当前蛋白身份:A0A0K0K1A5 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5E9D RD-1 Mart-1 High bound to Mart-1 decameric peptide (ELA) in complex with HLA-A2 提交 2015-10-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;300 K;PEG 4000, 0.002 M Zinc Acetate, 5% 2- propanol.
分辨率 2.51 Å R-free 0.232
5E9D RD-1 Mart-1 High bound to Mart-1 decameric peptide (ELA) in complex with HLA-A2 提交 2015-10-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 J 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;300 K;PEG 4000, 0.002 M Zinc Acetate, 5% 2- propanol.
分辨率 2.51 Å R-free 0.232
5MEN Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILAKFLHWL, in complex with cognate T-Cell Receptor 提交 2016-11-16 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 21–114(94 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M ammonium sulphate, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.272
6JXR Structure of human T cell receptor-CD3 complex 提交 2019-04-24 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 n 22–112(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.70 Å
6Q3S Engineered Human HLA_A2 MHC Class I molecule in complex with TCR and SV9 peptide 提交 2018-12-04 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 22–114(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M ammonium acetate; 0.1 M bis-tris pH 5.5, 17 %(w/v) PEG 10.000
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
7FJD Cryo-EM structure of a membrane protein(WT) 提交 2021-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 n 1–112(112 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.20 Å
7FJE Cryo-EM structure of a membrane protein(LL) 提交 2021-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 n 1–112(112 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
7FJF Cryo-EM structure of a membrane protein(CS) 提交 2021-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 n 1–112(112 aa)
未记录 C3S CHOLEST-5-EN-3-YL HYDROGEN SULFATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
8RLT TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 index peptide 提交 2024-01-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
8RLT TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 index peptide 提交 2024-01-03 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 J 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.25 Å R-free 0.252
8RLU TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide 提交 2024-01-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.35 Å R-free 0.261
8RLU TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide 提交 2024-01-03 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 J 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
分辨率 2.35 Å R-free 0.261
8RLV TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 L6I peptide 提交 2024-01-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate Collection Temp: 100
分辨率 2.61 Å R-free 0.251
8RLV TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 L6I peptide 提交 2024-01-03 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 J 20–112(93 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate Collection Temp: 100
分辨率 2.61 Å R-free 0.251
8TW4 TCR in nanodisc ND-I 提交 2023-08-20 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–114(114 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8TW6 TCR in nanodisc ND-II 提交 2023-08-20 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–114(114 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å