当前蛋白身份：P03713
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7SJ5 Bacteriophage lambda major capsid protein mutant - W308A 提交 2021-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
|
突变：W308A 突变：W308A 突变：W308A 突变：W308A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；291.15 K；0.1 M bis-tris, 0.1 M ammonium sulfate, 5% v/v glycerol, 30% v/v PEG-3350
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.230 |
| 7VI9 Cryo-EM structure of bacteriophage lambda procapsid at 5.03 Angstrom 提交 2021-09-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 420 PDB 声明：420-meric（420） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.03 Å |
| 7VI9 Cryo-EM structure of bacteriophage lambda procapsid at 5.03 Angstrom 提交 2021-09-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.03 Å |
| 7VI9 Cryo-EM structure of bacteriophage lambda procapsid at 5.03 Angstrom 提交 2021-09-26 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric（35） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.03 Å |
| 7VI9 Cryo-EM structure of bacteriophage lambda procapsid at 5.03 Angstrom 提交 2021-09-26 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.03 Å |
| 7VI9 Cryo-EM structure of bacteriophage lambda procapsid at 5.03 Angstrom 提交 2021-09-26 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.03 Å |
| 7VIA Focused refinement of asymmetric unit of bacteriophage lambda procapsid at 3.88 Angstrom 提交 2021-09-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.88 Å |
| 7VII cryoEM structure of bacteriophage lambda capsid at 5.6 Angstrom 提交 2021-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 840 PDB 声明：840-meric（840） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.60 Å |
| 7VII cryoEM structure of bacteriophage lambda capsid at 5.6 Angstrom 提交 2021-09-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.60 Å |
| 7VII cryoEM structure of bacteriophage lambda capsid at 5.6 Angstrom 提交 2021-09-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 70 PDB 声明：70-meric（70） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.60 Å |
| 7VII cryoEM structure of bacteriophage lambda capsid at 5.6 Angstrom 提交 2021-09-27 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：84-meric（84） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.60 Å |
| 7VII cryoEM structure of bacteriophage lambda capsid at 5.6 Angstrom 提交 2021-09-27 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.60 Å |
| 7VIK Asymmetric unit of cryoEM structure of bacteriophage lambda capsid at 3.76 Angstrom 提交 2021-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.76 Å |
| 8K39 Structure of the bacteriophage lambda portal vertex 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致 |
链 0
1–341（341 aa）
链 1
1–341（341 aa）
链 2
1–341（341 aa）
链 3
1–341（341 aa）
链 4
1–341（341 aa）
链 5
1–341（341 aa）
链 6
1–341（341 aa）
链 7
1–341（341 aa）
链 A
1–341（341 aa）
链 B
1–341（341 aa）
链 C
1–341（341 aa）
链 D
1–341（341 aa）
链 E
1–341（341 aa）
链 F
1–341（341 aa）
链 G
1–341（341 aa）
链 H
1–341（341 aa）
链 I
1–341（341 aa）
链 J
1–341（341 aa）
链 K
1–341（341 aa）
链 L
1–341（341 aa）
链 M
1–341（341 aa）
链 N
1–341（341 aa）
链 O
1–341（341 aa）
链 P
1–341（341 aa）
链 Q
1–341（341 aa）
链 R
1–341（341 aa）
链 S
1–341（341 aa）
链 T
1–341（341 aa）
链 g
1–341（341 aa）
链 h
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8XOU Prohead portal vertex of bacteriophage lambda 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致 |
链 A0
1–341（341 aa）
链 A1
1–341（341 aa）
链 A2
1–341（341 aa）
链 A3
1–341（341 aa）
链 A4
1–341（341 aa）
链 C0
1–341（341 aa）
链 C1
1–341（341 aa）
链 C2
1–341（341 aa）
链 C3
1–341（341 aa）
链 C4
1–341（341 aa）
链 D0
1–341（341 aa）
链 D1
1–341（341 aa）
链 D2
1–341（341 aa）
链 D3
1–341（341 aa）
链 D4
1–341（341 aa）
链 E0
1–341（341 aa）
链 E1
1–341（341 aa）
链 E2
1–341（341 aa）
链 E3
1–341（341 aa）
链 E4
1–341（341 aa）
链 F0
1–341（341 aa）
链 F1
1–341（341 aa）
链 F2
1–341（341 aa）
链 F3
1–341（341 aa）
链 F4
1–341（341 aa）
链 G0
1–341（341 aa）
链 G1
1–341（341 aa）
链 G2
1–341（341 aa）
链 G3
1–341（341 aa）
链 G4
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 5.58 Å |
| 8XQB Mature virion portal vertex of bacteriophage lambda 提交 2024-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 71 PDB 声明：71-meric（71） 与蛋白数一致 |
链 A0
1–341（341 aa）
链 A1
1–341（341 aa）
链 A2
1–341（341 aa）
链 A3
1–341（341 aa）
链 A4
1–341（341 aa）
链 C0
1–341（341 aa）
链 C1
1–341（341 aa）
链 C2
1–341（341 aa）
链 C3
1–341（341 aa）
链 C4
1–341（341 aa）
链 G0
1–341（341 aa）
链 G1
1–341（341 aa）
链 G2
1–341（341 aa）
链 G3
1–341（341 aa）
链 G4
1–341（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.07 Å |