当前蛋白身份:A0A0K0K1A5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5E9D RD-1 Mart-1 High bound to Mart-1 decameric peptide (ELA) in complex with HLA-A2 提交 2015-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 E
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;300 K;PEG 4000, 0.002 M Zinc Acetate, 5% 2- propanol.
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.232 |
| 5E9D RD-1 Mart-1 High bound to Mart-1 decameric peptide (ELA) in complex with HLA-A2 提交 2015-10-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 J
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;300 K;PEG 4000, 0.002 M Zinc Acetate, 5% 2- propanol.
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.232 |
| 5MEN Human Leukocyte Antigen A02 presenting ILAKFLHWL, in complex with cognate T-Cell Receptor 提交 2016-11-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 E
21–114(94 aa)
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M ammonium sulphate, 0.1M HEPES pH7, 20% PEG 8000
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.272 |
| 6JXR Structure of human T cell receptor-CD3 complex 提交 2019-04-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 n
22–112(91 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.70 Å |
| 6Q3S Engineered Human HLA_A2 MHC Class I molecule in complex with TCR and SV9 peptide 提交 2018-12-04 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 E
22–114(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M ammonium acetate; 0.1 M bis-tris pH 5.5, 17 %(w/v) PEG 10.000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.273 |
| 7FJD Cryo-EM structure of a membrane protein(WT) 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 n
1–112(112 aa)
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未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.20 Å |
| 7FJE Cryo-EM structure of a membrane protein(LL) 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 n
1–112(112 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.00 Å |
| 7FJF Cryo-EM structure of a membrane protein(CS) 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 n
1–112(112 aa)
|
未记录 | C3S CHOLEST-5-EN-3-YL HYDROGEN SULFATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 8RLT TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 index peptide 提交 2024-01-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 E
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 8RLT TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 index peptide 提交 2024-01-03 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 J
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.252 |
| 8RLU TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide 提交 2024-01-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 E
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.261 |
| 8RLU TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide 提交 2024-01-03 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 J
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.261 |
| 8RLV TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 L6I peptide 提交 2024-01-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 E
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
Collection Temp: 100
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.251 |
| 8RLV TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 L6I peptide 提交 2024-01-03 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 J
20–112(93 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;20% (w/v) PEG 3350, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 200 mM sodium sulfate
Collection Temp: 100
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.251 |
| 8TW4 TCR in nanodisc ND-I 提交 2023-08-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 B
1–114(114 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |
| 8TW6 TCR in nanodisc ND-II 提交 2023-08-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 B
1–114(114 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |