当前蛋白身份：P08767
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M06 Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, X-Ray Crystallography 提交 2002-06-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：240-MERIC（240） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；318.15 K；3-5% PEG8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 1 mM EDTA, 300 mM NaCl, 0.1 mM-mercapto-ethanol, and 0.02 % sodium azide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 318.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.234 |
| 1M06 Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, X-Ray Crystallography 提交 2002-06-12 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；318.15 K；3-5% PEG8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 1 mM EDTA, 300 mM NaCl, 0.1 mM-mercapto-ethanol, and 0.02 % sodium azide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 318.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.234 |
| 1M06 Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, X-Ray Crystallography 提交 2002-06-12 | Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；318.15 K；3-5% PEG8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 1 mM EDTA, 300 mM NaCl, 0.1 mM-mercapto-ethanol, and 0.02 % sodium azide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 318.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.234 |
| 1M06 Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, X-Ray Crystallography 提交 2002-06-12 | Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；318.15 K；3-5% PEG8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 1 mM EDTA, 300 mM NaCl, 0.1 mM-mercapto-ethanol, and 0.02 % sodium azide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 318.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.234 |
| 1M06 Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, X-Ray Crystallography 提交 2002-06-12 | Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；318.15 K；3-5% PEG8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 1 mM EDTA, 300 mM NaCl, 0.1 mM-mercapto-ethanol, and 0.02 % sodium azide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 318.15K
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分辨率 3.50 Å R-free 0.234 |
| 1M06 Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, X-Ray Crystallography 提交 2002-06-12 | Assembly 6 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：240-meric（240） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；318.15 K；3-5% PEG8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 1 mM EDTA, 300 mM NaCl, 0.1 mM-mercapto-ethanol, and 0.02 % sodium azide, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 318.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.234 |
| 1M0F Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, Cryo-electron microscopy 提交 2002-06-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 420 PDB 声明：420-MERIC（420） 与蛋白数一致 |
链 F
1–431（431 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 mM Tris and 1 mM EDTA；pH 7.5；10 mM Tris and 1 mM EDTA
|
分辨率 16.00 Å |
| 1M0F Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, Cryo-electron microscopy 提交 2002-06-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
1–431（431 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 mM Tris and 1 mM EDTA；pH 7.5；10 mM Tris and 1 mM EDTA
|
分辨率 16.00 Å |
| 1M0F Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, Cryo-electron microscopy 提交 2002-06-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric（35） 与蛋白数一致 |
链 F
1–431（431 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 mM Tris and 1 mM EDTA；pH 7.5；10 mM Tris and 1 mM EDTA
|
分辨率 16.00 Å |
| 1M0F Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, Cryo-electron microscopy 提交 2002-06-12 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric（42） 与蛋白数一致 |
链 F
1–431（431 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 mM Tris and 1 mM EDTA；pH 7.5；10 mM Tris and 1 mM EDTA
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分辨率 16.00 Å |
| 1M0F Structural Studies of Bacteriophage alpha3 Assembly, Cryo-electron microscopy 提交 2002-06-12 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
1–431（431 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 mM Tris and 1 mM EDTA；pH 7.5；10 mM Tris and 1 mM EDTA
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分辨率 16.00 Å |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：240-MERIC（240） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
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未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 360 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 30 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 36 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |
| 1RB8 The phiX174 DNA binding protein J in two different capsid environments. 提交 2003-11-03 | Assembly 6 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：80-meric（80） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–431（431 aa）
|
未记录 | DC 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 120 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；4-7% PEG 8000, 100 mM sodium citrate pH 5.0, 40% glycerol, 0.02% sodium azide, 0.1% beta-mercapto-ethanol, 0.9M NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.236 |