODIUM AZIDE	分辨率未提供
2A00 The solution structure of the AMP-PNP bound nucleotide binding domain of KdpB 提交 2005-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 316–451（136 aa）片段：KdpBN, nucleotide binding domain of KdpB	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.0MM U-15N,13C KDPBN, 50MM phosphate buffer, 100MM NACL, 0.05% sodium azide, 15MM ATP- PNP; 1.0MM U-15N KDPBN, 50MM phosphate buffer, 100MM NACL, 0.05% sodium azide, 15MM AMP- PNP	分辨率未提供
2A29 The solution structure of the AMP-PNP bound nucleotide binding domain of KdpB 提交 2005-06-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 316–451（136 aa）片段：KdpBN, nucleotide binding domain of KdpB	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.0MM U-15N, 13C KDPBN, 50MM PHOSPHATE BUFFER, 100MM NACL, 0.05% SODIUM AZIDE, 15MM ATP- PNP; 1.0MM U-15N KDPBN, 50MM PHOSPHATE BUFFER, 100MM NACL, 0.05% SODIUM AZIDE, 15MM AMP- PNP	分辨率未提供
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 9–682（674 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 9–682（674 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 9–682（674 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
6HRA Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1 outward-facing state (state 1) 提交 2018-09-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6HRB Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E2 inward-facing state (state 2) 提交 2018-09-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BGY Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with MgF4 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	突变：S162A	PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MF4 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；A 10x stock solution of MgF4 was added to the protein mixture containing all other buffer components to produce final concentrations 1 mM MgCl2 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 2.90 Å
7BH1 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E1 state with K 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	突变：S162A	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.38 Å
7BH2 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with BeF3 and K+ 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	突变：S162A	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture, at a 1:10 volume, to produce the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.00 Å
7LC3 CryoEM Structure of KdpFABC in E1-ATP state 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	突变：S162A	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；AMPPCP was added to the protein after size-exclusion chromatography and incubated 1 hr prior to freezing cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
7LC6 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2-P state with BeF3 提交 2021-01-09	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	突变：S162A	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture with the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.70 Å
7ZRD Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, stabilised with the inhibitor orthovanadate 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2 VO4 VANADATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
7ZRE Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRG Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1_ATPearly conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRH Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRI Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRJ Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7ZRK Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 12 CDL CARDIOLIPIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7ZRL Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E2-P conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
7ZRM Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9OC4 High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P-ADP state in lipid nanodisc 提交 2025-04-23	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9ZWL High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1-ATP state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2mM MgCl2, 1mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
9ZWM High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.25 Å
9ZWN High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9ZWO High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2 state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å

共 26 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KDPB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–682； UniProt 1–682

Potassium-transporting ATPase KdpC subunit

Escherichia coli K-12

UniProt P03961

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–190	未记录	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit × 1 （P03959） Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit × 1 （P03960） Potassium-transporting ATPase KdpF subunit × 1 （P36937） K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.34 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9ZWK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6HRA Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1 outward-facing state (state 1) 提交 2018-09-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6HRB Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E2 inward-facing state (state 2) 提交 2018-09-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BGY Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with MgF4 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MF4 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；A 10x stock solution of MgF4 was added to the protein mixture containing all other buffer components to produce final concentrations 1 mM MgCl2 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 2.90 Å
7BH1 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E1 state with K 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.38 Å
7BH2 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with BeF3 and K+ 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture, at a 1:10 volume, to produce the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.00 Å
7LC3 CryoEM Structure of KdpFABC in E1-ATP state 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；AMPPCP was added to the protein after size-exclusion chromatography and incubated 1 hr prior to freezing cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
7LC6 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2-P state with BeF3 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture with the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.70 Å
7ZRD Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, stabilised with the inhibitor orthovanadate 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2 VO4 VANADATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
7ZRE Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRG Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1_ATPearly conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRH Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRI Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRJ Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7ZRK Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 12 CDL CARDIOLIPIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7ZRL Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E2-P conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
7ZRM Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9OC4 High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P-ADP state in lipid nanodisc 提交 2025-04-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9ZWL High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1-ATP state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2mM MgCl2, 1mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
9ZWM High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.25 Å
9ZWN High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9ZWO High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2 state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å

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UniProt名称	KDPC_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

Potassium-transporting ATPase KdpF subunit

Escherichia coli K-12

UniProt P36937

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–29	未记录	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit × 1 （P03959） Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit × 1 （P03960） Potassium-transporting ATPase KdpC subunit × 1 （P03961） K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.34 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9ZWK	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
6HRA Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1 outward-facing state (state 1) 提交 2018-09-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6HRB Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E2 inward-facing state (state 2) 提交 2018-09-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BGY Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with MgF4 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MF4 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；A 10x stock solution of MgF4 was added to the protein mixture containing all other buffer components to produce final concentrations 1 mM MgCl2 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 2.90 Å
7BH1 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E1 state with K 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.38 Å
7BH2 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with BeF3 and K+ 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture, at a 1:10 volume, to produce the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.00 Å
7LC3 CryoEM Structure of KdpFABC in E1-ATP state 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；AMPPCP was added to the protein after size-exclusion chromatography and incubated 1 hr prior to freezing cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
7LC6 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2-P state with BeF3 提交 2021-01-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture with the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.70 Å
7NNL Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1-ATP conformation loaded with K+ 提交 2021-02-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 10 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7NNP Rb-loaded cryo-EM structure of the E1-ATP KdpFABC complex. 提交 2021-02-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	RB RUBIDIUM ION × 8 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
7ZRD Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, stabilised with the inhibitor orthovanadate 提交 2022-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2 VO4 VANADATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
7ZRE Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRG Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1_ATPearly conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRH Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRI Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRJ Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7ZRK Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 12 CDL CARDIOLIPIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7ZRL Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E2-P conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
7ZRM Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9OC4 High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P-ADP state in lipid nanodisc 提交 2025-04-23	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9ZWL High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1-ATP state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2mM MgCl2, 1mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
9ZWM High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.25 Å
9ZWN High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9ZWO High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2 state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å

