当前蛋白身份：P04584
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1E0E N-terminal zinc-binding HHCC domain of HIV-2 integrase 提交 2000-03-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
744–798（55 aa）
片段：N-TERMINAL HHCC DOMAIN
链 B
744–798（55 aa）
片段：N-TERMINAL HHCC DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K
NMR样品组成
D2O AND 5% D2O/95% H2O
|
分辨率未提供 |
| 1HII COMPARATIVE ANALYSIS OF THE X-RAY STRUCTURES OF HIV-1 AND HIV-2 PROTEASES IN COMPLEX WITH CGP 53820, A NOVEL PSEUDOSYMMETRIC INHIBITOR 提交 1995-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 C20 ACETYL-NH-VAL-CYCLOHEXYL-CH2[NCH2CHOH]CH2-BENZYL-VAL-NH-ACETYL × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1HSH CRYSTAL STRUCTURE AT 1.9 ANGSTROMS RESOLUTION OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) II PROTEASE COMPLEXED WITH L-735,524, AN ORALLY BIOAVAILABLE INHIBITOR OF THE HIV PROTEASES 提交 1995-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 1HSH CRYSTAL STRUCTURE AT 1.9 ANGSTROMS RESOLUTION OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) II PROTEASE COMPLEXED WITH L-735,524, AN ORALLY BIOAVAILABLE INHIBITOR OF THE HIV PROTEASES 提交 1995-03-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
86–184（99 aa）
链 D
86–184（99 aa）
|
未记录 | MK1 N-[2(R)-HYDROXY-1(S)-INDANYL]-5-[(2(S)-TERTIARY BUTYLAMINOCARBONYL)-4(3-PYRIDYLMETHYL)PIPERAZINO]-4(S)-HYDROXY-2(R)-PHENYLMETHYLPENTANAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 1HSI CRYSTAL STRUCTURE AT 1.9 ANGSTROMS RESOLUTION OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) II PROTEASE COMPLEXED WITH L-735,524, AN ORALLY BIOAVAILABLE INHIBITOR OF THE HIV PROTEASES 提交 1995-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1IDA CRYSTAL STRUCTURES OF HIV-2 PROTEASE IN COMPLEX WITH INHIBITORS CONTAINING THE HYDROXYETHYLAMINE DIPEPTIDE ISOSTERE 提交 1994-10-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
514–612（99 aa）
片段：rsidues 514-622
链 B
514–612（99 aa）
片段：rsidues 514-622
|
未记录 | 0PO N-[(1R)-1-{[(1S,2S)-1-benzyl-3-{(2R,4S)-2-(tert-butylcarbamoyl)-4-[(pyridin-3-ylmethyl)sulfanyl]piperidin-1-yl}-2-hydroxypropyl]carbamoyl}-2-methylpropyl]quinoline-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1IVP THE CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF THE PROTEASE FROM HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 2 WITH TWO SYNTHETIC PEPTIDIC TRANSITION STATE ANALOG INHIBITORS 提交 1993-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | 1ZK 4-[(2R)-3-{[(1S,2S,3R,4S)-1-(cyclohexylmethyl)-2,3-dihydroxy-5-methyl-4-({(1S,2R)-2-methyl-1-[(pyridin-2-ylmethyl)carba moyl]butyl}carbamoyl)hexyl]amino}-2-{[(naphthalen-1-yloxy)acetyl]amino}-3-oxopropyl]-1H-imidazol-3-ium × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1IVQ THE CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF THE PROTEASE FROM HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 2 WITH TWO SYNTHETIC PEPTIDIC TRANSITION STATE ANALOG INHIBITORS 提交 1993-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | 0PX N~1~-{(1S,2S,4S)-1-(cyclohexylmethyl)-4-[(2,2-dimethylpropyl)carbamoyl]-2-hydroxy-5-methylhexyl}-N~2~-(quinolin-2-ylcar bonyl)-L-aspartamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 1MU2 CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-2 REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 2002-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
185–739（555 aa）
链 B
190–615（426 aa）
片段：residues 6-431
|
突变：R286S 突变：R286S | SO4 SULFATE ION × 22 GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；(NH4)2SO4, TRIS, DMSO, GLYCEROL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.240 |
| 2HPE COMPARISON OF THE STRUCTURES OF HIV-2 PROTEASE COMPLEXES IN THREE CRYSTAL SPACE GROUPS WITH AN HIV-1 PROTEASE COMPLEX STRUCTURE 提交 1994-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 2HPF COMPARISON OF THE STRUCTURES OF HIV-2 PROTEASE COMPLEXES IN THREE CRYSTAL SPACE GROUPS WITH AN HIV-1 PROTEASE COMPLEX STRUCTURE 提交 1994-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 2K4E Solution structure of the HIV-2 UNMYRISTOYLATED MATRIX PROTEIN 提交 2008-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–135（134 aa）
片段：UNP residues 2 to 135
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-15N] HIV-2 unmyristoylated matrix protein, 20 mM potassium phosphate, 10 mM DTT, 50 mM Glutamate, 50 mM Aspartate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM HIV-2 unmyristoylated matrix protein, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-13C; U-15N] HIV-2 unmyristoylated matrix protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K4H Solution structure of the HIV-2 myristoylated Matrix protein 提交 2008-06-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–135（134 aa）
