当前蛋白身份：P11387
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A35 HUMAN TOPOISOMERASE I/DNA COMPLEX 提交 1998-01-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
175–765（591 aa）
片段：CORE DOMAIN AND C-TERMINAL DOMAIN
|
突变：Y723F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；295 K；pH 7.70, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.00K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.308 |
| 1A36 TOPOISOMERASE I/DNA COMPLEX 提交 1998-01-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
片段：CORE DOMAIN AND C-TERMINAL DOMAIN
|
突变：Y723F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；pH 7.70
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.312 |
| 1EJ9 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TOPOISOMERASE I DNA COMPLEX 提交 2000-03-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
203–765（563 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 203-765
|
突变：Y723F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；295 K；27% PEG 400, 145 mM MgCl2, 20 mM MES pH 6.8, 5 mM Tris pH 8.0, 30 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 1K4S HUMAN DNA TOPOISOMERASE I IN COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX 提交 2001-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
片段：Core Domain and C-Terminal Domain, Residues 174-765
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；PEG 8000, Tris-HCl, Na/K Phosphate, KCl, DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.222 |
| 1K4T HUMAN DNA TOPOISOMERASE I (70 KDA) IN COMPLEX WITH THE POISON TOPOTECAN AND COVALENT COMPLEX WITH A 22 BASE PAIR DNA DUPLEX 提交 2001-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
片段：Core Domain and C-Terminal Domain, Residues 174-765
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TTG 2-(1-DIMETHYLAMINOMETHYL-2-HYDROXY-8-HYDROXYMETHYL-9-OXO-9,11-DIHYDRO-INDOLIZINO[1,2-B]QUINOLIN-7-YL)-2-HYDROXY-BUTYRIC ACID × 1 TTC (S)-10-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-4-ETHYL-4,9-DIHYDROXY-1H-PYRANO[3',4':6,7]INOLIZINO[1,2-B]-QUINOLINE-3,14(4H,12H)-DIONE × 1 HG MERCURY (II) ION × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 8000, Ammonium Sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.269 |
| 1LPQ Human DNA Topoisomerase I (70 Kda) In Non-Covalent Complex With A 22 Base Pair DNA Duplex Containing an 8-oxoG Lesion 提交 2002-05-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
202–765（564 aa）
|
突变：Y723F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；Tris-HCl, MES, PEG 400, Magnesium chloride, dithiothreitol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.298 |
| 1NH3 Human Topoisomerase I Ara-C Complex 提交 2002-12-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：Core Subdomain, C-Terminal Domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.7；276 K；Tris, Magnesium Chloride, PEG 400, DTT, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 276K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.311 |
| 1R49 Human topoisomerase I (Topo70) double mutant K532R/Y723F 提交 2003-10-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
片段：Topo70
|
突变：K532R, Y723F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；PEG 3350 MME, Magnesium chloride, MES, TCEP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.13 Å R-free 0.339 |
| 1RR8 Structural Mechanisms of Camptothecin Resistance by Mutations in Human Topoisomerase I 提交 2003-12-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 C
203–765（563 aa）
|
突变：F361S,Q634R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TTG 2-(1-DIMETHYLAMINOMETHYL-2-HYDROXY-8-HYDROXYMETHYL-9-OXO-9,11-DIHYDRO-INDOLIZINO[1,2-B]QUINOLIN-7-YL)-2-HYDROXY-BUTYRIC ACID × 1 TTC (S)-10-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-4-ETHYL-4,9-DIHYDROXY-1H-PYRANO[3',4':6,7]INOLIZINO[1,2-B]-QUINOLINE-3,14(4H,12H)-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG 8000, 200mM Lithium Sulfate, 100mM Mes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.294 |
| 1RRJ Structural Mechanisms of Camptothecin Resistance by Mutations in Human Topoisomerase I 提交 2003-12-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
201–765（565 aa）
|
突变：Asn722Ser 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TTG 2-(1-DIMETHYLAMINOMETHYL-2-HYDROXY-8-HYDROXYMETHYL-9-OXO-9,11-DIHYDRO-INDOLIZINO[1,2-B]QUINOLIN-7-YL)-2-HYDROXY-BUTYRIC ACID × 1 TTC (S)-10-[(DIMETHYLAMINO)METHYL]-4-ETHYL-4,9-DIHYDROXY-1H-PYRANO[3',4':6,7]INOLIZINO[1,2-B]-QUINOLINE-3,14(4H,12H)-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；PEG8000, 200mM lithium sulfate, 100mM Mes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.278 |
| 1SC7 Human DNA Topoisomerase I (70 Kda) In Complex With The Indenoisoquinoline MJ-II-38 and Covalent Complex With A 22 Base Pair DNA Duplex 提交 2004-02-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | M38 4-(5,11-DIOXO-5H-INDENO[1,2-C]ISOQUINOLIN-6(11H)-YL)BUTANOATE × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；289 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MES, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.285 |
| 1SEU Human DNA Topoisomerase I (70 Kda) In Complex With The Indolocarbazole SA315F and Covalent Complex With A 22 Base Pair DNA Duplex 提交 2004-02-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
|
突变：Asn722Ser 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SA3 2,10-DIHYDROXY-12-(BETA-D-GLUCOPYRANOSYL)-6,7,12,13-TETRAHYDROINDOLO[2,3-A]PYRROLO[3,4-C]CARBAZOLE-5,7-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；289 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MES, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |
| 1T8I Human DNA Topoisomerase I (70 Kda) In Complex With The Poison Camptothecin and Covalent Complex With A 22 Base Pair DNA Duplex 提交 2004-05-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EHD 4-ETHYL-4-HYDROXY-1,12-DIHYDRO-4H-2-OXA-6,12A-DIAZA-DIBENZO[B,H]FLUORENE-3,13-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；289 K；PEG 8000, ammonium sulfate, MES, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 1TL8 Human DNA topoisomerase I (70 kDa) in complex with the indenoisoquinoline AI-III-52 and covalent complex with a 22 base pair DNA duplex 提交 2004-06-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
174–765（592 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | AI3 2,3-DIMETHOXY-12H-[1,3]DIOXOLO[5,6]INDENO[1,2-C]ISOQUINOLIN-6-IUM × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；289 K；PEG 8000, MES, Ammonium Sulfate, pH 6.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.305 |