当前蛋白身份：P00875
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AA1 ACTIVATED SPINACH RUBISCO IN COMPLEX WITH THE PRODUCT 3-PHOSPHOGLYCERATE 提交 1997-01-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 L
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 3PG 3-PHOSPHOGLYCERIC ACID × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；14% PEG 4000, 0.2 M NACL, 25 MM HEPES PH 7.8 10 MM MGCL2, 100 MM 3-PHOSPHOGLYCERATE, pH 7.2
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.224 |
| 1AUS ACTIVATED UNLIGANDED SPINACH RUBISCO 提交 1995-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 L
1–475（475 aa）
链 M
1–475（475 aa）
链 N
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 FMT FORMIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 1IR1 Crystal Structure of Spinach Ribulose-1,5-Bisphosphate Carboxylase/Oxygenase (Rubisco) Complexed with CO2, Mg2+ and 2-Carboxyarabinitol-1,5-Bisphosphate 提交 2001-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.9；293 K；PEG4000, MgCl2, NaHCO3, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate, Bicine, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.179 |
| 1RBO SPINACH RUBISCO IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE 提交 1996-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 L
1–475（475 aa）
|
未记录 | CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；1.7 M (NH4)2SO4, 50 MM PHOSPHATE, PH 7.4 3 MM MGCL2, 25 MM NAHCO3, 10 MM 4CABP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.171 |
| 1RCO SPINACH RUBISCO IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR D-XYLULOSE-2,2-DIOL-1,5-BISPHOSPHATE 提交 1996-10-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 L
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
链 R
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
|
未记录 | XDP D-XYLULOSE-2,2-DIOL-1,5-BISPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；15% PEG 4000, 25 MM HEPES PH 7.8, 10 MM CACL2, 0.2 M NACL, 50 MM NAHCO3, 20 MM XUBP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.246 |
| 1RCX NON-ACTIVATED SPINACH RUBISCO IN COMPLEX WITH ITS SUBSTRATE RIBULOSE-1,5-BISPHOSPHATE 提交 1996-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 L
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
链 R
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
|
未记录 | RUB RIBULOSE-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；12% PEG 4000, 25 MM HEPES PH 7.8, 0.2 M NACL, 20 MM RUBP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.237 |
| 1RXO ACTIVATED SPINACH RUBISCO IN COMPLEX WITH ITS SUBSTRATE RIBULOSE-1,5-BISPHOSPHATE AND CALCIUM 提交 1996-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 L
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | RUB RIBULOSE-1,5-DIPHOSPHATE × 8 CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；14% PEG4000, 25 MM HEPES PH 7.8, 0.2 M NACL, 10 MM CACL2; SOAKED WITH 20 MM RUBP FOR 5 DAYS
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.229 |
| 1UPM ACTIVATED SPINACH RUBISCO COMPLEXED WITH 2-CARBOXYARABINITOL 2 BISPHOSPHAT AND CA2+. 提交 2003-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
链 K
1–475（475 aa）
链 L
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
链 R
1–475（475 aa）
链 V
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；10% PEG 4000, 0.1 M HEPES PH 7.8, 10 MM CACL2, 0.2 M NACL, 50 MM NAHCO3, 1MM 2-CABP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.200 |
| 1UPP SPINACH RUBISCO IN COMPLEX WITH 2-CARBOXYARABINITOL 2 BISPHOSPHATE and Calcium. 提交 2003-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；10% PEG 4000, 0.1M HEPES PH 7.8, 10 MM CACL2, 0.2 M NACL, 50 MM NAHCO3, 0.1 M 3PGA THEN SOAKED IN 2-CABP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.307 |
| 8QJ0 Room-temperature Serial Synchrotron Crystallography structure of Spinacia oleracea RuBisCO 提交 2023-09-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 L
1–475（475 aa）
链 M
1–475（475 aa）
链 N
1–475（475 aa）
链 O
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；SpRub solution at a concentration of 15 mg/mL (in a buffer of 20 mM HEPES, 5 mM MgCl2, pH 8.0), combined reservoir solution (0.2 M MgCl2x6H2O, 0.1 M Tris pH 7.0, 12% w/v PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 8RUC ACTIVATED SPINACH RUBISCO COMPLEXED WITH 2-CARBOXYARABINITOL BISPHOSPHATE 提交 1996-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å |
| 9CQ5 Mn-bound RuBisCO from spinach with CABP inhibitor 提交 2024-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
1–475（475 aa）
链 B
1–475（475 aa）
链 C
1–475（475 aa）
链 D
1–475（475 aa）
链 E
1–475（475 aa）
链 F
1–475（475 aa）
链 G
1–475（475 aa）
链 H
1–475（475 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MN MANGANESE (II) ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；298 K；PEG 3350, lithium acetate, potassium phosphate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |