当前蛋白身份：F1SVC5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4CE4 39S large subunit of the porcine mitochondrial ribosome 提交 2013-11-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：38-meric（38） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–188（188 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM HEPES-KOH PH 7.9, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 20 MM MGCL2；pH 7.9；20 MM HEPES-KOH PH 7.9, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 20 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；MANUAL BLOTTING FOLLOWED BY MANUAL PLUNGING INTO LIQUID ETHANE
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分辨率 4.90 Å |
| 4V19 Structure of the large subunit of the mammalian mitoribosome, part 1 of 2 提交 2014-09-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 8
1–188（188 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 169 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
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分辨率 3.40 Å |
| 5AJ4 Structure of the 55S mammalian mitoribosome. 提交 2015-02-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric（89） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 351 ZN ZINC ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT；pH 7.4；20 MM HEPES-KOH, 50 MM KCL, 40 MM MGCL2, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；MIXTURE OF LIQUID ETHANE AND PROPANE
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分辨率 3.80 Å |
| 6GAW Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the complete 55S ribosome. 提交 2018-04-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 90 PDB 声明：95-meric（95） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 6GB2 Unique features of mammalian mitochondrial translation initiation revealed by cryo-EM. This file contains the 39S ribosomal subunit. 提交 2018-04-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：62-meric（62） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 216 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6YDP 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and P site fMet-tRNAMet (POST) 提交 2020-03-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：94-meric（94） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 326 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.00 Å |
| 6YDW 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtEFG1 and two tRNAMet (TI-POST) 提交 2020-03-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 89 PDB 声明：95-meric（95） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 325 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7NQH 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1a and P-site tRNAMet 提交 2021-03-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7NQL 55S mammalian mitochondrial ribosome with ICT1 and P site tRNAMet 提交 2021-03-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 335 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7NSH 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRRF (post) and mtEFG2 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 221 ZN ZINC ION × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 SPM SPERMINE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7NSI 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 88 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 4.60 Å |
| 7NSJ 55S mammalian mitochondrial ribosome with tRNA(P/P) and tRNA(E*) 提交 2021-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致 |
链 B8
1–188（188 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 324 ZN ZINC ION × 6 SPM SPERMINE × 3 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.90 Å |