当前蛋白身份：P0ABZ6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M5Y Crystallographic Structure of SurA, a Molecular Chaperone that Facilitates Outer Membrane Porin Folding 提交 2002-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
21–428（408 aa）
链 B
21–428（408 aa）
链 C
21–428（408 aa）
链 D
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；303 K；0.75M ammonium sulphate, 100mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION,
HANGING DROP at 303K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.283 |
| 2PV1 Crystallographic Structure of SurA first peptidyl-prolyl isomerase domain complexed with peptide WEYIPNV 提交 2007-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
172–274（103 aa）
片段：PpiC 1
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25~28% polyethylene glycol monomethylether 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M MES buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.243 |
| 2PV2 Crystallographic Structure of SurA first peptidyl-prolyl isomerase domain complexed with peptide NFTLKFWDIFRK 提交 2007-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
172–274（103 aa）
片段：PPIC 1
链 B
172–274（103 aa）
片段：PPIC 1
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；24% ployethylene glycol 8000, 0.1 M imdidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.227 |
| 2PV2 Crystallographic Structure of SurA first peptidyl-prolyl isomerase domain complexed with peptide NFTLKFWDIFRK 提交 2007-05-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
172–274（103 aa）
片段：PPIC 1
链 D
172–274（103 aa）
片段：PPIC 1
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；24% ployethylene glycol 8000, 0.1 M imdidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.227 |
| 2PV3 Crystallographic Structure of SurA fragment lacking the second peptidyl-prolyl isomerase domain complexed with peptide NFTLKFWDIFRK 提交 2007-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 未唯一映射
参考区间未声明
片段：Survivial protein A fragment from which the second peptidyl-prolyl isomerase domain has been deleted
链 A
21–281（261 aa）
片段：Survivial protein A fragment from which the second peptidyl-prolyl isomerase domain has been deleted
链 A
391–428（38 aa）
片段：Survivial protein A fragment from which the second peptidyl-prolyl isomerase domain has been deleted
链 B
21–281（261 aa）
片段：Survivial protein A fragment from which the second peptidyl-prolyl isomerase domain has been deleted
链 B
391–428（38 aa）
片段：Survivial protein A fragment from which the second peptidyl-prolyl isomerase domain has been deleted
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；1.4~1.8M sodium chloride, 0.1M potassium dihydrogen phosphate, 0.1 M sodium dihydrogen phosphate, 0.1M MES buffer, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.39 Å R-free 0.299 |
| 8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
20–428（409 aa）
|
突变：K27C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
突变：K27C | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
突变：K27C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
21–428（408 aa）
|
突变：S1299C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
突变：K27C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.20 Å |
| 8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric（7） 待复核 |
链 F
21–428（408 aa）
|
突变：K27C,R170C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.30 Å |
| 9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å |
| 9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
21–428（408 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |