当前蛋白身份：A0A8M0FGU0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8AXA Cryo-EM structure of shCas12k-sgRNA-dsDNA ternary complex (type V-K CRISPR-associated transposon) 提交 2022-08-31 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–639（639 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 s blotting, 4 degrees celcius
|
分辨率 2.96 Å |
| 8AXB Cryo-EM structure of Cas12k-sgRNA binary complex (type V-K CRISPR-associated transposon) 提交 2022-08-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–639（639 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 s blotting, 4 degrees celcius
|
分辨率 2.87 Å |
| 8BD6 Cas12k-sgRNA-dsDNA-TnsC non-productive complex. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–639（638 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 MG MAGNESIUM ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8EA3 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, major configuration 提交 2022-08-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–639（639 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8EA4 V-K CAST Transpososome from Scytonema hofmanni, minor configuration 提交 2022-08-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：31-meric（31） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–639（639 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 15 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9GO0 Cryo-EM structure of ShCas12k in complex with a sgRNA and a dsDNA target 提交 2024-09-04 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–639（639 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH pH 7.5, 50 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.04 Å |