当前蛋白身份：P06766
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BNO NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF DNA POLYMERASE BETA, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–86（86 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1 - 87
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；300 K
|
分辨率未提供 |
| 1BNP NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF DNA POLYMERASE BETA, 55 STRUCTURES 提交 1996-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–86（86 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1 - 87
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；300 K
|
分辨率未提供 |
| 1BPB CRYSTAL STRUCTURE OF RAT DNA POLYMERASE BETA: EVIDENCE FOR A COMMON POLYMERASE MECHANISM 提交 1994-04-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1BPD CRYSTAL STRUCTURE OF RAT DNA POLYMERASE BETA: EVIDENCE FOR A COMMON POLYMERASE MECHANISM 提交 1994-04-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–334（334 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.60 Å |
| 1BPE CRYSTAL STRUCTURE OF RAT DNA POLYMERASE BETA; EVIDENCE FOR A COMMON POLYMERASE MECHANISM 提交 1994-04-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–334（334 aa）
|
未记录 | DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1DK2 REFINED SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF DNA POLYMERASE BETA 提交 1999-12-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–86（86 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-87
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）400 mM NACL；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NACL；压力 AMBIENT
NMR样品组成
2.8 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N,13C; 5MM TRIS-
D11; 400MM NACL
NMR样品组成
2 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N; 5MM TRIS-D11;
100MM NACL
NMR样品组成
4 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N; 5MM TRIS-D11;
400MM NACL
NMR样品组成
2.8 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N,13C; 5MM TRIS-
D11; 400MM NACL
NMR样品组成
1.4 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87); 5MM TRIS-D11; 400MM
NACL
|
分辨率未提供 |
| 1DK3 REFINED SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF DNA POLYMERASE BETA 提交 1999-12-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–87（87 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-87
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.7；300 K；离子强度（mmCIF原始值）400；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 AMBIENT
NMR样品组成
2.8 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N,13C; 5MM TRIS-
D11; 400MM NACL
NMR样品组成
2 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N; 5MM TRIS-D11;
100MM NACL
NMR样品组成
4 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N; 5MM TRIS-D11;
400MM NACL
NMR样品组成
2.8 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87) U-15N,13C; 5MM TRIS-
D11; 400MM NACL
NMR样品组成
1.4 MM RAT DNA POLYMERASE BETA N-TERMINAL DOMAIN (2-87); 5MM TRIS-D11; 400MM
NACL
|
分辨率未提供 |
| 1HUO CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DNA AND CR-TMPPCP 提交 2001-01-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–335（335 aa）
|
未记录 | CR CHROMIUM ION × 1 TTE PHOSPHOMETHYL PHOSPHONIC ACID DEOXYTHYMIDYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；8% PEG 3350, 70mM lithium sulfate, 100mM MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.288 |
| 1HUO CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE BETA COMPLEXED WITH DNA AND CR-TMPPCP 提交 2001-01-04 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–335（335 aa）
|
未记录 | CR CHROMIUM ION × 1 TTE PHOSPHOMETHYL PHOSPHONIC ACID DEOXYTHYMIDYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；8% PEG 3350, 70mM lithium sulfate, 100mM MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.288 |
| 1HUZ CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH DNA AND CR-PCP 提交 2001-01-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–335（335 aa）
|
未记录 | CR CHROMIUM ION × 1 MDN METHYLENEDIPHOSPHONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；8% PEG3350, 70mM lithium sulfate, 100mM MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.286 |
| 1HUZ CRYSTAL STRUCTURE OF DNA POLYMERASE COMPLEXED WITH DNA AND CR-PCP 提交 2001-01-04 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–335（335 aa）
|
未记录 | CR CHROMIUM ION × 1 MDN METHYLENEDIPHOSPHONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；8% PEG3350, 70mM lithium sulfate, 100mM MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.286 |
| 1JN3 FIDELITY PROPERTIES AND STRUCTURE OF M282L MUTATOR MUTANT OF DNA POLYMERASE: SUBTLE STRUCTURAL CHANGES INFLUENCE THE MECHANISM OF NUCLEOTIDE DISCRIMINATION 提交 2001-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
84–334（251 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 85 - 335
|
突变：M282L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；16% PEG 3350, 5mM ammonium sulfate, 150mM sodium acetate, 50mM HEPES,
pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.256 |
| 1NOM DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (5 MILLIMOLAR) 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 1 MONTH: PEG 1500, 15% HEPES, 75 MILLIMOLAR, PH 7.5 NACL, 50 MILLIMOLAR DTT, 0.1 MILLIMOLAR MNCL2, 5 MILLIMOLAR SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE., pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å |
| 1RPL 2.3 ANGSTROMS CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF DNA POLYMERASE BETA 提交 1994-10-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
84–334（251 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1ZQU DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF ARTIFICIAL MOTHER LIQUOR 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 24 HOURS: PEG 3350, 16% IMIDAZOLE, 100 MILLIMOLAR, PH 6.5 SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE.
