当前蛋白身份:P04386 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1AW6 GAL4 (CD), NMR, 24 STRUCTURES 提交 1997-10-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–43(43 aa) 片段:DNA-BINDING DOMAIN
未记录 CD CADMIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2;298 K
分辨率未提供
1D66 DNA RECOGNITION BY GAL4: STRUCTURE OF A PROTEIN/DNA COMPLEX 提交 1992-03-06 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–65(65 aa)
链 B 1–65(65 aa)
未记录 CD CADMIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.70 Å
1HBW Solution nmr structure of the dimerization domain of the yeast transcriptional activator Gal4 (residues 50-106) 提交 2001-04-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 50–106(57 aa) 片段:DIMERIZATION DOMAIN RESIDUES 50-106
链 B 50–106(57 aa) 片段:DIMERIZATION DOMAIN RESIDUES 50-106
突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;308 K;离子强度(mmCIF原始值)50 MM SODIUM PHOSPHATE
分辨率未提供
3BTS Crystal structure of a ternary complex of the transcriptional repressor Gal80p (Gal80S0 [G301R]) and the acidic activation domain of Gal4p (aa 854-874) from Saccharomyces cerevisiae with NAD 提交 2007-12-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 E 854–874(21 aa) 片段:S. cerevisiae Gal4p peptide; UNP residues 854-874
链 F 854–874(21 aa) 片段:S. cerevisiae Gal4p peptide; UNP residues 854-874
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;20% PEG 3350, 0.15M Sodium fluoride, followed by soaking in NAD to a final concentration of 5mM, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.70 Å R-free 0.232
3COQ Structural Basis for Dimerization in DNA Recognition by Gal4 提交 2008-03-29 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 8–96(89 aa) 片段:DNA binding domain with complete dimerization domain
链 B 8–96(89 aa) 片段:DNA binding domain with complete dimerization domain
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;298 K;40mM Mg(OAc)2, 25mM sodium phosphate, 5% PEG400, 5% MPD, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.269
7UIK Mediator-PIC Early (Tail A + Upstream DNA & Activator) 提交 2022-03-29 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 T 1–147(147 aa)
链 U 1–147(147 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
7UIO Mediator-PIC Early (Composite Model) 提交 2022-03-29 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:80-meric(80) 与全部聚合物一致
链 GA 1–147(147 aa)
链 GB 1–147(147 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 THR THREONINE × 1 ALA ALANINE × 1 ASP ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å