当前蛋白身份:P0DP25 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7BYL Cryo-EM structure of human KCNQ4 提交 2020-04-23 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7BYM Cryo-EM structure of human KCNQ4 with retigabine 提交 2020-04-23 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7BYN Cryo-EM structure of human KCNQ4 with linopirdine 提交 2020-04-23 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 4 K POTASSIUM ION × 3 FCC 1-phenyl-3,3-bis(pyridin-4-ylmethyl)indol-2-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7CR3 human KCNQ2-CaM in apo state 提交 2020-08-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7CR4 human KCNQ2-CaM in complex with ztz240 提交 2020-08-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 G 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 GB9 N-(6-chloranylpyridin-3-yl)-4-fluoranyl-benzamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CR7 human KCNQ2-CaM in complex with retigabine 提交 2020-08-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 FBX ethyl N-[2-azanyl-4-[(4-fluorophenyl)methylamino]phenyl]carbamate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7VNP Structure of human KCNQ4-ML213 complex with PIP2 提交 2021-10-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 8 K POTASSIUM ION × 4 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7VNQ Structure of human KCNQ4-ML213 complex in nanodisc 提交 2021-10-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
7VNR Structure of human KCNQ4-ML213 complex in digitonin 提交 2021-10-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 7YV (1S,2S,4R)-N-(2,4,6-trimethylphenyl)bicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxamid × 4 K POTASSIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7XNI human KCNQ1-CaM in apo state 提交 2022-04-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7XNK human KCNQ1-CaM in complex with ML277 提交 2022-04-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7XNL human KCNQ1-CaM-ML277-PIP2 complex in state A 提交 2022-04-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XNN human KCNQ1-CaM-ML277-PIP2 complex in state B 提交 2022-04-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–149(149 aa)
链 D 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 K POTASSIUM ION × 4 I0S (2R)-N-[4-(4-methoxyphenyl)-1,3-thiazol-2-yl]-1-(4-methylbenzene-1-sulfonyl)piperidine-2-carboxamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8BD2 Calcium-bound Calmodulin variant G113R 提交 2022-10-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–149(148 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.69;298.1 K;离子强度(mmCIF原始值)127;压力 1
NMR样品组成 100 mM potassium chloride, 5 mM calcium chloride, 2 mM sodium azide, 20 mM HEPES, 0.1 mM 2,2,3,3-tetradeutero TSP-d4, 1 mM (Ser81-Lys148-U-15N,13C) Calmodulin G113R, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
8Z5M human phosphorylase kinase alpha/gamma/delta subcomplex - inactive state 提交 2024-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8Z5P human phosphorylase kinase - inactive state 提交 2024-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 D 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8Z5Q human phosphorylase kinase - inactive state 提交 2024-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 D 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
链 L 1–149(149 aa)
链 P 1–149(149 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
8Z5R human phosphorylase kinase alpha/gamma/delta subcomplex - phosphorylation and Ca2+ bound state 提交 2024-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 1–149(149 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8Z5T human phosphorylase kinase - phosphorylation and Ca2+ bound state 提交 2024-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 D 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
链 L 1–149(149 aa)
链 P 1–149(149 aa)
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9IXY Human KCNQ2-CaM-Ebio2 Complex in the Presence of PIP2 提交 2024-07-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 G 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 A1L3C ~{N}-[7-[bis(fluoranyl)methoxy]-1-prop-2-ynyl-indazol-3-yl]-3,3-dimethyl-butanamide × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9LIZ Human KCNQ5-CaM in complex with PIP2 提交 2025-01-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9LJ1 Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in a closed conformation. 提交 2025-01-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9LJ5 Human KCNQ5-CaM-PIP2-HN37 complex in an open conformation. 提交 2025-01-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 1–149(149 aa)
链 E 1–149(149 aa)
链 F 1–149(149 aa)
链 H 1–149(149 aa)
未记录 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 8 9MF methyl N-[4-[(4-fluorophenyl)methyl-prop-2-ynyl-amino]-2,6-dimethyl-phenyl]carbamate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å