片段：UNP residues 2 to 135
|
未记录 | MYR MYRISTIC ACID × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-15N] HIV-2 myristoylated matrix protein, 20 mM potassium phosphate, 10 mM DTT, 50 mM Glutamate, 50 mM Aspartate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM HIV-2 myristoylated matrix protein, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-13C; U-15N] HIV-2 myristoylated matrix protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K4I Solution structure of HIV-2 myrMA bound to di-C4-PI(4,5)P2 提交 2008-06-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–135（134 aa）
片段：UNP residues 2 to 135
|
未记录 | MYR MYRISTIC ACID × 1 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-15N] HIV-2 myristoylated matrix protein, 20 mM potassium phosphate, 10 mM DTT, 50 mM Glutamate, 50 mM Aspartate, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.8 mM HIV-2 myristoylated matrix protein, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-13C; U-15N] HIV-2 myristoylated matrix protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MIP CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) TYPE 2 PROTEASE IN COMPLEX WITH A REDUCED AMIDE INHIBITOR AND COMPARISON WITH HIV-1 PROTEASE STRUCTURES 提交 1993-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2MIP CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV) TYPE 2 PROTEASE IN COMPLEX WITH A REDUCED AMIDE INHIBITOR AND COMPARISON WITH HIV-1 PROTEASE STRUCTURES 提交 1993-06-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
86–184（99 aa）
链 D
86–184（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 3EBZ High Resolution HIV-2 Protease Structure in Complex with Clinical Drug Darunavir 提交 2008-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
514–612（99 aa）
链 B
514–612（99 aa）
|
未记录 | IMD IMIDAZOLE × 6 ZN ZINC ION × 9 CL CHLORIDE ION × 8 NA SODIUM ION × 1 017 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(1S,2R)-3-[[(4-AMINOPHENYL)SULFONYL](ISOBUTYL)AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYLCARBAMATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；293 K；0.6-0.7M imidazole, 0.12-0.14M Zn(OAc)2 buffer, 1.25-2M NaCl, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.181 |
| 3EC0 High Resolution HIV-2 Protease Structure in Complex with Antiviral Inhibitor GRL-06579A 提交 2008-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
514–612（99 aa）
链 B
514–612（99 aa）
|
未记录 | GRL (3AS,5R,6AR)-HEXAHYDRO-2H-CYCLOPENTA[B]FURAN-5-YL (2S,3S)-3-HYDROXY-4-(4-(HYDROXYMETHYL)-N-ISOBUTYLPHENYLSULFONAMIDO)-1-PHENYLBUTAN-2-YLCARBAMATE × 1 IMD IMIDAZOLE × 6 ZN ZINC ION × 10 CL CHLORIDE ION × 8 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；293 K；0.6-0.7M imidazole, 0.12-0.14M Zn(OAc)2 buffer, 1.25-2M NaCl, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.206 |
| 3ECG High Resolution HIV-2 Protease Structure in Complex with Antiviral Inhibitor GRL-98065 提交 2008-08-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
514–612（99 aa）
链 B
514–612（99 aa）
|
未记录 | 065 (3R,3AS,6AR)-HEXAHYDROFURO[2,3-B]FURAN-3-YL(2S,3R)-3-HYDROXY-4-(N-ISOBUTYLBENZO[D][1,3]DIOXOLE-5-SULFONAMIDO)-1-PHENYLBUTAN-2-YLCARBAMATE × 1 IMD IMIDAZOLE × 6 ZN ZINC ION × 11 CL CHLORIDE ION × 9 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；293 K；0.6-0.7M imidazole, 0.12-0.14M Zn(OAc)2 buffer, 1.25-2M NaCl, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.18 Å R-free 0.188 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 B
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 k
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 l
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 o
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 p
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 s
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 t
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 13 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 E
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 F
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 U
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 V
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 g
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 h
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 14 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 B
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 I
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 J
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 Y
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 Z
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 15 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 k
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 l
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 o
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 p
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 s
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 t
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 16 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 M
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 N
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 Q
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 R
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 c
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 d
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 F
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 J
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 M
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 N
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 R
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 U
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 V
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Y
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 Z
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 c
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 d
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3F9K Two domain fragment of HIV-2 integrase in complex with LEDGF IBD 提交 2008-11-14 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 g
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
链 h
1173–1380（208 aa）
片段：N-terminal and catalytic domains, UNP residues 1173-1380
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.6M sodium acetate, 10mM MgCl2, 0.1M Bis-Tris Propane-HCl, pH7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.234 |
| 3UPJ HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 2 PROTEASE MUTANT WITH LYS 57 REPLACED BY LEU (K57L) COMPLEX WITH U096333 [4-HYDROXY-3-[1-(PHENYL)PROPYL]-7-METHOXYCOUMARIN] 提交 1996-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
|
突变：K57L 突变：K57L | U03 4-HYDROXY-7-METHOXY-3-(1-PHENYL-PROPYL)-CHROMEN-2-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；pH 7.2
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分辨率 2.50 Å |
| 4UPJ HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 2 PROTEASE MUTANT WITH LYS 57 REPLACED BY LEU (K57L) COMPLEX WITH U097410 [4-HYDROXY-3-[1-[3-[[[[(TERT-BUTYLOXYCARBONYL) AMINOMETHYL]CARBONYL]AMINO]PHENYL]PROPYL]COUMARIN 提交 1996-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
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突变：K57L 突变：K57L | U04 ({3-[1-(4-HYDROXY-2-OXO-2H-CHROMEN-3-YL)-PROPYL]-PHENYLCARBAMOYL}-METHYL)-CARBAMIC ACID TERT-BUTYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.0
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分辨率 1.90 Å |
| 5UPJ HIV-2 PROTEASE/U99283 COMPLEX 提交 1996-12-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
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突变：K57L 突变：K57L | UIN 5,6,7,8,9,10-HEXAHYDRO-4-HYDROXY-3-(1-PHENYLPROPYL)CYCLOOCTA[B]PYRAN-2-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；CRYSTALS WERE GROWN AT ROOM TEMPERATURE IN 4-7 UL HANGING DROPS OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 8-10 MG/L AND WELL SOLUTION OF 30-35%(W/V) PEG 4000 IN 0.1 M HEPES AND PH RANGE 6.8 - 7.6., pH 7.1, vapor diffusion - hanging drop
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分辨率 2.30 Å |
| 6UPJ HIV-2 PROTEASE/U99294 COMPLEX 提交 1996-12-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
86–184（99 aa）
链 B
86–184（99 aa）
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突变：K57L 突变：K57L | NIU 6,7,8,9-TETRAHYDRO-4-HYDROXY-3-(1-PHENYLPROPYL)CYCLOHEPTA[B]PYRAN-2-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；CRYSTALS WERE GROWN AT ROOM TEMPERATURE IN 4-7 UL HANGING DROPS OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 8-10 MG/L AND WELL SOLUTION OF 30-35%(W/V) PEG 4000 IN 0.1 M HEPES AND PH RANGE 6.8 - 7.6., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.34 Å |