|
分辨率 2.60 Å |
| 1ZQV DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF CACL2 (150 MILLIMOLAR) 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 24 HOURS: PEG 3350, 16% IMIDAZOLE, 100 MILLIMOLAR, PH 6.5 CACL2, 150 MILLIMOLAR SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE.
|
分辨率 2.70 Å |
| 1ZQW DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF CSCL (150 MILLIMOLAR) 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 24 HOURS: PEG 3350, 16% IMIDAZOLE, 100 MILLIMOLAR, PH 6.5 CSCL, 150 MILLIMOLAR SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE.
|
分辨率 2.30 Å |
| 1ZQX DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF KCL (150 MILLIMOLAR) 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 24 HOURS: PEG 3350, 16% TRIS-HCL, 100 MILLIMOLAR, PH 7.5 KCL, 150 MILLIMOLAR SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE.
|
分辨率 2.50 Å |
| 1ZQY DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF MGCL2 (50 MILLIMOLAR) 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 24 HOURS: PEG 3350, 16% TRIS-HCL, 100 MILLIMOLAR, PH 7.5 MGCL2, 50 MILLIMOLAR SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE.
|
分辨率 2.30 Å |
| 1ZQZ DNA POLYMERASE BETA (POL B) (E.C.2.7.7.7), 31-KD DOMAIN; SOAKED IN THE PRESENCE OF MNCL2 (50 MILLIMOLAR) 提交 1996-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
片段：C-TERMINAL 31-KD DOMAIN (RESIDUES 88 - 335)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；THIS ENTRY DESCRIBES THE STRUCTURE THAT RESULTED WHEN A CRYSTAL OF THE C-TERMINAL 31-KD DOMAIN OF RAT DNA POL BETA (SEE ENTRY 1BPB AND REFERENCE 9) HAD BEEN SOAKED IN THE FOLLOWING SOLUTION FOR 24 HOURS: PEG 3350, 16% TRIS-HCL, 100 MILLIMOLAR, PH 7.5 MNCL2, 50 MILLIMOLAR SEE REFERENCE 3 FOR DETAILS CONCERNING EXPERIMENTAL PROCEDURES, RESULTS, AND DISCUSSION FOR THIS STRUCTURE.
|
分辨率 2.70 Å |
| 2BPC CRYSTAL STRUCTURE OF RAT DNA POLYMERASE BETA: EVIDENCE FOR A COMMON POLYMERASE MECHANISM 提交 1994-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
87–334（248 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 2BPF STRUCTURES OF TERNARY COMPLEXES OF RAT DNA POLYMERASE BETA, A DNA TEMPLATE-PRIMER, AND DDCTP 提交 1994-05-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–334（334 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.90 Å |
| 2BPG STRUCTURES OF TERNARY COMPLEXES OF RAT DNA POLYMERASE BETA, A DNA TEMPLATE-PRIMER, AND DDCTP 提交 1994-05-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–334（334 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 3.60 Å |
| 2BPG STRUCTURES OF TERNARY COMPLEXES OF RAT DNA POLYMERASE BETA, A DNA TEMPLATE-PRIMER, AND DDCTP 提交 1994-05-19 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–334（334 aa）
|
未记录 | DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 3.60 Å |
| 2VAN Nucleotidyl Transfer Mechanism of Mismatched dNTP Incorporation by DNA Polymerase b by Structural and Kinetic Analyses 提交 2007-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
90–334（245 aa）
片段：31K DOMAIN, RESIDUES 90-334
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.249 |
| 3K75 X-ray crystal structure of reduced XRCC1 bound to DNA pol beta catalytic domain 提交 2009-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
91–335（245 aa）
片段：UNP residues 91 to 335
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2-0.3M Tri-potassium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.295 |
| 3K75 X-ray crystal structure of reduced XRCC1 bound to DNA pol beta catalytic domain 提交 2009-10-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
91–335（245 aa）
片段：UNP residues 91 to 335
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2-0.3M Tri-potassium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.295 |
| 3LQC X-ray crystal structure of oxidized XRCC1 bound to DNA pol beta Palm thumb domain 提交 2010-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
142–335（194 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CO3 CARBONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2-0.3M TRI-POTASSIUM CITRATE, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.250 |
| 3UXN Crystal Structure of Rat DNA Polymerase Beta, Wild Type Apoenzyme 提交 2011-12-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–335（335 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；PEG 3350, MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.317 |
| 3UXN Crystal Structure of Rat DNA Polymerase Beta, Wild Type Apoenzyme 提交 2011-12-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–335（335 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；PEG 3350, MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.317 |
| 3UXO Crystal Structure of Rat DNA Polymerase Beta Mutator I260Q Apoenzyme 提交 2011-12-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–335（335 aa）
|
突变：I260Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；PEG 3350, MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.318 |
| 3UXO Crystal Structure of Rat DNA Polymerase Beta Mutator I260Q Apoenzyme 提交 2011-12-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–335（335 aa）
|
突变：I260Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；296 K；PEG 3350, MES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.318 |
| 3UXP Co-crystal Structure of Rat DNA polymerase beta Mutator I260Q: Enzyme-DNA-ddTTP 提交 2011-12-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–335（335 aa）
|
突变：I260Q | D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；Peg3350, NaCl, Glycerol, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.292 |
| 3UXP Co-crystal Structure of Rat DNA polymerase beta Mutator I260Q: Enzyme-DNA-ddTTP 提交 2011-12-05 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–335（335 aa）
|
突变：I260Q | D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；Peg3350, NaCl, Glycerol, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.292 |
| 3V72 Crystal Structure of Rat DNA polymerase beta Mutator E295K: Enzyme-dsDNA 提交 2011-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–335（335 aa）
|
突变：E295K | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；296 K；PEG 3350, NaCl, Glycerol, Cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 296K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.291 |
| 3V7J Co-crystal structure of Wild Type Rat polymerase beta: Enzyme-DNA binary complex 提交 2011-12-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
4–335（332 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；PEG 3350, NaCl, Glycerol, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
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分辨率 2.25 Å R-free 0.243 |
| 3V7K Co-crystal structure of K72E variant of rat polymerase beta: Enzyme-DNA binary complex 提交 2011-12-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
4–335（332 aa）
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突变：K72E | NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；PEG 3350, NaCl, Glycerol, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
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分辨率 2.27 Å R-free 0.277 |
| 3V7L Apo Structure of Rat DNA polymerase beta K72E variant 提交 2011-12-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–335（332 aa）
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突变：K72E | NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；296 K；PEG 3350, NaCl, Glycerol, Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 296K
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分辨率 2.66 Å R-free 0.335 |