当前蛋白身份：P09803
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EDH E-CADHERIN DOMAINS 1 AND 2 IN COMPLEX WITH CALCIUM 提交 1996-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
156–380（225 aa）
链 B
156–380（225 aa）
|
突变：INS(MR-D1) 突变：INS(MR-D1) | HG MERCURY (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；1.2 M AMMONIUM SULFATE 0.01 M CALCIUM CHLORIDE 0.1 M TRIS-HCL BUFFER, PH 9.0 0.003 M SODIUM AZIDE
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 1FF5 STRUCTURE OF E-CADHERIN DOUBLE DOMAIN 提交 2000-07-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–374（218 aa）
片段：DOUBLE DOMAIN
链 B
157–374（218 aa）
片段：DOUBLE DOMAIN
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；50 mM ammonium sulfate, 50 mM NaOAc, 30% PEG 8000, pH 8.5, Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.93 Å |
| 1I7W BETA-CATENIN/PHOSPHORYLATED E-CADHERIN COMPLEX 提交 2001-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
734–884（151 aa）
片段：CYTOPLASMIC DOMAIN
链 D
734–884（151 aa）
片段：CYTOPLASMIC DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；polyethylene glycol monomethylether 5000, Tris-HCl, NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 1I7X BETA-CATENIN/E-CADHERIN COMPLEX 提交 2001-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
734–884（151 aa）
片段：CYTOPLASMIC DOMAIN
链 D
734–884（151 aa）
片段：CYTOPLASMIC DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；POLYETHYLENEIMINE TRIS-HCL ISOPROPANOL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.242 |
| 1Q1P E-Cadherin activation 提交 2003-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
158–369（212 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.305 |
| 1Q1P E-Cadherin activation 提交 2003-07-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
158–369（212 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.305 |
| 1SUH AMINO-TERMINAL DOMAIN OF EPITHELIAL CADHERIN IN THE CALCIUM BOUND STATE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-01-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
156–300（145 aa）
片段：AMINO-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1 - 104
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2OMW Crystal structure of InlA S192N Y369S/mEC1 complex 提交 2007-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
158–256（99 aa）
片段：N-terminal domain of murine E-cadherin
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 6000, LiCl, Na-Citrate, pH 5.2, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.207 |
| 2QVF mouse E-cadherin domains 1,2 提交 2007-08-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
157–369（213 aa）
片段：Cadherin 1, Cadherin 2, UNP residues 157-369
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.286 |
| 3IFQ Interction of plakoglobin and beta-catenin with desmosomal cadherins 提交 2009-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
778–884（107 aa）
片段：residues 778-884
链 D
778–884（107 aa）
片段：residues 778-884
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289.5 K；17% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-Cl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.5K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.261 |
| 3IFQ Interction of plakoglobin and beta-catenin with desmosomal cadherins 提交 2009-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
778–884（107 aa）
片段：residues 778-884
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289.5 K；17% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-Cl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.5K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.261 |
| 3IFQ Interction of plakoglobin and beta-catenin with desmosomal cadherins 提交 2009-07-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
778–884（107 aa）
片段：residues 778-884
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289.5 K；17% PEG 3350, 0.1M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-Cl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.5K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.261 |
| 3LNE Crystal structure of E-cadherin EC12 K14E 提交 2010-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
|
突变：K14E | CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH 6.5, 0.75M sodium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 3LNF Crystal structure of E-cadherin EC12 K14EW2A 提交 2010-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
|
突变：K14E,W2A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.2M ammonium sulfate, 0.1M Tris-Cl pH 8.5, 15% (v/v) glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.241 |
| 3LNF Crystal structure of E-cadherin EC12 K14EW2A 提交 2010-02-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
|
突变：K14E,W2A | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.2M ammonium sulfate, 0.1M Tris-Cl pH 8.5, 15% (v/v) glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.241 |
| 3LNG Crystal structure of E-cadherin EC12 AA extension 提交 2010-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
链 B
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；0.1M Tris, pH 8.5, 1.3M ammonium sulfate, 15% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.263 |
| 3LNH Crystal structure of E-cadherin EC12 W2A 提交 2010-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
链 B
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
|
突变：W2A 突变：W2A | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；0.1M Tris, pH 8.5, 1.3M ammonium sulfate, 15% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 3LNI Crystal structure of E-cadherin EC12 E89A 提交 2010-02-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
链 B
157–369（213 aa）
片段：UNP residues 157-369
|
突变：E89A 突变：E89A | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.25M ammonium sulfate, 0.1M MES pH 6.5, 26% PEG 5000 monomethylether, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.228 |
| 3Q2L Mouse E-cadherin EC1-2 V81D mutant 提交 2010-12-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：E-cadherin EC1-2 fragment, residues 157-369
链 B
157–369（213 aa）
片段：E-cadherin EC1-2 fragment, residues 157-369
|
突变：V81D 突变：V81D | CA CALCIUM ION × 8 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；10% (v/v) PEG 400, 0.1M sodium acetate pH4.6, 0.13M CaCl2, Cryoprotected by increasing PEG 400 to 30%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 3Q2N Mouse E-cadherin EC1-2 L175D mutant 提交 2010-12-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：E-cadherin EC1-2 fragment, residues 157-369
链 B
157–369（213 aa）
片段：E-cadherin EC1-2 fragment, residues 157-369
|
突变：L175D 突变：L175D | CA CALCIUM ION × 8 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% (v/v) PEG 400, 0.1M sodium acetate pH4.6, 0.15M CaCl2 and croprotected by increasing PEG 400 to 30%., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.224 |
| 3Q2V Crystal structure of mouse E-cadherin ectodomain 提交 2010-12-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–700（544 aa）
片段：UNP residues 157-700
链 B
157–700（544 aa）
片段：UNP residues 157-700
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 24 MN MANGANESE (II) ION × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；293 K；11% (w/v) PEG 5000 monomethyl ether (MME), 0.1M Bicine pH 8.5, 10mM CaCl2, 30mM MnCl2, 2% (v/v) dioxane, 4% (v/v) 1-butanol
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.293 |
| 3QRB crystal structure of E-cadherin EC1-2 P5A P6A 提交 2011-02-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
157–369（213 aa）
片段：Cadherin 1 and Cadherin 2 Domains, UNP residues 157-369
|
突变：P161A, P162A | CA CALCIUM ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG8000, 10% ethylene glycol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.178 |
| 3QRB crystal structure of E-cadherin EC1-2 P5A P6A 提交 2011-02-17 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
157–369（213 aa）
片段：Cadherin 1 and Cadherin 2 Domains, UNP residues 157-369
|
突变：P161A, P162A | CA CALCIUM ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG8000, 10% ethylene glycol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.178 |
| 4QD2 Molecular basis for disruption of E-cadherin adhesion by botulinum neurotoxin A complex 提交 2014-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
157–369（213 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Tris (pH8.0), 6% PEG8000, 200mM potassium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.247 |
| 4QD2 Molecular basis for disruption of E-cadherin adhesion by botulinum neurotoxin A complex 提交 2014-05-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 J
157–369（213 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100mM Tris (pH8.0), 6% PEG8000, 200mM potassium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.247 |
| 7AR4 Crystal structure of beta-catenin in complex with cyclic peptide inhibitor 提交 2020-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 PaP
783–798（16 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；0.1 M HEPES, 4% PEG6000, 20 mM TRIS, 150 mM NaCl, 0.5 % Glycerol, 2 mM DTT
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |