当前蛋白身份：P08238
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1QZ2 Crystal Structure of FKBP52 C-terminal Domain complex with the C-terminal peptide MEEVD of Hsp90 提交 2003-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
719–723（5 aa）
链 H
719–723（5 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；Sodium Citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 1UYM Human Hsp90-beta with PU3 (9-Butyl-8(3,4,5-trimethoxy-benzyl)-9H-purin-6-ylamine) 提交 2004-03-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–220（220 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-220
|
未记录 | PU3 9-BUTYL-8-(3,4,5-TRIMETHOXYBENZYL)-9H-PURIN-6-AMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；25% PEG MME 2000, 0.1M NA CACODYLATE, PH6.5, 0.2M MGCL2., pH 6.50
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.294 |
| 3FWV Crystal Structure of a Redesigned TPR Protein, T-MOD(VMY), in Complex with MEEVF Peptide 提交 2009-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
719–723（5 aa）
片段：C-terminal residues
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NI NICKEL (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG MME 2000, 5-10 mM NiCl2, 10% xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.244 |
| 3FWV Crystal Structure of a Redesigned TPR Protein, T-MOD(VMY), in Complex with MEEVF Peptide 提交 2009-01-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
719–723（5 aa）
片段：C-terminal residues
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NI NICKEL (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；100 mM Tris pH 8.5, 30% PEG MME 2000, 5-10 mM NiCl2, 10% xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.244 |
| 3NMQ Hsp90b N-terminal domain in complex with EC44, a pyrrolo-pyrimidine methoxypyridine inhibitor 提交 2010-06-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–223（223 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-223)
|
未记录 | 7PP 5-{2-amino-4-chloro-7-[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}-2-methylpent-4-yn-2 -ol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1M Na Cacodylate, 20% PEG 2000 MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.267 |
| 3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
284–543（260 aa）
片段：middle domain (UNP residues 284-543)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.217 |
| 3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
284–543（260 aa）
片段：middle domain (UNP residues 284-543)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.217 |
| 3PRY Crystal structure of the middle domain of human HSP90-beta refined at 2.3 A resolution 提交 2010-11-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
284–543（260 aa）
片段：middle domain (UNP residues 284-543)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；25.5% PEG3350, 0.17 M ammonium sulfate, 15% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.217 |
| 5FWK Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
片段：FULL LENGTH
链 B
1–724（724 aa）
片段：FULL LENGTH
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 5FWL Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 5FWM Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 5FWP Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM Tris-HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl, 10 mM KCl, 10 mM MgCl2, 20 mM Na2MoO4, 2mM DTT, 0.085mM DDM
cryo-EM玻璃化条件
Single blot from 4 to 6 seconds, at 20C；95 K；冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–218（218 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)
|
未记录 | 83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.207 |
| 5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)
|
未记录 | 83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.207 |
| 5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–218（218 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)
|
未记录 | 83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.207 |
| 5UC4 Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-218)
|
未记录 | 83S 5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylbenzaldehyde × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.207 |
| 5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.226 |
| 5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.226 |
| 5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.226 |
| 5UCH Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 871 2-(5-Hydroxy-4-(isoindoline-2-carbonyl)-2-isopropylphenyl)acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.226 |
| 5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
| 5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
| 5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
| 5UCI Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | 874 (2,4-Dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-5-isopropylphenyl)(isoindolin-2-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.238 |
| 5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.197 |
| 5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.197 |
| 5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.197 |
| 5UCJ Hsp90b N-terminal domain with inhibitors 提交 2016-12-22 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
片段：UNP residues 1-218
|
未记录 | KU3 (5-fluoroisoindolin-2-yl)(4-hydroxy-5-isopropylbenzo[d]isoxazol-7-yl)methanone × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；30% PEG 8,000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 sodium cacodylate pH 6.5
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.197 |
| 6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–231（231 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.286 |
| 6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–231（231 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.286 |
| 6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–231（231 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.286 |
| 6N8W Structure of Unliganded Hsp90-Beta N-Terminal Domain 提交 2018-11-30 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–231（231 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；296 K；Tris-HCl pH 8.5, MgCl2, PEG 4000, Glycerol
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.286 |
| 6N8Y Hsp90-beta bound to PU-11-trans 提交 2018-11-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–221（221 aa）
|
未记录 | KFY 9-[(2E)-but-2-en-1-yl]-8-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)methyl]-9H-purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES pH 6.5, MgCl2, PEG 2000 MME. Incubate with PU-11-trans prior to setup.
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.183 |
| 7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–218（218 aa）
|
未记录 | 42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.219 |
| 7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–218（218 aa）
|
未记录 | 42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.219 |
| 7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–218（218 aa）
|
未记录 | 42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.219 |
| 7ULJ Hsp90b N-terminal domain in complex with 42C 提交 2022-04-05 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–218（218 aa）
|
未记录 | 42C N,N-dimethyl-7H-purin-6-amine × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 0.1 M Sodium acetate, 5% MPD and 25% PEG8000
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.219 |
| 7Z37 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-II) 提交 2022-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 AP1
3–724（722 aa）
链 BP1
3–724（722 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 3.67 Å |
| 7Z38 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-I) 提交 2022-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–724（722 aa）
链 B
3–724（722 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
|
分辨率 3.16 Å |
| 7ZR0 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E) complex. 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7ZR5 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(closed) complex 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7ZR6 CryoEM structure of HSP90-CDC37-BRAF(V600E)-PP5(open) complex 提交 2022-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7ZUB Cryo-EM structure of the indirubin-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2022-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–724（723 aa）
链 B
2–724（723 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MOO MOLYBDATE ION × 2 JY6 (3~{Z})-3-(3-oxidanylidene-1~{H}-indol-2-ylidene)-1~{H}-indol-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |
| 8EOA Cryo-EM structure of human HSP90B-AIPL1 complex 提交 2022-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–724（723 aa）
链 B
2–724（723 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8EOB Cryo-EM structure of human HSP90B in the closed state 提交 2022-10-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–724（723 aa）
链 B
2–724（723 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES, 200 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8GAE Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3UL OF SAMPLE
10C
100% HUMIDITY
30S WAIT TIME
3S BLOT TIME
-2 BLOT FORCE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8GFT Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-03-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3uL OF SAMPLE, 10C, 100%
HUMIDITY, 30S WAIT TIME, 3S
BLOT TIME, -2 BLOT FORCE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8QMO Cryo-EM structure of the benzo[a]pyrene-bound Hsp90-XAP2-AHR complex 提交 2023-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–724（723 aa）
链 B
2–724（723 aa）
|
未记录 | MOO MOLYBDATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 W62 benzo[a]pyrene × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9D9H Human Hsp90b nucleotide binding domain in complex with BRI2311 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–223（223 aa）
片段：nucleotide binding domain
|
未记录 | A1A26 (1P)-3-amino-6-[({1-[(2S)-2-(2,4-difluorophenyl)-2-hydroxy-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propyl]piperidin-4-yl}amino)methyl]-1-(4-phenyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)thieno[2,3-b]pyrazin-2(1H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；21% PEG8000, 0.1M Hepes pH 7.5,1M LiCl
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.208 |
| 9D9I Human Hsp90b nucleotide binding domain in complex with BRI2312 提交 2024-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–223（223 aa）
片段：nucleotide binding domain
|
未记录 | A1A24 (1P)-3-amino-6-[({1-[(2R)-2-(2,4-difluorophenyl)-2-hydroxy-3-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)propyl]piperidin-4-yl}amino)methyl]-1-(4-phenyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-6-yl)thieno[2,3-b]pyrazin-2(1H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；21% PEG6000, 0.1M NaCacodylate pH 6.6, 1M Li
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.187 |
| 9W5I AGO maturation complex (AMC): AGO2-miRNA duplex in complex with Hsp90 beta and co-chaperone p23 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–724（724 aa）
链 B
1–724（724 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |