当前蛋白身份:P04386
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AW6 GAL4 (CD), NMR, 24 STRUCTURES 提交 1997-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–43(43 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN
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未记录 | CD CADMIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2;298 K
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分辨率未提供 |
| 1D66 DNA RECOGNITION BY GAL4: STRUCTURE OF A PROTEIN/DNA COMPLEX 提交 1992-03-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–65(65 aa)
链 B
1–65(65 aa)
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未记录 | CD CADMIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.70 Å |
| 1HBW Solution nmr structure of the dimerization domain of the yeast transcriptional activator Gal4 (residues 50-106) 提交 2001-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
50–106(57 aa)
片段:DIMERIZATION DOMAIN RESIDUES 50-106
链 B
50–106(57 aa)
片段:DIMERIZATION DOMAIN RESIDUES 50-106
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突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50 MM SODIUM PHOSPHATE
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分辨率未提供 |
| 3BTS Crystal structure of a ternary complex of the transcriptional repressor Gal80p (Gal80S0 [G301R]) and the acidic activation domain of Gal4p (aa 854-874) from Saccharomyces cerevisiae with NAD 提交 2007-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 E
854–874(21 aa)
片段:S. cerevisiae Gal4p peptide; UNP residues 854-874
链 F
854–874(21 aa)
片段:S. cerevisiae Gal4p peptide; UNP residues 854-874
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未记录 | NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;20% PEG 3350, 0.15M Sodium fluoride, followed by
soaking in NAD to a final concentration of 5mM, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
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分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 3COQ Structural Basis for Dimerization in DNA Recognition by Gal4 提交 2008-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
8–96(89 aa)
片段:DNA binding domain with complete dimerization domain
链 B
8–96(89 aa)
片段:DNA binding domain with complete dimerization domain
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;298 K;40mM Mg(OAc)2, 25mM sodium phosphate, 5% PEG400, 5% MPD, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.269 |
| 7UIK Mediator-PIC Early (Tail A + Upstream DNA & Activator) 提交 2022-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 T
1–147(147 aa)
链 U
1–147(147 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 7.70 Å |
| 7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:80-meric(80) 与全部聚合物一致 |
链 GA
1–147(147 aa)
链 GB
1–147(147 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |