当前蛋白身份：O94762
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4BK0 Crystal structure of the KIX domain of human RECQL5 (domain-swapped dimer) 提交 2013-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
515–620（106 aa）
片段：KIX DOMAIN, RESIDUES 515-620
链 B
515–620（106 aa）
片段：KIX DOMAIN, RESIDUES 515-620
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；0.2 M NACL, 0.1 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE PH 6.2, 50% PEG 200
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.234 |
| 5LB3 Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg. 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；23% PEG6K, 0.15M lithium chloride, 2.5% ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 5LB3 Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg. 提交 2016-06-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；23% PEG6K, 0.15M lithium chloride, 2.5% ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 5LB5 Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form). 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
10–453（444 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |
| 5LB5 Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form). 提交 2016-06-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
10–453（444 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |
| 5LB5 Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form). 提交 2016-06-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
10–453（444 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |
| 5LB5 Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form). 提交 2016-06-15 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
10–453（444 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |
| 5LB8 Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form. 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
11–526（516 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；17.5% Peg 3350, 0.2M Potassium Thiocyanate, 0.1M Hepes pH 7.0, 10% ethelene glycol
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.322 |
| 5LB8 Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form. 提交 2016-06-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
11–526（516 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；17.5% Peg 3350, 0.2M Potassium Thiocyanate, 0.1M Hepes pH 7.0, 10% ethelene glycol
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.322 |
| 5LBA Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening. 提交 2016-06-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 6SV 1-cyclohexyl-3-[[(2~{R})-oxolan-2-yl]methyl]urea × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |
| 5LBA Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening. 提交 2016-06-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |
| 5LBA Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening. 提交 2016-06-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
11–453（443 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |
| 5LBA Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening. 提交 2016-06-15 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
11–453（443 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |
| 7ZML Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；293 K；0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.261 |
| 7ZML Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；293 K；0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.261 |
| 7ZML Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001 提交 2022-04-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；293 K；0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.261 |
| 7ZML Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001 提交 2022-04-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；293 K；0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.261 |
| 7ZMM Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.281 |
| 7ZMM Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.281 |
| 7ZMM Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001 提交 2022-04-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.281 |
| 7ZMM Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001 提交 2022-04-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.281 |
| 7ZMN Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-048 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.275 |
| 7ZMN Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-048 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M ammonium sulfate -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.275 |
| 7ZMO Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-052 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1M ammonium sulfate -- 0.5% PEG8000 -- 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.306 |
| 7ZMO Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-052 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1M ammonium sulfate -- 0.5% PEG8000 -- 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 3.75 Å R-free 0.306 |
| 7ZMP Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-055 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.4M sodium malonate
|
分辨率 3.63 Å R-free 0.359 |
| 7ZMP Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-055 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.4M sodium malonate
|
分辨率 3.63 Å R-free 0.359 |
| 7ZMQ Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-006 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M tris pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 7ZMQ Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-006 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M tris pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.258 |
| 7ZMR Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-011 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.292 |
| 7ZMR Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-011 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.292 |
| 7ZMS Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G4-043 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
12–453（442 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.276 |
| 7ZMT Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium formate -- 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.291 |
| 7ZMT Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium formate -- 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.291 |
| 7ZMV Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006 提交 2022-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 7ZMV Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006 提交 2022-04-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 7ZMV Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006 提交 2022-04-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 7ZMV Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006 提交 2022-04-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
11–453（443 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
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分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 8QQ2 RNAPII elongation complex bound to RECQ5 提交 2023-10-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–650（650 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 4.20 Å |
| 8QW8 In condensate RNAPII elongation complex bound to RECQ5 提交 2023-10-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–650（650 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 7.70 Å |
| 8QW9 RNAPII elongation complex bound to RECQ5_R502E 提交 2023-10-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 R
1–650（650 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 4.30 Å |
| 8RL5 DNA helicase RECQL5 in complex with homo Di-Gluebody G5-006 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
12–453（442 aa）
链 B
12–453（442 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.79 Å |
| 8RL6 DNA helicase RECQL5 in complex with homo Di-Gluebody G5-006 - RECQL5 local refinement 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
12–453（442 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.18 Å |
| 8RL9 RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
12–453（442 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.22 Å |
| 8RLA RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - RECQL5 local refinement 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
12–453（442 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.03 Å |
| 9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–991（991 aa）
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突变：D157A | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9EI2 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to an apo RECQL5 helicase (RECQL5 IRI Module focused-classified) 提交 2024-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 U
1–991（991 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |
| 9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–991（991 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–991（991 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.70 Å |
| 9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：16-meric（16） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–991（991 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |
| 9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–991（991 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.00 Å |
| 9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 O
1–991（991 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |