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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：P03733 重新检索
14PDB条目
14Biological assembly
160链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2K4Q The Solution Structure of gpV, the Major Tail Protein from Bacteriophage Lambda 提交 2008-06-16 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致
链 A 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 0.6 mM DSS, 200 mM sodium chloride, 8-10 % D2O, 0.1% % sodium azide, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] gpV protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] gpV protein, 90-99 % D2O, 0.6 mM DSS, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 0.1 % sodium azide, 90% D2O, 10% H2O | 90% D2O, 10% H2O
分辨率未提供
2L04 The Solution Structure of the C-terminal Ig-like Domain of the Bacteriophage Lambda Tail Tube Protein 提交 2010-06-30 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致
链 A 160–246（87 aa） 片段：C-terminal, UNP residues 160-246
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）.2；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate-1, 200 mM sodium chloride-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate-3, 200 mM sodium chloride-4, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6P3E Mobile loops and electrostatic interactions maintain the flexible lambda tail tube 提交 2019-05-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致
链 A 1–246（246 aa）
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
链 D 1–246（246 aa）
链 E 1–246（246 aa）
链 F 1–246（246 aa）
链 G 1–246（246 aa）
链 H 1–246（246 aa）
链 I 1–246（246 aa）
链 J 1–246（246 aa）
链 K 1–246（246 aa）
链 L 1–246（246 aa）
链 M 1–246（246 aa）
链 N 1–246（246 aa）
链 O 1–246（246 aa）
链 P 1–246（246 aa）
链 Q 1–246（246 aa）
链 R 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.40 Å
7T2E Structure of bacteriophage lambda tube protein V in C6 提交 2021-12-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致
链 A 2–157（156 aa）
链 B 2–157（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7T4F Structure of bacteriophage lambda tube protein V in C3 提交 2021-12-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 A 2–246（245 aa）
链 B 2–246（245 aa）
链 C 2–246（245 aa）
链 D 2–246（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IYD Tail cap of phage lambda tail 提交 2023-04-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致
链 A 1–246（246 aa）
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
链 D 1–246（246 aa）
链 E 1–246（246 aa）
链 F 1–246（246 aa）
链 H 1–246（246 aa）
链 I 1–246（246 aa）
链 J 1–246（246 aa）
链 L 1–246（246 aa）
链 M 1–246（246 aa）
链 N 1–246（246 aa）
链 O 1–246（246 aa）
链 P 1–246（246 aa）
链 R 1–246（246 aa）
链 S 1–246（246 aa）
链 T 1–246（246 aa）
链 V 1–246（246 aa）
链 X 1–246（246 aa）
链 Y 1–246（246 aa）
链 a 1–246（246 aa）
链 b 1–246（246 aa）
链 c 1–246（246 aa）
链 v 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致
链 A 1–246（246 aa）
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
链 D 1–246（246 aa）
链 G 1–246（246 aa）
链 Q 1–246（246 aa）
链 R 1–246（246 aa）
链 S 1–246（246 aa）
链 T 1–246（246 aa）
链 U 1–246（246 aa）
链 V 1–246（246 aa）
链 W 1–246（246 aa）
链 X 1–246（246 aa）
链 a 1–246（246 aa）
链 b 1–246（246 aa）
链 c 1–246（246 aa）
链 d 1–246（246 aa）
链 i 1–246（246 aa）
链 j 1–246（246 aa）
链 k 1–246（246 aa）
链 l 1–246（246 aa）
链 n 1–246（246 aa）
链 o 1–246（246 aa）
链 v 1–246（246 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致
链 A 1–246（246 aa）
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
链 O 1–246（246 aa）
链 P 1–246（246 aa）
链 Q 1–246（246 aa）
链 R 1–246（246 aa）
链 S 1–246（246 aa）
链 T 1–246（246 aa）
链 U 1–246（246 aa）
链 V 1–246（246 aa）
链 W 1–246（246 aa）
链 a 1–246（246 aa）
链 b 1–246（246 aa）
链 c 1–246（246 aa）
链 g 1–246（246 aa）
链 h 1–246（246 aa）
链 i 1–246（246 aa）
链 j 1–246（246 aa）
链 k 1–246（246 aa）
链 l 1–246（246 aa）
链 n 1–246（246 aa）
链 o 1–246（246 aa）
链 v 1–246（246 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致
链 L 1–246（246 aa）
链 R 1–246（246 aa）
链 T 1–246（246 aa）
链 U 1–246（246 aa）
链 V 1–246（246 aa）
链 W 1–246（246 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8K36 Structure of the bacteriophage lambda tail tube 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 A 1–246（246 aa）
链 B 1–246（246 aa）
链 C 1–246（246 aa）
链 D 1–246（246 aa）
链 E 1–246（246 aa）
链 F 1–246（246 aa）
链 G 1–246（246 aa）
链 H 1–246（246 aa）
链 I 1–246（246 aa）
链 J 1–246（246 aa）
链 K 1–246（246 aa）
链 L 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8K37 Structure of the bacteriophage lambda neck 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致
链 G 1–246（246 aa）
链 H 1–246（246 aa）
链 I 1–246（246 aa）
链 J 1–246（246 aa）
链 K 1–246（246 aa）
链 L 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8KGE Dimeric tail tube protein gpVs of bacteriophage lambda 提交 2023-08-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致
链 V 1–246（246 aa）
链 v 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.80 Å
8XPM Mature virion portal of phage lambda with DNA 提交 2024-01-04 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致
链 O 1–246（246 aa）
链 O1 1–246（246 aa）
链 O2 1–246（246 aa）
链 P 1–246（246 aa）
链 P1 1–246（246 aa）
链 P2 1–246（246 aa）
链 Q 1–246（246 aa）
链 Q1 1–246（246 aa）
链 Q2 1–246（246 aa）
链 R 1–246（246 aa）
链 R1 1–246（246 aa）
链 R2 1–246（246 aa）
链 V 1–246（246 aa）
链 V1 1–246（246 aa）
链 V2 1–246（246 aa）
链 o 1–246（246 aa）
链 o1 1–246（246 aa）
链 o2 1–246（246 aa）
链 p 1–246（246 aa）
链 p1 1–246（246 aa）
链 p2 1–246（246 aa）
链 q 1–246（246 aa）
链 q1 1–246（246 aa）
链 q2 1–246（246 aa）
链 r 1–246（246 aa）
链 r1 1–246（246 aa）
链 r2 1–246（246 aa）
链 v 1–246（246 aa）
链 v1 1–246（246 aa）
链 v2 1–246（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.90 Å
9E7M In situ cryoEM structure of bacteriophage Ur-lambda tail tip complex 提交 2024-11-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致
链 Va 3–157（155 aa）
链 Vb 3–157（155 aa）
链 Vc 3–157（155 aa）
链 Vd 3–157（155 aa）
链 Ve 3–157（155 aa）
链 Vf 3–157（155 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。