当前蛋白身份:A0A2K5PSA0 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 m 36–128(93 aa)
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å