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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：P0DPB6 重新检索
36PDB条目
36Biological assembly
36链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致
链 G 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric（16） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 L 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 L 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 L 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 L 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致
链 L 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致
链 K 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。