共 24 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KDPF_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–29； UniProt 1–29

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9zwk
沉积日期 deposition_date	2026-01-03
结构标题 title	High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1 state in lipid nanodisc
关键词 keywords	P-type ATPase, potassium channel transporter pump, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.06 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.42 Å
零角强度 I(0) i0	321059000.00
分子量 molecular_weight	155390.0 kDa
排除体积 excluded_volume	198500 Å³
包络体积 envelope_volume	247000 Å³
水化壳体积 shell_volume	52533 Å³
包络直径 envelope_diameter	153.6 Å
壳层 Rg shell_rg	43.56 Å
包络 Rg envelope_rg	42.08 Å
形状 Rg shape_rg	41.48 Å
总 Rg total_rg	41.33 Å
总原子数 total_atoms	10916
残基数 n_residues	1452
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	145.8 Å
Rg (实空间) rg_real	42.45 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.46 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.2110e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.5250e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.06 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	320900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.5944
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	38.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.583
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.227
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	50920000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.734; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.046; Positv: 1.000; Valcen: 0.859; Smooth: 0.525

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit
分子量 formula_weight	59218.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	11017

MAAQGFLLIATFLLVLMVLARPLGSGLARLINDIPLPGTTGVERVLFRALGVSDREMNWKQYLCAILGLNMLGLAVLFFMLLGQHYLPLNPQQLPGLSWDLALNTAVSFVTNTNWQSYSGETTLSYFSQMAGLTVQNFLSAASGIAVIFALIRAFTRQSMSTLGNAWVDLLRITLWVLVPVALLIALFFIQQGALQNFLPYQAVNTVEGAQQLLPMGPVASQEAIKMLGTNGGGFFNANSSHPFENPTALTNFVQMLAIFLIPTALCFAFGEVMGDRRQGRMLLWAMSVIFVICVGVVMWAEVQGNPHLLALGTDSSINMEGKESRFGVLVSSLFAVVTTAASCGAVIAMHDSFTALGGMVPMWLMQIGEVVFGGVGSGLYGMMLFVLLAVFIAGLMIGRTPEYLGKKIDVREMKLTALAILVTPTLVLMGAALAMMTDAGRSAMLNPGPHGFSEVLYAVSSAANNNGSAFAGLSANSPFWNCLLAFCMFVGRFGVIIPVMAIAGSLVSKKSQAASSGTLPTHGPLFVGLLIGTVLLVGALTFIPALALGPVAEYLS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit
分子量 formula_weight	72267.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.2.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSRKQLALFEPTLVVQALKEAVKKLNPQAQWRNPVMFIVWIGSLLTTCISIAMASGAMPGNALFSAAISGWLWITVLFANFAEALAEGRSKAQANSLKGVKKTAFARKLREPKYGAAADKVPADQLRKGDIVLVEAGDIIPCDGEVIEGGASVDESAITGESAPVIRESGGDFASVTGGTRILSDWLVIECSVNPGETFLDRMIAMVEGAQRRKTPNEIALTILLIALTIVFLLATATLWPFSAWGGNAVSVTVLVALLVCLIPTTIGGLLSAIGVAGMSRMLGANVIATSGRAVEAAGDVDVLLLDKTGTITLGNRQASEFIPAQGVDEKTLADAAQLASLADETPEGRSIVILAKQRFNLRERDVQSLHATFVPFTAQSRMSGINIDNRMIRKGSVDAIRRHVEANGGHFPTDVDQKVDQVARQGATPLVVVEGSRVLGVIALKDIVKGGIKERFAQLRKMGIKTVMITGDNRLTAAAIAAEAGVDDFLAEATPEAKLALIRQYQAEGRLVAMTGDGTNDAPALAQADVAVAMNSGTQAAKEAGNMVDLDSNPTKLIEVVHIGKQMLMTRGSLTTFSIANDVAKYFAIIPAAFAATYPQLNALNIMCLHSPDSAILSAVIFNALIIVFLIPLALKGVSYKPLTASAMLRRNLWIYGLGGLLVPFIGIKVIDLLLTVCGLV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase KdpC subunit
分子量 formula_weight	22299.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSGLRPALSTFIFLLLITGGVYPLLTTVLGQWWFPWQANGSLIREGDTVRGSALIGQNFTGNGYFHGRPSATAEMPYNPQASGGSNLAVSNPELDKLIAARVAALRAANPDASASVPVELVTASASGLDNNITPQAAAWQIPRVAKARNLSVEQLTQLIAKYSQQPLVKYIGQPVVNIVELNLALDKLDEGTGLVPRGSSHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase KdpF subunit
分子量 formula_weight	3071.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSAGVITGVLLVFLLLGYLVYALINAEAF

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	(2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate
分子量 formula_weight	718.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	101

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.340 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.34 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	89556

fit	/app/data/saxs_computation/zw/9zwk/9zwk.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zw/9zwk/9zwk.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zw/9zwk/9zwk.dat

High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1 state in lipid nanodisc

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase KdpC subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase KdpF subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)