当前蛋白身份:P04128 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2JTY Self-complemented variant of FimA, the main subunit of type 1 pilus 提交 2007-08-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa) 片段:Fusion protein of Type-1 fimbrial protein and type-1 fimbrial protein
链 A 24–42(19 aa) 片段:Fusion protein of Type-1 fimbrial protein and type-1 fimbrial protein
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)18;压力 ambient
NMR样品组成 1.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] FimA, 50 M H2O, 5 M D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2M5G Solution structure of FimA wt 提交 2013-02-24 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.08;压力 ambient
NMR样品组成 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FimA-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 37–182(146 aa) 片段:UNP residues 37-182
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 37–182(146 aa) 片段:UNP residues 37-182
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 F 37–182(146 aa) 片段:UNP residues 37-182
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 H 37–182(146 aa) 片段:UNP residues 37-182
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;277 K;0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.20 Å R-free 0.300
4DWH Structure of the major type 1 pilus subunit FIMA bound to the FIMC (2.5 A resolution) 提交 2012-02-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 41–182(142 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;40% (v/v) PEG 400 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.294
4DWH Structure of the major type 1 pilus subunit FIMA bound to the FIMC (2.5 A resolution) 提交 2012-02-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 41–182(142 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;40% (v/v) PEG 400 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.294
5NKT FimA wt from E. coli 提交 2017-04-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 2.6;277 K;0.1 M Sodium Malonate, pH 2.6, 45% ammonium sulphate, 23 mg/ml of protein 1:1 mixture with reservoir
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
5OH0 The Cryo-Electron Microscopy Structure of the Type 1 Chaperone-Usher Pilus Rod 提交 2017-07-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 F 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6C53 Cryo-EM structure of the Type 1 pilus rod 提交 2018-01-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 F 24–182(159 aa)
链 G 24–182(159 aa)
链 H 24–182(159 aa)
链 I 24–182(159 aa)
链 J 24–182(159 aa)
链 K 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6R74 N-terminally reversed variant of FimA E. coli 提交 2019-03-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 42–182(141 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3.1;298 K;45% NH4SO2 and 0.1M Sodium Malonate buffer pH 3.1
分辨率 1.81 Å R-free 0.219
6SWH Crystal structure of the ternary complex between the type 1 pilus proteins FimC, FimI and FimA from E. coli 提交 2019-09-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 37–182(146 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;0.8 M sodium formate, 100 mM Tris/acetic acid pH 8.5, 16% PEG 4000 (w/v)
分辨率 2.80 Å R-free 0.207
6SWH Crystal structure of the ternary complex between the type 1 pilus proteins FimC, FimI and FimA from E. coli 提交 2019-09-20 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 37–182(146 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;0.8 M sodium formate, 100 mM Tris/acetic acid pH 8.5, 16% PEG 4000 (w/v)
分辨率 2.80 Å R-free 0.207
6Y7S 2.85 A cryo-EM structure of the in vivo assembled type 1 pilus rod 提交 2020-03-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–182(182 aa)
链 B 1–182(182 aa)
链 C 1–182(182 aa)
链 D 1–182(182 aa)
链 E 1–182(182 aa)
链 F 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;in ddH2O.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
8PSV 2.7 A cryo-EM structure of in vitro assembled type 1 pilus rod 提交 2023-07-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–182(182 aa)
链 B 1–182(182 aa)
链 C 1–182(182 aa)
链 D 1–182(182 aa)
链 E 1–182(182 aa)
链 F 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;in ddH2O.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting
分辨率 2.70 Å
8PTU 2.5 A cryo-EM structure of the in vitro FimD-catalyzed assembly of type 1 pilus rod 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–182(182 aa)
链 B 1–182(182 aa)
链 C 1–182(182 aa)
链 D 1–182(182 aa)
链 E 1–182(182 aa)
链 F 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;in ddH2O.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting
分辨率 2.52 Å
9FTT Cryo-EM structure of the type 1 pilus rod as part of the FimA-bound usher complex (FimDHGFAnC) 提交 2024-06-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 F 24–182(159 aa)
链 G 24–182(159 aa)
链 H 24–182(159 aa)
链 I 24–182(159 aa)
链 J 24–182(159 aa)
链 K 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9FW9 Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnC - body 2) 提交 2024-06-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
9FWB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn and FimAn-1) 提交 2024-06-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9FWZ Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn, FimAn-1 and FimAn-2) 提交 2024-07-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9FX0 Cryo-EM structure of the type 1 pilus tip-to-rod transition 提交 2024-07-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 G 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9FXA Cryo-EM structure of the type 1 pilus rod as part of the FimI-bound usher complex (FimDHGFAnIC - body 1) 提交 2024-07-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 F 24–182(159 aa)
链 G 24–182(159 aa)
链 H 24–182(159 aa)
链 I 24–182(159 aa)
链 J 24–182(159 aa)
链 K 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.00 Å
9FXB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimI-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnIC - body 2) 提交 2024-07-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.30 Å
9VKV Cryo-EM structure of the type I pilus from Escherichia Coli and the surrounding water network 提交 2025-06-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 F 24–182(159 aa)
链 G 24–182(159 aa)
链 H 24–182(159 aa)
链 I 24–182(159 aa)
链 J 24–182(159 aa)
链 K 24–182(159 aa)
链 L 24–182(159 aa)
链 M 24–182(159 aa)
链 N 24–182(159 aa)
链 O 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.09 Å
9X67 Cryo-EM structure of the type I pilus from Escherichia Coli and the surrounding water network 提交 2025-10-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 A 24–182(159 aa)
链 B 24–182(159 aa)
链 C 24–182(159 aa)
链 D 24–182(159 aa)
链 E 24–182(159 aa)
链 F 24–182(159 aa)
链 G 24–182(159 aa)
链 H 24–182(159 aa)
链 I 24–182(159 aa)
链 J 24–182(159 aa)
链 K 24–182(159 aa)
链 L 24–182(159 aa)
链 M 24–182(159 aa)
链 N 24–182(159 aa)
链 O 24–182(159 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 1.85 Å