当前蛋白身份：P0A6N1
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D8T CRYSTAL STRUCTURE OF ELONGATION FACTOR, TU (EF-TU-MGGDP) COMPLEXED WITH GE2270A, A THIAZOLYL PEPTIDE ANTIBIOTIC 提交 1999-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–393（393 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 19 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；TRIS-HCL, MAGNESIUM CHLORIDE, GDP, POLYETHYLENE GLYCOL 3350, AMMONIUM ACETATE, AMMONIUM CITRATE, PH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293.K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.246 |
| 1D8T CRYSTAL STRUCTURE OF ELONGATION FACTOR, TU (EF-TU-MGGDP) COMPLEXED WITH GE2270A, A THIAZOLYL PEPTIDE ANTIBIOTIC 提交 1999-10-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–393（393 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；TRIS-HCL, MAGNESIUM CHLORIDE, GDP, POLYETHYLENE GLYCOL 3350, AMMONIUM ACETATE, AMMONIUM CITRATE, PH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293.K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.246 |
| 1DG1 WHOLE, UNMODIFIED, EF-TU(ELONGATION FACTOR TU). 提交 1999-11-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–394（394 aa）
链 H
1–394（394 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.75；298 K；PEG 3350, ammonium citrate, ammonium acetate, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, temperature 298.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.259 |
| 1EFC INTACT ELONGATION FACTOR FROM E.COLI 提交 1998-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–394（393 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.268 |
| 1EFC INTACT ELONGATION FACTOR FROM E.COLI 提交 1998-11-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–394（393 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.268 |
| 1EFU ELONGATION FACTOR COMPLEX EF-TU/EF-TS FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1996-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
9–393（385 aa）
链 C
9–393（385 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；pH 7.7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.283 |
| 1ETU STRUCTURAL DETAILS OF THE BINDING OF GUANOSINE DIPHOSPHATE TO ELONGATION FACTOR TU FROM E. COLI AS STUDIED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1988-01-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–392（392 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 1LS2 Fitting of EF-Tu and tRNA in the Low Resolution Cryo-EM Map of an EF-Tu Ternary Complex (GDP and Kirromycin) Bound to E. coli 70S Ribosome 提交 2002-05-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–393（393 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
Hepes-KOH buffer at pH 7.5；pH 7.5；Hepes-KOH buffer at pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane
|
分辨率 16.80 Å |
| 1QZD EF-Tu.kirromycin coordinates fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome 提交 2003-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–393（393 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
Polymix buffer；pH 7.5；Polymix buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Rapid-freezing in liquid ethane
|
分辨率 10.00 Å |
| 2BVN E. coli EF-Tu:GDPNP in complex with the antibiotic enacyloxin IIa 提交 2005-06-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–393（393 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ENX ENACYLOXIN IIA × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；292 K；2 MICROL PROTEIN SOLUTION MIXED WITH 1 MICROL RESERVOIR SOLUTION (450 MM NACL. 22% PEG6000, 6% GLYCEROL, 7 MM MGCL2, 100 MM TRIS-HCL PH 7.5), SITTING DROP 19 DEG. C
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.271 |
| 2BVN E. coli EF-Tu:GDPNP in complex with the antibiotic enacyloxin IIa 提交 2005-06-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–393（393 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ENX ENACYLOXIN IIA × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；292 K；2 MICROL PROTEIN SOLUTION MIXED WITH 1 MICROL RESERVOIR SOLUTION (450 MM NACL. 22% PEG6000, 6% GLYCEROL, 7 MM MGCL2, 100 MM TRIS-HCL PH 7.5), SITTING DROP 19 DEG. C
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.271 |
| 2HCJ Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline 提交 2006-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 B
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 3 TAC TETRACYCLINE × 1 GLV GLYOXYLIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.234 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 B
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TAC TETRACYCLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 D
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TAC TETRACYCLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 F
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TAC TETRACYCLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 H
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TAC TETRACYCLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 J
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TAC TETRACYCLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 L
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TAC TETRACYCLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 B
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
链 C
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 D
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TAC TETRACYCLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 J
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
链 K
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 L
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TAC TETRACYCLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 2HDN Trypsin-modified Elongation Factor Tu in complex with tetracycline at 2.8 Angstrom resolution 提交 2006-06-20 | Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 F
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
链 G
8–44（37 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 8-44
链 H
59–393（335 aa）
片段：EF-Tu fragment, residues 59-393
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 TAC TETRACYCLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；Multiple crystals were used to collect the native and each derivative data set. VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.223 |
| 3EP2 Model of Phe-tRNA(Phe) in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM 提交 2008-09-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 X
2–394（393 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 3EQ3 Model of tRNA(Trp)-EF-Tu in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM 提交 2008-09-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 X
2–394（393 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；HiFi buffer (50 mM Tris-HCl pH 7.5, 70mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 0.5 mM spermidine, 8mM putrescine, 2 mM DTT, 3.5 mM MgCl2)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 9.00 Å |
| 3EQ4 Model of tRNA(Leu)-EF-Tu in the ribosomal pre-accommodated state revealed by cryo-EM 提交 2008-09-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 X
2–394（393 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3；Polymix buffer( 5 mM potassium phosphate (KH2PO4) pH 7.3, 5 mM NH4Cl, 95 mM KCl, 0.5 mM CaCl2, 8 mM putrescine, 1 mM spermidine, 1 mM DTE, 5 mM magnesium acetate)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 12.00 Å |
| 4V69 Ternary complex-bound E.coli 70S ribosome. 提交 2008-12-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 AZ
2–394（393 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Vitrification using FEI Vitrobot; blot 3 seconds before plunging with an offset of -1mm
|
分辨率 6.70 Å |