当前蛋白身份:A0A6A5PUY8 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 5 1–775(775 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 5 1–775(775 aa)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:pentadecameric(15) 与全部聚合物一致
链 5 1–775(775 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 5 1–775(775 aa)
链 d 1–775(775 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致
链 5 1–775(775 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å