当前蛋白身份:O75570 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8OIN 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 88 PDB 声明:94-meric(94) 与全部聚合物一致
链 Aa 1–445(445 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 332 K POTASSIUM ION × 41 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 3 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
8OIP 28S mammalian mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:36-meric(36) 与全部聚合物一致
链 Aa 1–445(445 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 127 SPM SPERMINE × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
8OIQ 39S mammalian mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:62-meric(62) 与全部聚合物一致
链 Aa 1–445(445 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 205 K POTASSIUM ION × 30 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20mM HEPES-KOH pH=7.5, 100mM KCl, 20mM MgCl2, ~1% sucrose (from mtRF1 storage buffer)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
8OIR 55S human mitochondrial ribosome with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 88 PDB 声明:94-meric(94) 与全部聚合物一致
链 Aa 1–445(445 aa)
突变:311GGQ313 > AAQ K POTASSIUM ION × 51 MG MAGNESIUM ION × 354 VAL VALINE × 1 ZN ZINC ION × 3 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 3 MET METHIONINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
8OIS 28S human mitochondrial small ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:36-meric(36) 与全部聚合物一致
链 Aa 1–445(445 aa)
突变:311GGQ313 > AAQ K POTASSIUM ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 126 MET METHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 1 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8OIT 39S human mitochondrial large ribosomal subunit with mtRF1 and P-site tRNA 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:62-meric(62) 与全部聚合物一致
链 Aa 1–445(445 aa)
突变:311GGQ313 > AAQ K POTASSIUM ION × 34 MG MAGNESIUM ION × 228 VAL VALINE × 1 ZN ZINC ION × 2 FS2 FE-S-O HYBRID CLUSTER × 1 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å