当前蛋白身份:G0S0E5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8I9T Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-1 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:60-meric(60) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 62 PDB 声明:64-meric(64) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–15(15 aa)
链 LH
53–229(177 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.38 Å |
| 9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 47 PDB 声明:50-meric(50) 与全部聚合物一致 |
链 LH
1–229(229 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 379 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;waiting time: 15 s
blot force: 0
|
分辨率 2.20 Å |