当前蛋白身份：P0ADC3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5NAA Lipoprotein-releasing system transmembrane protein LolC 提交 2017-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
48–266（219 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 30% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.225 |
| 5NAA Lipoprotein-releasing system transmembrane protein LolC 提交 2017-02-27 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
48–266（219 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 30% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.225 |
| 6F3Z Complex of E. coli LolA and periplasmic domain of LolC 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
48–266（219 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；45% w/v Poly(acrylic acid sodium salt) 2100, 100 mM HEPES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 6F3Z Complex of E. coli LolA and periplasmic domain of LolC 提交 2017-11-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
48–266（219 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；45% w/v Poly(acrylic acid sodium salt) 2100, 100 mM HEPES pH 6.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 6F49 Periplasmic domain of LolC lacking the Hook. 提交 2017-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
48–179（132 aa）
链 A
180–266（87 aa）
|
突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A 突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.15 M sodium acetate pH 4.6, 30% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.233 |
| 6F49 Periplasmic domain of LolC lacking the Hook. 提交 2017-11-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
48–179（132 aa）
链 B
180–266（87 aa）
|
突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A 突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A | GOL GLYCEROL × 3 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.15 M sodium acetate pH 4.6, 30% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.233 |
| 6F49 Periplasmic domain of LolC lacking the Hook. 提交 2017-11-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
48–179（132 aa）
链 C
180–266（87 aa）
|
突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A 突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A | GOL GLYCEROL × 3 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.15 M sodium acetate pH 4.6, 30% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.233 |
| 6F49 Periplasmic domain of LolC lacking the Hook. 提交 2017-11-29 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
48–179（132 aa）
链 D
180–266（87 aa）
|
突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A 突变：delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A,delta[169-179], P167G, S168A | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288.15 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.15 M sodium acetate pH 4.6, 30% w/v PEG 2000 MME
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.233 |
| 7MDX LolCDE nucleotide-free 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
2–394（393 aa）
|
未记录 | F15 PENTADECANOIC ACID × 1 ZM5 (2R)-2-(tridecanoyloxy)propyl hexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7V8I LolCD(E171Q)E with bound AMPPNP in nanodiscs 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.60 Å |
| 7V8L LolCDE with bound RcsF in nanodiscs 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PCJ (2R)-3-{[(2S)-3-HYDROXY-2-(PALMITOYLAMINO)PROPYL]THIO}PROPANE-1,2-DIYL DIHEXADECANOATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.50 Å |
| 7V8M LolCDE-apo in nanodiscs 提交 2021-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.20 Å |
| 9GRC Cryo-EM structure of lipoprotein-bound LolCDE in nanodiscs 提交 2024-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9GVK Cryo-EM structure of endogenous ATP-bound LolCDE with LolD-E171Q mutations in nanodiscs 提交 2024-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9RLC LolCDE complex with Lpp lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9RLD LolCDE complex with Lpp lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9RLE LolCDE complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9RLF LolCDE complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 9RLG LolCDE complex with LolB lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9RLH LolCDE complex with del 9-15 LolB lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.19 Å |
| 9RLI LolCDEdelta(235-252) complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.63 Å |
| 9RLJ LolCDE with bound ATPgammaS 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9RLK LolCDE(delta 235-252) complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 9XRO LolCDE in complex with SMT-738_3 提交 2025-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–399（399 aa）
|
未记录 | A1ER4 2-azanyl-1-[6-[2-azanyl-5-(3-methylpyridin-4-yl)-1H-imidazol-4-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-4-yl]-2-methyl-propan-1-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |