当前蛋白身份：P02976
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DEE Structure of S. aureus protein A bound to a human IgM Fab 提交 1999-11-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
100–153（54 aa）
片段：RECOMBINANT DOMAIN D
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MPEG 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.281 |
| 1DEE Structure of S. aureus protein A bound to a human IgM Fab 提交 1999-11-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
100–153（54 aa）
片段：RECOMBINANT DOMAIN D
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MPEG 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.281 |
| 1FC2 Crystallographic Refinement and Atomic Models of a Human FC Fragment and its Complex with Fragment B of Protein A from Staphylococcus Aureus at 2.9-and 2.8-Angstroms Resolution 提交 1981-05-21 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
212–269（58 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1H0T An affibody in complex with a target protein: structure and coupled folding 提交 2002-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
213–269（57 aa）
片段：RESIDUES 213-269
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.6；303 K；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 4Y4Y T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (C2 crystal form) 提交 2015-02-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 A
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 B
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 C
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 D
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 E
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 F
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 G
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 H
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 I
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 J
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 K
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 L
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 M
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 N
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 O
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 P
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Q
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 R
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 S
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 T
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 U
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 V
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 W
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 X
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Y
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 Z
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 a
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 b
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 c
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
链 d
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211, RESIDUES 66-268
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；15-20% PEG 4000, 5% Iso-propanol, 100 mM Sodium citrate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.200 |
| 4Y5Z T=1 capsid structure of SeMV Ndel65CP fused with B-domain of S. aureus protein SpA at the N-terminus (P1 crystal form) 提交 2015-02-12 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric（60） 与蛋白数一致 |
链 0
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 1
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 2
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 3
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 4
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 5
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 6
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 7
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 A
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 B
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 C
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 D
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 E
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 F
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 G
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 H
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 I
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 J
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 K
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 L
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 M
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 N
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 O
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 P
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Q
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 R
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 S
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 T
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 U
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 V
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 W
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 X
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Y
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 Z
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 a
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 b
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 c
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 d
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 e
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 f
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 g
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 h
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 i
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 j
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 k
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 l
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 m
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 n
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 o
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 p
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 q
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 r
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 s
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 t
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 u
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 v
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 w
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 x
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 y
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
链 z
158–211（54 aa）
片段：UNP RESIDUES 158-211,UNP RESIDUES 66-268
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；15-25% PEG 400, 0.2M magnesium chloride, 0.1M HEPES
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.249 |
| 9BDE Middle Region of Apolipoprotein B 100 bound to Low Density Lipoprotein Receptor 提交 2024-04-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
278–327（50 aa）
片段：;residues 27-384 (Uniprot numbering),residues 278-327 (Uniprot numbering),103-151 (Uniprot numbering),residues 440-497 (Uniprot numbering)
;
链 B
103–151（49 aa）
片段：;residues 27-384 (Uniprot numbering),residues 278-327 (Uniprot numbering),103-151 (Uniprot numbering),residues 440-497 (Uniprot numbering)
;
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 9HXS CS-ROSETTA Structure of the Z Domain of the IgG-Binding Staphylococcal Protein A 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
212–269（58 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成
2 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] Protein Z, 25 mM MES, 1 mM CaCl2, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9M5D Crystal structure of S. aureus protein A bound to a human single-domain antibody 提交 2025-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
93–153（61 aa）
链 H
93–153（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.2M Magnesium chloride and 0.1M BIS-Tris 5.5
|
分辨率 3.57 Å R-free 0.271 |
| 9M6J Crystal structure of S. aureus protein A bound to a camelid single-domain antibody 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
93–153（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.0 M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 9M6O Crystal structure of S. aureus protein A bound to a camelid single-domain antibody 提交 2025-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
93–153（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.1M Citric acid 3.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.257 |
| 9M6O Crystal structure of S. aureus protein A bound to a camelid single-domain antibody 提交 2025-03-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
93–153（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% w/v Polyethylene glycol 3350 and 0.1M Citric acid 3.5
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.257 |
| 9QBJ Legobody dimer 提交 2025-03-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 I
295–321（27 aa）
链 J
295–321（27 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |