当前蛋白身份:A0A8D1KNW4 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致
链 F 1–127(127 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å