当前蛋白身份：P0DTC3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6XDC Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 ORF3a 提交 2020-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–275（275 aa）
链 B
1–275（275 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 blot force, 5 second wait time, 3 second blot time
|
分辨率 2.90 Å |
| 7KJR Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 ORF3a 提交 2020-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–275（275 aa）
链 B
1–275（275 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 blot force
5 second wait time
3 second blot time
|
分辨率 2.08 Å |
| 8EQJ Structure of SARS-CoV-2 Orf3a in late endosome/lysosome-like membrane environment, MSP1D1 nanodisc 提交 2022-10-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–275（275 aa）
链 B
1–275（275 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8EQT Structure of SARS-CoV-2 Orf3a in plasma membrane-like environment, MSP1D1 nanodisc 提交 2022-10-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–275（275 aa）
链 B
1–275（275 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8EQU Structure of SARS-CoV-2 Orf3a in late endosome/lysosome-like environment, Saposin A nanodisc 提交 2022-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–275（275 aa）
链 B
1–275（275 aa）
|
未记录 | PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8T5P SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF3 TRAF domain 提交 2023-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
36–40（5 aa）
片段：UNP residues 36-40
链 H
36–40（5 aa）
片段：UNP residues 36-40
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；13% PEG3350, 0.1 M Tris, pH 8.0, 0.25 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 8T5P SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF3 TRAF domain 提交 2023-06-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
36–40（5 aa）
片段：UNP residues 36-40
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；13% PEG3350, 0.1 M Tris, pH 8.0, 0.25 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 8T5Q SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF2 TRAF domain 提交 2023-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
36–40（5 aa）
片段：UNP residues 36-40
链 H
36–40（5 aa）
片段：UNP residues 36-40
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.0, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 8T5Q SARS-CoV-2 ORF3a peptide in complex with TRAF2 TRAF domain 提交 2023-06-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
36–40（5 aa）
片段：UNP residues 36-40
|
未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277.15 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.0, 20% w/v PEG8000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 9RU5 Cryo-EM structure of TCRpub/pMHC 提交 2025-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 P
207–215（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30 mM HEPES pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |