当前蛋白身份:P19878 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1E96 Structure of the Rac/p67phox complex 提交 2000-10-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–203(203 aa) 片段:YES
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 10.5;0.1 M CAPS PH 10.5, 0.2 M LI ACETATE, 0.8 M NAH2PO4, 1.2 M K2HPO4
分辨率 2.40 Å R-free 0.284
1HH8 The active N-terminal region of p67phox: Structure at 1.8 Angstrom resolution and biochemical characterizations of the A128V mutant implicated in chronic granulomatous disease 提交 2000-12-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–213(213 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-213
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5;100 MM NA CITRATE PH 4.5, 17% PEG 2K MME, 10% GLYCEROL
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
1K4U Solution structure of the C-terminal SH3 domain of p67phox complexed with the C-terminal tail region of p47phox 提交 2001-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 S 455–516(62 aa) 片段:C-TERMINAL SH3 DOMAIN (RESIDUES 455-516)
突变:C499S/C514S 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.1;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM KCl;压力 1
NMR样品组成 0.7mM p67SH3(C) U-15N,13C; 0.77mM p47 tail peptide; 5mM MOPSO buffer; 30 mM d10-DTT; 100mM KCl | 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O
NMR样品组成 0.5mM p47 tail peptide U-15N,13C; 0.55mM p67SH3(C); 5mM MOPSO buffer; 30mM d10-DTT; 100mM KCl | 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O
分辨率未提供
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 352–429(78 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 352–429(78 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 352–429(78 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1OEY Heterodimer of p40phox and p67phox PB1 domains from human NADPH oxidase 提交 2003-04-02 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 352–429(78 aa) 片段:PB1 DOMAIN, RESIDUES 352-429
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;18% PEG 3350, 17% PEG 400, 4.8% ISOPROPYL ALCOHOL, 0.1 M CAPSO PH 9.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1WM5 Crystal structure of the N-terminal TPR domain (1-203) of p67phox 提交 2004-07-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–203(203 aa) 片段:TPR domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.9;277 K;ammonium sulfate, HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.224
2DMO Refined solution structure of the 1st SH3 domain from human Neutrophil cytosol factor 2 (NCF-2) 提交 2006-04-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 242–297(56 aa) 片段:SH3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.3mM SH3 domain U-15N,13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供