当前蛋白身份：P19525
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1QU6 STRUCTURE OF THE DOUBLE-STRANDED RNA-BINDING DOMAIN OF THE PROTEIN KINASE PKR REVEALS THE MOLECULAR BASIS OF ITS DSRNA-MEDIATED ACTIVATION 提交 1999-07-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–170（170 aa）
片段：DSRNA-BINDING N-TERMINAL DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K
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分辨率未提供 |
| 2A19 PKR kinase domain- eIF2alpha- AMP-PNP complex. 提交 2005-06-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
258–551（294 aa）
片段：PKR kinase domain
链 C
258–551（294 aa）
片段：PKR kinase domain
|
突变：DEL(338-350) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：DEL(338-350) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.286 |
| 2A1A PKR kinase domain-eIF2alpha Complex 提交 2005-06-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
258–551（294 aa）
|
突变：residue 3-175 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8
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分辨率 2.80 Å R-free 0.268 |
| 3UIU Crystal structure of Apo-PKR kinase domain 提交 2011-11-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
254–551（298 aa）
片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 254-551
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 3350, 0.2M NaF, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.305 |
| 3UIU Crystal structure of Apo-PKR kinase domain 提交 2011-11-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
254–551（298 aa）
片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 254-551
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG 3350, 0.2M NaF, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.305 |
| 6D3K Crystal structure of unphosphorylated human PKR kinase domain in complex with ADP 提交 2018-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
229–551（323 aa）
片段：kinase domain (229-551)
链 B
229–551（323 aa）
片段：kinase domain (229-551)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 6% v/v PEG400, 2.0 M ammonium sulfate, protein was complexed with AMP-PNP and Mg2+ prior to crystallization
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 6D3K Crystal structure of unphosphorylated human PKR kinase domain in complex with ADP 提交 2018-04-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
229–551（323 aa）
片段：kinase domain (229-551)
链 C
229–551（323 aa）
片段：kinase domain (229-551)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 6% v/v PEG400, 2.0 M ammonium sulfate, protein was complexed with AMP-PNP and Mg2+ prior to crystallization
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 6D3L Crystal structure of unphosphorylated human PKR 提交 2018-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
229–551（323 aa）
片段：kinase domain (229-551)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 2.0 M ammonium sulfate, 1:3 molar ratio of dp8 (heparin) was added to protein prior to crystallization
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.347 |
| 6D3L Crystal structure of unphosphorylated human PKR 提交 2018-04-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
229–551（323 aa）
片段：kinase domain (229-551)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 2.0 M ammonium sulfate, 1:3 molar ratio of dp8 (heparin) was added to protein prior to crystallization
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.347 |
| 6NPY Cryo-EM structure of NLRP3 bound to NEK7 提交 2019-01-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
260–266（7 aa）
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突变：L54R,V58K,P59T,K87A,A99V,S100C,E103T,D104G | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 7OBK Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with PKR phosphopeptide 提交 2021-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
541–551（11 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 25%PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.183 |
| 7OBL Crystal structure of 14-3-3 sigma in complex with PKR phosphopeptide and stabilizer Fusicoccin-A 提交 2021-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
541–551（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FSC FUSICOCCIN × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.095 M Hepes pH7.3, 25%PEG 400, 0.19 M CaCl2 and 5 % Glycerol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 8BI7 Binary structure of 14-3-3s and PKR phosphopeptide 提交 2022-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
541–551（11 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M Hepes pH 7.1, 0.19 M CaCl2, 25% PEG400, 5% glycerol
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.188 |
| 8I9J The PKR and E3L complex 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–170（170 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 6.39 Å |
| 8IZN Structural study of Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase (PKR) and Non-structural protein 1 (NS1) complex 提交 2023-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–170（170 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 6.67 Å |
| 8QEL PKR kinase domain- eIF2alpha in complex with compound 提交 2023-08-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
258–337（80 aa）
链 B
357–541（185 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | UH3 (3~{Z})-3-[(4-methyl-1~{H}-imidazol-5-yl)methylidene]-2-oxidanylidene-1~{H}-indole-5-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MOPS pH 7.5, 10% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.278 |