当前蛋白身份：P13671
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3T5O Crystal Structure of human Complement Component C6 提交 2011-07-27 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–934（913 aa）
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未记录 | CD CADMIUM ION × 1 FUL beta-L-fucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；284 K；5 mM MES, 89 mM Sodium Chloride, 0.01 mM Cadmium Chloride, pH 5.8, EVAPORATION, temperature 284K
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分辨率 2.87 Å R-free 0.276 |
| 4A5W Crystal structure of C5b6 提交 2011-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
22–934（913 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；167 MM HEPES-NAOH PH7.8
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分辨率 3.50 Å R-free 0.270 |
| 4E0S Crystal Structure of C5b-6 提交 2012-03-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
22–934（913 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；298 K；0.08M lithium chloride, 0.01M imidazole-HCl, pH 7.6, SMALL TUBES, temperature 298K
|
分辨率 4.21 Å R-free 0.278 |
| 6H03 OPEN CONFORMATION OF THE MEMBRANE ATTACK COMPLEX 提交 2018-07-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 B
22–934（913 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.60 Å |
| 6H04 Closed conformation of the Membrane Attack Complex 提交 2018-07-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 B
22–934（913 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.60 Å |
| 7NYC cryoEM structure of 3C9-sMAC 提交 2021-03-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 B
22–934（913 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 7 CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.54 Å |
| 7NYD cryoEM structure of 2C9-sMAC 提交 2021-03-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
22–934（913 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 7Q6C complement C6 FIM1-2 bound to CP010 antibody 提交 2021-11-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
769–934（166 aa）
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未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.4；291 K；112 mM calcium acetate, 56 mM sodium cacodylate pH 6.4, 8.5% PEG8000 and 16% glycerol
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分辨率 2.29 Å R-free 0.233 |
| 8B0F CryoEM structure of C5b8-CD59 提交 2022-09-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
1–934（934 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |
| 8B0G 2C9, C5b9-CD59 structure 提交 2022-09-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 B
1–934（934 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |
| 8B0H 2C9, C5b9-CD59 cryoEM structure 提交 2022-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 B
1–934（934 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 120 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |