当前蛋白身份：O15519
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2N5R NMR structure of cFLIP-derived calmodulin binding peptide 提交 2015-07-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
62–73（12 aa）
片段：DED 1 domain residues 62-73
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate, 150 mM sodium chloride, 1 mM calcium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3H11 Zymogen caspase-8:c-FLIPL protease domain complex 提交 2009-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
209–480（272 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；0.9 M sodium dihydrogen phosphate, 0.8 M dipotassium hydrogen phosphate, 0.1 M N-cyclohexyl-3-aminopropanesulfonic acid (CAPS), 0.2 M lithium sulfate, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 3H13 c-FLIPL protease-like domain 提交 2009-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
209–480（272 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290 K；0.1 M Mes, 18% PEG, 5000 monomethyl ether, 0.1 M ammonium sulfate
, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 6M6O NMR SOLUTION STRUCTURE OF A C-FLIPs 提交 2020-03-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–173（172 aa）
|
突变：F114G | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）110；压力 1
NMR样品组成
0.6 nM [U-99% 13C; U-99% 15N] c-FLIPS, 1.0 nM EDTA-Na2, 1.0 nM TCEP, 0.02 % NaN3, 60 nM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7DEE Structural Basis of the regulation of DISC Assembly by the interaction of c-FLIPs with Procaspase-8 提交 2020-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–173（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）110；压力 1
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）60；压力 1
NMR样品组成
10 mM C8-H1a, 0.002 % v/v sodium azide, 110 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
04 mM C8-H1a, 0.002 % v/v sodium azide, 110 mM sodium phosphate, 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] c-FLIPs, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.002 % v/v sodium azide, 110 mM sodium phosphate, 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] c-FLIPs, 1 mM TCEP, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8YBX Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8YD7 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SE SELENIUM ATOM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；HEPES, TBG, PEG8000, TCEP, sodium chloride
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.231 |
| 8YD8 Structure of FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
突变：H7G 突变：H7G 突变：H7G 突变：H7G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；HEPES, PEG 8000, TBG, TCEP, sodium chloride
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.241 |
| 8YM4 Structure of Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 F
1–181（181 aa）
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SE SELENIUM ATOM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.08 M sodium chloride, 0.2 M Potassium Thiocyanate, 10 % PEG 4000, 0.01 M TCEP
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.253 |
| 8YM5 Structure of Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 F
1–181（181 aa）
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H7G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 0.08 M sodium chloride, 0.2 M Potassium Thiocyanate, 10 % PEG 4000, 0.01 M TCEP
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.231 |
| 8YM6 Structure of Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 F
1–181（181 aa）
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
链 M
1–181（181 aa）
链 N
1–181（181 aa）
链 O
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M Lithium chloride, 20 % PEG 400, 0.1 M TBG pH 9.0
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.264 |
| 8YNI Structure of the FADD/Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric（11） 与蛋白数一致 |
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 8YNK Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8YNL Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 F
1–181（181 aa）
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 8YNM Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 F
1–181（181 aa）
链 G
1–181（181 aa）
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
链 N
1–181（181 aa）
链 O
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 8YNN Structure of the Caspase-8/cFLIP death effector domain assembly 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
1–181（181 aa）
链 I
1–181（181 aa）
链 J
1–181（181 aa）
链 K
1–181（181 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.97 Å |